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新冠肺炎影像学AI智能辅助诊断研究
“现阶段医生需要在大量影像数据中快速诊断出新冠肺炎的病例,此外还需要诊断出病灶分布的位置、大小等来评估严重程度。”薛向阳介绍,针对临床的现实需求,团队将设计目标定位于“肺炎分类鉴别”和“关键病灶检测”两大功能,前者是为区别健康状态、新冠肺炎、其他病毒性肺炎、细菌性肺炎,后者则为找到并分隔出磨玻璃影等病灶区域。针对这些需求,团队设计诊断算法模型,让机器利用模型进行训练,学习不同类型肺炎在CT影像表现上的不同特征,最终具备智能辅助诊断的能力。而这需要突破小样本学习、小目标检测等多个技术难题。“小样本学习”即在较少训练数据样本的条件下进行机器学习。在疫情发生前期,能够获取的新冠肺炎影像数据相对较少,且由于一线影像医生任务繁重,无法获得大量专家标注,因此需要算法在少量样本的条件下“自学成才”。为此,团队采用基于自迁移学习的半监督学习等技巧,使算法具备一定的“小样本学习”能力,在不增加医生标注工作量的情况下较好地提高了算法模型的普适性。由于CT影像切片中的病灶区域有大有小,且往往大中小病灶区域面积悬殊,如何使算法能同时检测大、中、小各个目标是另一大难题。团队利用神经网络的层次性特点与病灶区域的大小进行对应,“网络的底层关注细节,即小病灶区域,而网络中层到高层所关注的病灶区域则越来越大,因此模型通过不同层次的加权和融合,最终便能达到同时检测大小病灶区域的目标。”薛向阳解释道。“不过,即便有诊断‘神器’,影像科医生也是不可替代的。”薛向阳说,人是复杂的机体,病毒在不同人体内感染的反映也不一定相同。”他表示,当遇到机器未曾学习过的微小病变或疑难病例时,仍需要影像医生的经验和智慧。以解决实际问题为目标,该项目在研究过程中始终与临床应用紧密结合。无论是机器学习数据,还是测试评估数据,都来源于临床真实病例。在算法模型定型过程中,为了检验模型的准确率和泛化性,团队也利用现实疑似病例进行了测试。
复旦大学 2021-04-10
应用组培技术快速繁殖观赏水草
高档观赏水草的国内市场一直依靠进口,品种价格高、种苗稀缺,具有很大的潜在市场。组培快繁高档观赏水草可为市场提供大量的优质种苗,促进观赏水草栽培业的发展,具有一定的经济意义。/line观赏水草属水生植物,品种繁多,可应用于水族箱培植的品种已有100多种。观赏水草主要分为有茎水草、丛生水草、淑草类水草、榕类水草和皇冠草类五种。其中皇冠类品种最具观赏价值,且档次最高。但是多数品种因其雌雄异株且籽株胎生,很难获得正常繁育的种子,常以无性繁殖为主。利用偶尔萌发的新芽繁殖,自然繁殖率很低。/line为解决高档观赏水草的种苗繁殖问题,南开大学生命科学院遗传工程研究室应用植物组织培养法组培快繁皇冠草类品种“红蛋叶”获得成功。这一技术具有培养材料经济、培养条件可以人工控制、生长周期短、繁殖率高、管理方便、利于自动化控制等特点,为高档观赏水草进行工厂化育苗提供了新的途径。/line我校的组培快繁观赏水草“红蛋叶”技术2001年已申请专利,现已可直接应用于小规模生产,年产试管苗50万株。/line主要设备包括:培养室、无菌室和温室等60~100平方米,超净工作台,灭菌设备,培养器皿,调温设备等。/line投入及效益分析:按年产50万株试管苗、最低售价1元/株计算,年产值50万元,其中:设备投入8万元、占16%,水电费4万元、占8%,药品试剂4万元、占8%,厂房租金1万元、占2%,工资6万元、占12%,管理费用1万元、占2%,毛利润26万元、占52%。/line技术服务:提供“红蛋叶”组培快繁全套技术及操作工艺,提供厂房设计和设备配置简图,提供“红蛋叶”试管苗扩繁用的中间材料,提供1~2人的技术培训,协助论证考察、建厂,现场技术指导。
南开大学 2021-04-10
糖代谢标记中的副反应
在利用叠氮非天然糖 Ac4ManNAz 对细胞进行唾液酸化标记时,质谱数据中出现了胞质蛋白。而正常情况下,胞质蛋白是不具有唾液酸修饰的。为了解释这一现象,利用基于位点的化学蛋白质学技术手段鉴定到这些蛋白中的半胱氨酸残基被非天然糖所修饰,并且产生了带有不同乙酰基数目的修饰情况。为了进一步排除这些修饰是通过代谢途径产生的可能性,将全乙酰化的非天然糖直接与细胞裂解液或纯蛋白孵育,也都能发现蛋白质上的半胱氨酸可以被修饰。
北京大学 2021-04-11
新型多功能动物代谢笼
已有样品/n针对传统代谢笼存在饮用水、饲料残渣、尿液和粪便分离效果不理想从而影响测量结果这一缺点,通过观察动物饮食、排泄行为的生理特点,发明了新型粪尿分离装置和收集装置,解决了传统代谢笼在样品收集上的缺陷,显著提高了测量工具精准度和检测结果的精确性,该技术装置操作简便、数据精确,实现体重数据、采食量数据自动采集,使用方便,自动化程度高。该装置自研制出以来,已稳定运行2年,具有完全自主知识产权。该装置已申请国家发明专利(受理中)和实用新型专利(已授权)。
中国科学院大学 2021-01-12
生科院钟伯坚研究组揭示南极嗜冷绿藻基因组水平适应极端环境的分子机制
我校生命科学学院钟伯坚教授研究组联合自然资源部第一海洋研究所等科研单位,对南极海冰生态系统特有的南极衣藻进行了基因组适应性进化研究,为理解南极植物适应极端环境的分子机制提供崭新的思路。 该研究利用三代PacBio测序、二代Illumina测序、10× Genomics和高通量染色体构象捕获技术(Hi-C)获得了南极衣藻高质量的全基因组序列,其基因组总长度为541.86Mb(Scaffold N50达到19.23Mb)。南极衣藻基因组是目前已知最大的绿藻基因组,其基因数目也是绿藻基因组中最多的,共编码19870个基因。基因组结构分析发现重复序列占其基因组序列的63.78%,重复序列含量为已发表绿藻基因组中最高。转座元件(TE)是基因组重复序列的主要组成部分,占整个基因组序列的40.67%。分析表明南极衣藻的反转录转座子发生了明显的扩张,是造成其基因组增大的主要原因。 本研究估算了南极衣藻的分化时间大约为34个百万年,与德雷克海峡开放导致南极极端低温形成的时期一致,推测南极衣藻的起源与南极极端低温的形成有关。研究发现南极衣藻通过水平基因转移的方式获得了冰结合蛋白,该蛋白可以与小的冰晶结合,具有抑制冰结晶和生长的功能。通过进一步的功能实验证实了南极衣藻中的冰结合蛋白具有提高生物抗冻能力的作用。因此,推测冰结合蛋白的获得对南极衣藻避免冰冻损伤和适应海冰中极端低温的环境十分重要。
南京师范大学 2021-02-01
音叉组
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芜湖震洋教仪磁电科技有限公司 2021-08-23
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安徽省芜湖县易太科教仪器厂 2021-08-23
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安徽省芜湖县易太科教仪器厂 2021-08-23
单摆组
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重庆市育才教学仪器厂 2021-08-23
苏友强组在卵子质量研究领域又取得新突破
卵子就好比一粒种子,其质量好坏直接决定着女性的生殖结局,卵子质量低下是导致女性不孕、出生缺陷以及许多成年疾病的重要原因。因此,产生一枚优质的卵母细胞就成为优生优育以及“试管婴儿”助孕的关键。然而,决定卵子好坏的分子机制还一直是一个尚未完全解开的谜,也是全球生殖生物学/医学领域研究的热点。 与其伴侣—小小的精子不同,卵子在其前体细胞—卵母细胞生长发育过程中积累了大量被称为“母源因子”的物质供其在成熟及受精之后的早期胚胎发育过程中所利用,其中包括许多用来转变为功能蛋白的信使核糖核酸(mRNA)。虽然过去生殖科学家们已经知道许多这样的mRNA在卵子里面储存着并且肯定是经过精挑细选与精雕细琢之后所保留下来的,但是,是谁在执行这一精细的工作还不很清楚。 我室苏友强组在继2012年首次发现并命名了能够同时调控哺乳动物卵母细胞成熟及遗传信息稳定传递的全新基因—MARF1(2012 Science; PNAS)后,经过6年的努力,与复旦大学麻锦彪教授合作,解析了小鼠MARF1蛋白关键结构域的晶体结构,并首次揭示了其作为核酸酶在成熟之前的卵母细胞内行使着雕刻艺术家的责任—特异降解冗余的核酸打造完美无暇的母源mRNA库,为产生一枚优质的卵子而默默奉献!该发现于10月18日在美国科学院院报(PNAS)正式在线刊登。
南京医科大学 2021-04-28
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