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无需抗体的酶辅助化学标记N6-甲基腺嘌呤(m6A)测序技术
随着首个RNA修饰N6-甲基腺嘌呤(m6A)的去修饰酶FTO的发现,RNA表观遗传学/表观转录组学开始兴起并成为表观遗传学新的研究热点。m6A作为首个被发现的可逆RNA修饰,广泛存在于mRNA,依赖修饰酶、去修饰酶和结合蛋白发挥调控功能。已发现m6A具有调控mRNA剪接、出核、稳定性和蛋白翻译等功能,可以参与发育、配子发生、细胞重编程、生物节律、疾病等多种生理和病理过程的功能调控。为了更好地研究m6A生物功能和临床病理研究,开发m6A高通量测序技术一直是研究的热点。 现有m6A测序技术主要依赖于m6A抗体富集技术,包括低分辨率的m6A-seq/MeRIP-seq和联用iCLIP或PAR-CLIP技术的高分辨率m6A测序技术miCLIP 或PA-m6A-seq。抗体存在对特定RNA序列或结构的潜在非特异性结合,为了解决抗体方法的种种问题,研究者们做出了各种尝试,近期开发了两类无需抗体的m6A测序技术,一类为利用对特定甲基化序列(m6ACA)敏感的RNA核酸内切酶MazF辅助的测序方法(m6A-REF-seq or MAZTER-seq),此类方法只能检测16~25%的m6A位点;另一种是在细胞内表达融合m6A-binding domain(YTH)与胞嘧啶脱氨酶(APOBEC1)的融合蛋白实现的m6A测序(DART-seq),但该方法依赖于细胞转染效率且受限于体外样品的使用。 贾桂芳课题组一直致力于开发和利用核酸化学生物学技术研究RNA化学修饰在动植物中的生物功能研究。在本课题中,贾桂芳课题组巧妙地利用m6A的去甲基酶FTO蛋白作为催化剂,将mRNA上化学惰性的m6A转化为高反应活性的中间态产物N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A),然后利用二硫苏糖醇(DTT)的巯基与hm6A发生亚胺1,2加成反应,将不稳定的hm6A转化为更稳定的巯基加成产物dm6A。dm6A上的自由巯基可以与甲烷硫代磺酸(methanethiosulfonate,MTSEA)快速反应,实现在mRNA上m6A的位置标记生物素Biotin,最终可被链霉亲和素珠捕获,从而富集含有m6A修饰的RNA片段供后续高通量测序使用。
北京大学 2021-04-11
南京农业大学园艺学院氮素连续流动分析仪及样品制备系统等采购项目招标公告
南京农业大学园艺学院氮素连续流动分析仪及样品制备系统等采购项目招标
南京农业大学 2022-06-02
关于组织参加山西省第三十届中国杨凌农业高新科技成果博览会的通知
由科技部、商务部、农业农村部、中国科学院、国家林业和草原局、国家知识产权局和陕西省人民政府共同主办的“第三十届中国杨凌农业高新科技成果博览会”(以下简称农高会)将于2023年9月19日—23日在杨凌示范区举办。
山西省科技厅农村科技处 2023-08-08
宁夏回族自治区科技厅关于印发《自治区农业科技园区建设管理办法》的通知
为推动自治区农业科技园区建设,加快现代农业技术集成应用与科技成果转化推广,示范带动农业产业高质量发展,自治区科技厅制定了《自治区农业科技园区建设管理办法》,现予印发,请遵照执行。
自治区科学技术厅 2023-07-21
云南省科技厅 云南省教育厅 云南省人力资源社会保障厅 云南省农业农村厅 云南省乡村振兴局 云南省林草局印发关于进一步加强农业科技人员服务基层的意见的通知
为贯彻落实中央农村工作会议精神和省委、省政府决策部署,进一步引导全省广大农业科技人员服务企业、服务群众、服务基层,推动科技人才落地、科技成果落地、科技服务落地,积极投身农业农村现代化建设,助力乡村振兴,提出如下意见。
云南省科学技术厅 2023-11-13
机械化学结合水洗的飞灰高效低成本无害处置方法和系统
本发明涉及飞灰无害化处置,旨在提供一种机械化学结合水洗的飞灰高效低成本无害处置方法和系统。该系统包括给料仓、水平滚筒式球磨机、搅拌釜和板框压滤机;给料仓的底部接于水平滚筒式球磨机的进料口,水平滚筒式球磨机的密闭筒体中放置不锈钢磨球;出料管道两端分别接水平滚筒式球磨机底部和搅拌釜上部;搅拌釜上接进水管道,底部接至板框压滤机。本发明可同时高效实现飞灰的重金属固化、二噁英降解和氯脱除,处置后飞灰彻底无害化且具备资源化利用条件;处置后飞灰的重金属固化率在70%以上;无外加添加剂,处置成本低廉;工艺流程简单,反应条件温和,过程环保,无有害副产物产生;设备投入和运行成本低廉,处置效果显著,工艺流程实现简单。
浙江大学 2021-04-11
哈尔滨工程大学电化学碳捕获及电催化转化系统采购项目竞争性磋商
哈尔滨工程大学电化学碳捕获及电催化转化系统采购项目竞争性磋商
哈尔滨工程大学 2022-06-06
关于征集2024年度化学科学领域重大项目立项建议的通告
为做好项目的立项和资助工作,化学科学部根据《国家自然科学基金重大项目管理办法》的规定,以及“鼓励探索,突出原创;聚焦前沿,独辟蹊径;需求牵引,突破瓶颈;共性导向,交叉融通”的新时期科学基金资助导向,面向科技界征集2024年度重大项目立项建议。
国家自然科学基金 2023-07-28
机械化学结合水洗的飞灰高效低成本无害处置方法和系统
本发明涉及飞灰无害化处置,旨在提供一种机械化学结合水洗的飞灰高效低成本无害处置方法和系统。该系统包括给料仓、水平滚筒式球磨机、搅拌釜和板框压滤机;给料仓的底部接于水平滚筒式球磨机的进料口,水平滚筒式球磨机的密闭筒体中放置不锈钢磨球;出料管道两端分别接水平滚筒式球磨机底部和搅拌釜上部;搅拌釜上接进水管道,底部接至板框压滤机。本发明可同时高效实现飞灰的重金属固化、二噁英降解和氯脱除,处置后飞灰彻底无害化且具备资源化利用条件;处置后飞灰的重金属固化率在70%以上;无外加添加剂,处置成本低廉;工艺流程简单,反应条件温和,过程环保,无有害副产物产生;设备投入和运行成本低廉,处置效果显著,工艺流程实现简单。
浙江大学 2021-04-13
检测基因P53的比率电化学DNA传感器修饰电极及其制备方法
本发明涉及电化学检测技术领域,具体公开了一种用于检测肿瘤抑制基因p53的修饰电极及其制备方法。用于检测P53基因的探针,由一条单链DNA辅助探针S1和一条单链DNA捕获探针S2组成,所述S1的DNA链序列为:5’-Fc-CTC TCA GTG ATT TTT TTA GTG AGA GAG-(CH2)6-SH-3’,所述S2的DNA链序列为:5’-MB-TCA CTG AGT CTT CCA GTG TGA TGA TCA CT-3’。 本发明所提供的方法制备简单,操控方便,使用成本低,与毛细管电泳、变性高效液相色谱、变性梯度凝胶电泳以及酵母中分离的等位基因功能分析技术等方法相比较,电化学生物传感器的方式具有样品无需前处理,易操控,反应条件简单、成本低等优点。肿瘤抑制基因P53是一种被称为“基因组的守护者”的抑癌基因,是一系列同工型蛋白质(P53蛋白)的同源基因。由该基因编码的一系列蛋白质具有调控细胞分裂、修复和凋亡的作用。国际癌症基因组协会已经证明,P53基因是在人类癌症有关的基因中突变最为频繁的基因。在人类已知的所有恶性肿瘤组织中,该基因出现突变的概率在50%以上,是迄今为止人类发现的与癌症相关性最高的基因。因此检测P53基因对临床上预防和治疗癌症有着非常重要的作用,本方法制备简单,操控方便,使用成本低,在医学上有广阔的应用前景。
青岛大学 2021-04-13
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