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中华绒螯
蟹
和
三
疣
梭子蟹
的高质量基因组图谱
三疣梭子蟹基因组图谱 唐伯平供图虾蟹类基因组是公认的高复杂基因组,要获得高质量的基因组有着很多困难。近日,由盐城师范学院江苏省盐土生物资源研究重点实验室教授唐伯平课题组牵头的中外合作团队,第一次获得了我国重要淡水和海水经济蟹类中华绒螯蟹和三疣梭子蟹的高质量基因组图谱,并分别在线发表于GigaScience和《遗传学前沿》。三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)是我国沿海大型的海洋经济蟹类,我国每年捕捞量在55万吨左右。唐伯平团队获得的三疣梭子蟹基因组大小为1.00Gb,片段重叠群N50的长度为 4.12Mb,被注释到16796个蛋白编码基因,其基因组的完整性为94.7%,整个基因组的重复序列是54.52%。科研人员鉴定出三疣梭子蟹染色体为50对,装配率为97.80%,Hi-C的N50为21.79Mb。这是一个高质量、相当完整的染色体水平基因组,也是蟹类研究中第一次通过分子生物学的方法精确地对蟹类染色体数目进行鉴定。 三疣梭子蟹 唐伯平供图中华绒螯蟹(Eriocheir japonica sinensis)俗称河蟹,是世界上最重要的淡水经济蟹类,目前我国每年河蟹产量为80万吨左右。研究人员获得的中华绒螯蟹基因组大小为1.27Gb,Contig序列N50为3.19Mb,且其GC含量为43%,高于其他节肢动物。BUSCO评估其完整性为94.00%,重复序列在基因组中占61.42%,被功能注释蛋白编码基因22619个。 中华绒螯蟹 唐伯平供图唐伯平团队对甲壳动物中华绒螯蟹、三疣梭子蟹、凡纳滨对虾,昆虫埃及伊蚊、黑腹果蝇、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7种节肢动物基因家系展开进一步研究发现,它们共有15503个基因家系,其中8832个基因家系为共有家系,328个和544个基因家系分别唯一存在于三疣梭子蟹和中华绒螯蟹中。在这7种节肢动物中,虾蟹相对进化速率最小,其中对虾进化速度最慢,其次是绒螯蟹和梭子蟹。“相对于昆虫,虾蟹类进化较慢,可能是它们生活的环境相对于昆虫更加稳定。”唐伯平说。 虾蟹系统演化关系和相对进化速率图 唐伯平供图另一个有趣的发现是,虾蟹与昆虫的分化以及螃蟹和对虾的分化几乎是同时发生在4.3亿年左右的志留纪。同属于短尾类的中华绒螯蟹和三疣梭子蟹的分化时间则相对较晚,大约是在1.8亿年前的侏罗纪。我国同时获得1种海洋和1种淡水重要经济蟹类高质量的基因组图谱,将为蟹类和甲壳动物的研究提供重要的理论基础和数据支撑,同时也为经济蟹类育种、养殖和疾病防控工作提供重要的基础平台。相关论文信息:https://doi.org/10.1093/gigascience/giz161https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01340
盐城师范学院
2021-04-11
一种新型
蟹
笼
本实用新型公开了一种新型蟹笼,包括笼体框架和设置在所述笼体框架外侧的网衣,所述笼体框架包括上框架和下框架,在位于所述上框架外侧的网衣上开有进蟹口,所述上框架和下框架的内侧分别设置有荧光浮球和永磁条,所述下框架沿直径设置有连杆,所述上框架和下框架之间设置有支撑杆,所述支撑杆的上端与所述上框架活动连接,当所述蟹笼处于打开状态时,所述支撑杆的下端与所述下框架连接,当所述蟹笼处于折叠状态时,所述支撑杆的下端与所述连杆的中心处连接。利用虾蟹类动物的趋光性和趋磁性,提高捕捞效率,同时该蟹笼可以折叠,便于蟹笼的运输和储存,减小占用空间。
青岛农业大学
2021-04-13
第
三
届高校心理健康创新发展论坛在重庆成功召开
11月16日,第62届中国高等教育博览会第三届高校心理健康创新发展论坛在重庆召开。中国高等教育学会副会长姜恩来,中国教育技术协会副会长、秘书长,国家开放大学原党委书记、校长杨志坚出席会议并致辞。会议由中国高等教育培训中心执行主任赵锋主持。
中国高等教育博览会
2024-11-22
RSM-SMS(A)
三
维全场应变测量分析系统
武汉中岩科技股份有限公司
2024-10-29
三
球仪
可演示月球、地球及太阳的相对运动,昼夜形成、日月圆缺、日食和月食等现象
苏州育龙科教设备有限公司
2021-08-23
三
轨竞速
底座尺寸400*300*70mm,模具一体成型,两端呈弧形,上翘47度,两面四角注塑有1.5mm脚垫,长度25*25mm,仪器整体高度220mm,配件有3只直径为18mm的不锈钢实心球用来实验,安装有触发装置方便实验,三条轨道按照不同的弯度制成,探究势能对动能的关系与作用
石家庄市艾迪科教设备有限公司
2021-08-23
三
标尺天平
产品的详细介绍,请直接咨询我们。电话:0574-62080651
宁波浪力仪器有限公司(余姚市朗海科教仪器厂)
2021-08-23
三
球仪
青华科教仪器有限公司
2021-08-23
三
防灯
产品详细介绍
深圳市英唐光显技术有限公司
2021-08-23
三
球仪
产品详细介绍
吉安市卓钢教学仪器有限公司(原吉安市第六教学仪器厂)
2021-08-23
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