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基于新一代测序的生物信息云平台及其在科研和医疗健康领域的应用
1 项目简介本项目建立的生物云平台,以基于 Web 的方式提供服务,用户可以轻松快速获取服务,国内外普遍缺乏成熟的技术,标准和平台。我们首次把独具特色的机器学习模型预测算法与最新的高通量测序方法( non-polyA RNA-seq) 相结合。我们的研究对象为长链非编码 RNA( non-PolyA),目前国际上还很少有人通过高通量测序技术对疾病的 lncRNA 进行全面预测分析和功能分类。随着测序速度不断提高,测序成本不断降低,本项目将来可以发展为面向人民大众的个性化医疗服务的平台。 图 1 生物医学信息云平台的产业化方向 http://www.incrna.org图 2 生物医学信息云平台的应用程序一览 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本项目使用的核心技术“基于整合性生物信息云计算和新一代测序技术( incRNA) 的非编码基因组疾病(如癌症)检测技术平台”已经通过软件查新认证( 20121022044750914)。正在准备申请国家版权局软件著作权登记证书。2 效益分析( 1)随着新一代高通量测序技术的发展,生物信息数据爆炸式增长,数据解读成为生物医学研究和临床应用的巨大问题,我们团队依托清华大学生命学院鲁志实验室在生物信息学,尤其是在 lncRNA 领域的技术专长开发的云计算平台将为广大科研工作和和临床用户提供可靠的数据分析云服务,提高他们的科研效率,为科学的发展做出贡献。 ( 2)我们团队通过与中国人民解放军总医院,上海肝胆医院等十多家临床单位的合作,将为鉴定癌症的早期诊断和药物治疗提供新的靶点,这不仅会增强中国基础临床科学的发展,通过临床应用还会为病患者带来癌症早期诊断、健康管理等个性化医疗服务,这将具有广泛的社会效益。 ( 3)通过我们打造高通量测序数据分析云计算平台和开展以癌症早期检测为主要内容的个性化医疗服务,将为中国培养一批高水平的生物信息数据分析人才,这将增强中国在生物信息学方面的实力。
清华大学 2021-04-13
中国高等教育学会关于召开高等教育信息化建设论坛的通知
为探讨高等教育信息化建设的最新发展趋势;分享高等教育信息化建设的案例和经验;促进高等教育信息化建设相关领域的合作交流,经研究,中国高等教育学会决定举办高等教育信息化建设论坛。
中国高等教育学会 2023-09-22
工业和信息化部关于印发《人形机器人创新发展指导意见》的通知
现将《人形机器人创新发展指导意见》印发给你们,请结合实际,认真贯彻落实。
工业和信息化部 2023-11-06
中国工程科技发展战略内蒙古研究院关于征集2023年咨询研究项目(中国工程院资助)的通知
中国工程科技发展战略内蒙古研究院(以下简称“内蒙古研究院”)是内蒙古自治区人民政府与中国工程院合作共建的高端智库。为充分发挥决策部门与智库之间的桥梁纽带作用,推动智库研究与自治区经济社会高质量发展,紧紧围绕中央交给内蒙古自治区的五大任务,征集2023年咨询研究项目(中国工程院资助),现将有关事项通知如下。
内蒙古自治区科学技术战略研究中心 2023-07-14
教育部开展高校研究生党建双创活动
近日,教育部办公厅印发《关于开展高校“百个研究生样板党支部”和“百名研究生党员标兵”创建工作的通知》(简称《通知》),对全国高校研究生党建双创活动进行部署。
教育部 2018-08-30
“新基石研究员项目”正式发布
4月30日,“新基石研究员项目”正式发布。这是一项聚焦原始创新、鼓励科学家自由探索、公益属性的新型基础研究资助项目。“新基石研究员项目”旨在长期稳定地支持一批杰出科学家自主选择研究方向,鼓励他们潜心研究、勇于挑战,聚焦“从0到1”的原始创新。“新基石研究员项目”严格遵循“科学家主导”的原则,设立科学委员会作为核心机构,中国科学院院士、西湖大学校长施一公担任首届科学委员会主席。
科学探索奖 2022-04-30
近代物理所MAX相材料辐照效应研究取得进展
近日,中国科学院近代物理研究所在MAX相材料中氦离子(He)与重离子共同辐照损伤效应研究中获进展,揭示了材料中氦行为与辐照损伤的关系。
近代物理研究所 2022-11-07
滨海城市经济发展的金融支持研究
《滨海城市经济发展的金融支持研究》从滨海城市金融支持的角度切入,通过理论,模型和实证研究,力图发现滨海城市金融支持的特点和一般规律,与此同时,根据可持续发展的要求,深入研究滨海城市金融支持的各个具体方面,涉及滨海城市金融机构体系建设,滨海城市的货币市场和资本市场建设,滨海城市金融产品创新,产业结构调整及其金融支持,滨海城市的民间金融,互联网金融,私募市场,滨海城市金融发展与人口素质及劳动力吸纳之间的关系,以及滨海城市金融发展中的金融风险及其防范与金融监测预警等,从而为滨海城市金融方案的设计提供实践依据.
江苏海洋大学 2021-05-06
新冠病毒与SARS存在交叉保护表位的研究
同济大学曹志伟教授团队与上海市公共卫生临床中心合作,关于武汉新型冠状病毒2019-nCoV抗原性计算的文章(Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus),2020年1月30日在 Journal of Genetics and Genomics在线发表。 研究表明,S蛋白是冠状病毒与宿主细胞表面ACE2受体结合、进而介导病毒入宿主细胞的关键表面蛋白,是疫苗抗体研发的重要靶点。基于具有自主知识产权的免疫原性计算工具CE-Blast,研究小组对所有冠状病毒的S蛋白进行了系统性的结构模拟和免疫原性扫描,计算了新病毒与已知17种冠状病毒亚型之间的免疫原性距离,发现新病毒S蛋白的免疫原性总体上与SARS更为接近。进一步计算揭示,2019武汉新冠状病毒与SARS冠状病毒的S抗原在受体接合区域(RBD)上存在潜在交叉反应表位。最为重要的是,其中一处与人ACE2受体结合位点紧密毗邻。因此,针对该表位区域研发抗体,空间位阻效应可能阻断病毒与ACE2受体的结合,有望起到病毒感染保护作用。同时,针对该表位区域的SARS抗体,可能对2019新病毒具有潜在临床治疗价值。 
同济大学 2021-04-10
气温在新冠病毒传播过程中的影响研究
2020年2月25日,中山大学的研究人员在预印本网站 medRxiv 上发布了一项研究成果,探讨了气温在新型冠状病毒(SARS-CoV-2)传播过程中的作用,并提出,二者之间可能存在非线性剂量-反应关系,当达到某一温度时,病毒传播率最高,随后温度的上升或将抑制病毒的传播。   研究人员收集了2020年1月20日至2月4日期间,我国34个省(包括直辖市、自治区)和26个海外国家共计429个城市的确诊病例数及每日气温,计算了1月份的平均气温、最低气温和最高气温的日平均值,并利用约束三次样条函数和广义线性混合模型分析了累计确诊病例数与温度之间的关系。模拟方程的计算结果显示,当平均气温为8.72℃,最低温度为6.70℃,最高温度为12.42℃时,累计确诊病例数达到峰值。此后,随着温度的上升,累计确诊病例数将下降。   全球COVID-19传输的最高温度与累计确诊病例数(lgN)的三次样条曲线根据以上温度拐点,研究人员将429个城市分为低温组和高温组,并采用广义线性回归模型进一步分析温度与累计病例数之间的关系。结果显示,低温组中,平均温度、最低温度和最高温度每升高1℃,累积病例指数分别增加0.83、0.82和0.83。在高温组中单因素模型中,最低温度每升高1℃,累积病例指数就会减少0.86。而当温度达到30℃时,累计病例指数将降至最低。这说明SARS-CoV-2对高温敏感,温度的提升能够阻止病毒扩散。此前已有研究表明,SARS-CoV和MERS-CoV等冠状病毒的传播与温度有关。在22-25℃,相对湿度为40-50%的环境中,SARS-CoV在光滑的表面上能保持至少5天的活性,而当温度升高到38℃,相对湿度为95%时,病毒很快就会出现失去了活力。同样,MERS-CoV在低温、低湿度环境下,无论是作为固体表面上的液滴还是作为气溶胶,都可以长期保持其活性。
中山大学 2021-04-10
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