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南海红树林微生物中新的活性代谢产物
从南海红树林微生物中分离105种化合物,其中50种新结构, 26种对肿瘤细胞(包括耐药肿瘤细胞 株)有强细胞毒活性(IC50<10μg/mL)的化合物,部分化合物活性达到纳克级,22种有抗菌活性(包括 抗临床耐药性结核菌株),2种有神经原细胞保护活性。
中山大学 2021-04-10
m6A调控肿瘤细胞能量代谢及其编辑工具
m6A修饰参与肿瘤细胞的糖酵解和ATP生成。甲基转移酶METTL3的缺失使得m6A水平下调,并抑制肿瘤细胞的葡萄糖摄入、乳酸产生速率和ATP生成。m6A-seq和功能实验表明,PDK4的表达受m6A调控,且过表达PDK4能逆转METTL3缺失导致的肿瘤细胞糖酵解和ATP生成抑制。进一步研究表明,PDK4 mRNA的5’UTR区而非3’UTR区的m6A修饰,可通过与YTHDF1/eEF-2复合物和IGF2BP3结合,从而正向调节其mRNA的翻译延伸及mRNA稳定性。此外,TATA结合蛋白(TBP)可以通过与METTL3启动子结合增强其转录及在宫颈癌细胞中的表达。体内和临床分析表明,m6A/PDK4在宫颈癌和肝癌组织表达上调,且对其发生发展具有促进作用。本研究利用dCas13b融合去甲基化酶ALKBH5,结合靶向mRNA的gRNA,构建出可在活细胞内靶向mRNA的m6A去甲基化修饰体系dm6ACRISPR。该体系具有特异性强、去甲基化效率高和脱靶率低等特点。研究表明,dm6ACRISPR可实现CYB5A mRNA的单位点及CTNNB1 mRNA的多位点去甲基化,提高靶mRNA稳定性。同时,dm6ACRISPR具有高度错配不耐受的特点,其细胞内脱靶率仅为0.03%。此外,在肿瘤细胞中运用dm6ACRISPR体系靶向促癌基因EGFR和MYC,可显著降低其表达水平,同时明显抑制肿瘤细胞生长,表明dm6ACRISPR在疾病防治上具有潜在价值。
中山大学 2021-04-13
异亮氨酸工业生产菌代谢工程系统改造
本项目首先借助比较蛋白组学研究技术,从细胞内异亮氨酸合成及转运的整体网络入手,揭示其中影响氨基酸胞外积累的若干关键蛋白质,研究氨基酸合成及转运、代谢调控、底物利用、细胞通透等相关蛋白质的作用机制。然后采用系统生物学和代谢工程研究手段,利用启动子改造、基因共表达、酶定向进化等技 术进行系统改造,以显著提高乳糖发酵短杆菌支链氨基酸生产水平。比较蛋白组学分析将为支链氨基酸高产机理研究奠定坚实理论基础,乳糖发酵短杆菌代谢工程系统改造为工业化应用提供有力技术支撑。 关键技术 L-异亮氨酸是人体 8 种必需氨基酸之一,因其具特殊的结构和功能,其用量逐年增长,目前国际上日本生产 L-异亮氨酸且占垄断地位,厂家有味之素、协和发酵和田边制药三家,均已发酵法生产,产率达 30-35 g/L,提取率 60-70%,我国的异亮氨酸研究起步晚,目前分批发酵大罐产酸率为 20-22g/L,总得率为 40- 50%,与日本相比较,我国的 L-异亮氨酸生产水平还很低下,主要是由于生产菌株绝大多数通过诱变选育获得,少数菌株利用基因工程手段改造,但仅局限于少数合成酶基因,这严重制约了支链氨基酸产率的进一步提高。本成果克服了行业内的菌株瓶颈,并优化获得了工业发酵工艺。
江南大学 2021-04-11
γ-氨基丁酸工业生产菌代谢工程系统改造
本项目分别从乳酸菌和大肠杆菌出发,通过基因工程和代谢工程改造菌株,并优化菌株发酵条件和发酵策略,提高了生物合成 GABA 的产量和生产效率, 1 L以玉米芯水解液为碳源的培养基中的培养的 L. buchneri WPZ001 细胞通过静置发酵和静息细胞转化累计可得到 GABA 117 g。主要创新点结论如下:发现 L. buchneri WPZ001 可利用木糖或玉米芯水解液为碳源生长并通过静置发酵高产 GABA;发现 E. coli BL21(DE3)/pET20b-torA-gadB 在信号肽 TorA 引导下可有效分泌表达 GadB 并可用于高效生产 GABA;发现在大肠杆菌中表达 Weimberg 途径可将木糖合成 GABA 的精简为 7 步反应;E. coli JWZ08/pWZt7-g3/pWZt7-xyl 以木糖直接合成 GABA 产量是此前葡萄糖直接合成 GABA 的报道的 3 倍。 
江南大学 2021-04-11
揭示代谢小分子调控蛋白质稳态的功能与机制
该项研究在饶枫课题组之前研究的基础之上,围绕CRL活性调控的系列研究成果。泛素化是一种细胞内的蛋白质“标记”系统,可以给不同的蛋白质打上不同的“标签”,使其更容易被准确识别并进行降解。当泛素化酶错误地“标记”了蛋白质,导致细胞死亡或衰老时,癌细胞就形成了。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用,也参与了几乎一切生命活动的
南方科技大学 2021-04-14
聚 β 羟基丁酸酯与异亮氨酸联产菌代谢工程改造
本研究构建一种谷氨酸棒杆菌基因工程菌,使其同时发酵生产两种产品:聚羟基脂肪酸酯和异亮氨酸;前者是胞内产品,后者是胞外产品。该基因工程菌可以降低生产成本,具有工业应用前景。研究结果显示:将 phaCAB 基因簇导入 WM001后,WM001/pDXW-8-phaCAB 96h 产量为 9.58 g/L,而 WM001/pDXW-8 96h 产量为6.65 g/L,产率提高 65%达到 0.15g 异亮氨酸/g 葡萄糖。PHA 产量达到 28.7%(w/w)。关键技术 聚羟基脂肪酸酯(PHAs)是部分微生物生存在具有较高碳源与氮源的条件下,生成的一类微生物自身碳源、能源储备物的胞内聚酯。根据相关报道,将 PHB 合成代谢基因簇导入细胞内,可实现 PHB 与某些代谢产物的联产和增产,提高底物的利用率。L-异亮氨酸是一种人体必需氨基酸,因其在医药、食品和健康保健领域有广泛的应用,而使其近几年的生产能力发展迅速,目前国际上比较先进的主流生产方式为发酵法生产 L-异亮氨酸。谷氨酸棒杆菌(Corynebacteriumglutamicum)是一种小棒状、革兰氏阳性的食品安全生产菌,目前已经用于工业生产 L-异亮氨酸,本成果构建能高产 PHAs 的 C. glutamicum 菌株,具有工业化应用潜力。 
江南大学 2021-04-11
杜仲新品种选育与次生代谢物深度开发利用
我校在杜仲优良品种选育、次生代谢物合成积累以及深度开发利用关键技术等方面取得系列成果。选育的“秦仲1、2、3、4号”高胶、高药型优良品种,解决了大面积繁殖的技术瓶颈;研制出“杜仲籽剥壳机”,解决了杜仲籽油开发技术瓶颈;确定了杜仲生产中一次投料、连续生产活性物质的高效工艺技术;研发出以杜仲叶、杜仲雄花、杜仲籽为原料的系列产品,获得国家食药监局颁发的批准证书20余个,并全部实现产业化。该成果突破了制约杜仲产业发展的技术瓶颈,产生了显著的经济和社会效益。
西北农林科技大学 2021-05-11
我国科学家揭示压力应激导致焦虑与代谢异常的神经机制
研究发现,长期处于压力应激下的小鼠,出现了焦虑行为,这些小鼠同时出现了摄食减少、能量消耗降低的现象。
科技部生物中心 2022-04-08
微生物细胞代谢流在线检测与 计算分析高级发酵罐
本产品和技术依据细胞代谢流在线检测与计算分析原理,配置上除常规的温度、搅拌转 速、消泡、pH、溶解氧浓度 (DO) 等测量控制以外,还增添了发酵液真实体积、高精度补料量 (如基质、前体、油、酸碱物) 测量与控制,高精度通气流量与罐压电信号测量与控制,并与尾 气CO2和O2分析仪或质谱仪连接。可精确得到发酵过程计算机参数优化与放大所必需的包括 各种代谢流特征或工程特征的间接参数,如摄氧率 (OUR) 、二氧化碳释放率 (CER) 、呼吸商 (RQ) 、体积氧传递系数 (KLa) 、比生长速率 (µ) 等。广泛应用于生物制药 (传统生物制药和现 代基因工程制药) 、食品轻工发酵、农业生物 (微生物饲料、微生物农药、微生物肥料和动物 疫苗) 、新兴生物能源和石化环保等行业工业化工程项目的系统设计和全面技术实施。带动了 多个行业技术进步。
华东理工大学 2021-04-11
在高温热泉极端环境烷烃代谢的微生物进化与起源
滇藏热泉生态系统中蕴含着丰富的微生物资源,包含大量的系统发育位置未知且功能奇特的神秘、新颖的微生物类群。课题组结合宏基因组学测序技术和生物信息学手段从中重构出14个具有甲烷/烷烃代谢能力的微生物基因组(图1),其系统发育多样性极高且独特,广泛分布于韦斯特古菌门、哪吒古菌门(Nezharchaeota)等TACK超级门中。值得一提的是,该课题组首次于奇古菌门(Thaumarchaeota)中发现其具有产甲烷功能。此前,奇古菌门以其好氧氨氧化能力而为众人所熟知,而课题组首次对其厌氧状态下产甲烷能力的发现表明我们目前对此门认知的局限性,神秘的自然界或将远远超出我们的认知。此外,组学技术的发展或将指引我们对其进化历史进行更全面的认知。课题组对这些未知生命的代谢特征进行了揭示,并发现除却传统的氢营养型产甲烷菌外,还有多种氢依赖的甲基营养性产甲烷菌,他们可吸收热泉生态系统中多种甲基底物以完成甲烷的产生(图2)。通过进化基因组分析,课题组还对古菌祖先的进化起源进行了推测,研究发现对于具有产甲烷能力的微生物类群,其甲烷代谢关键基因mcrABG相对较为保守,并无明显的水平基因转移时间发生;而对于烷烃氧化的微生物类群,水平基因转移对其多样性塑造有着深远影响。基于甲烷代谢基因的保守性,课题组对其祖先序列进行了序列重构,从而来推测祖先序列的最适生长温度,结果表明具有mcrABG标记基因的微生物类群或起源于高温生境(图3)。另外,由于 TACK和ASGARD超级门中,以及广古菌门中大部分支系均具有甲烷/烷烃代谢能力,且相应微生物相比其它同支系微生物有着更为悠久的进化历史,因此,课题组猜测地球早期生命中,古菌的祖先或具有甲烷和烷烃代谢能力。
中山大学 2021-04-13
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