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西湖大学工学院李子青团队 CAMEO蛋白质结构预测竞赛 三个月总成绩全球第一
由瑞士生物信息研究所和巴塞尔大学联合举办的全球持续蛋白质结构预测竞赛CAMEO(Continous Automated Model EvaluatiOn),与CASP(Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction)并列为蛋白质结构预测领域的最重要的两大权威竞赛。
西湖大学 2022-11-29
细胞因子融合蛋白的应用开发技术
细胞因子是特异性细胞产生的,一类能够在细胞间传递信息、具有免疫调节和效应功能的蛋白质。其中细胞因子介导的自身免疫是引起自身免疫性疾病的一种重要的机制。白介素-17(IL-17)是目前新发现的细胞因子,是由 Thl7 细胞分泌的致炎细胞因子,在机体炎症反应以及自身免疫性疾病中发挥着重要作用。参与包括风湿性关节炎、 系统性红斑狼疮、银屑病等多种自身免疫性疾病的发病与发展。白介 素-17 与其受体结合后通过信号转导而发挥作用。白介素-17 受体融合蛋白能与内源性受体竞争结合白介素 17,是白介素-
兰州大学 2021-01-12
细胞因子融合蛋白的应用开収技术
细胞因子是特异性细胞产生的,一类能够在细胞间传递信息、具 有免疫调节和效应功能的蛋白质。其中细胞因子介导的自身免疫是引 起自身免疫性疾病的一种重要的机制。白介素-17(IL-17)是目前新 发现的细胞因子,是由 Thl7 细胞分泌的致炎细胞因子,在机体炎症 反应以及自身免疫性疾病中发挥着重要作用。参与包括风湿性关节 炎、系统性红斑狼疮、银屑病等多种自身免疫性疾病的发病与发展。 白介素-17 与其受体结合后通过信号转导而发挥作用。白介素-17 受 体融合蛋白能与
兰州大学 2021-04-14
棉花细胞壁伸展蛋白基因GbEXPATR及应用
中试阶段/n该项目属于植物基因工程技术领域,具体涉及一个分离克隆自棉花的细胞壁伸展蛋白基因GbEXPATR及应用。本发明从海岛棉纤维不同发育时期的cDNA文库中获得海岛棉纤维特异表达的缺少第二个结构域的细胞壁伸展蛋白基因GbEXPATR,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,其中52-306为碱基所示的区域是编码区,它特异地在海岛棉纤维伸长期、转换期及次生壁合成初期高效表达。将获得的全长ORF构建到植物超量表达载体pCAMBIA2301m上,用农杆菌介导的遗传转化方法转化陆地棉,对转基因后代的纤
华中农业大学 2021-01-12
集电化学、光谱和质谱方法于一体的单细胞成像仪
世界上首台有机融合电化学、光谱学和质谱技术的优势于一体的“单细胞时空分辨分子动态分析系统” 一、项目分类 重大科学前沿创新 二、成果简介 南京大学化学化工学院陈洪渊院士领衔的科研团队,在国家自然科学基金重大科研仪器专项支持下,联合清华大学、东南大学、中国医学科学院药物研究所的研究人员,攻克了单个细胞内分子反应动力学过程高时空分辨和微弱信号精准测量的技术瓶颈,研制成世界上首台有机融合电化学、光谱学和质谱技术的优势于一体的“单细胞时空分辨分子动态分析系统”。 首次阐明单细胞内溶酶体中生物催化反应机制;创建了胞内不同空域热传导系数的准确测量,阐明胞内热量产生与耗散机制以及胞内“出汗”与机体“出汗”散热的生命整体一致性;研制成的极紫外(VUV)质谱成像,摆脱了MALDI技术对电离介质的依赖,极大地降低了二次离子质谱(SIMS)的电离碎片,从而降低了重构分子结构的难度,显著提升了我国生命与健康领域高端科研仪器的国际竞争力。 本项目迄今已发表研究论文逾百篇。包括PNAS 4篇,NatureComm. 2篇,Science Adv.1篇,JACS 6篇,Angew. Chem. Int. Ed. 6篇,Anal. Chem. 49篇等。申请了国内专利41件,国际专利1件,授权18件。项目组成员获得教育部“长江学者奖励计划”青年学者以及2018年度仪器仪表学会分析仪器分会“朱良漪分析仪器青年创新奖”;所研发的“单细胞活性分析仪”获“2018年度科学仪器行业优秀新产品奖”及“2021年度日内瓦发明金奖”。
南京大学 2022-08-12
α 促黑素细胞激素的融合蛋白制备方法及应用
可应用于抑制或治疗中枢神经系统炎症中,该 α 促黑素细胞激素 的融合蛋白在宿主体内高水平稳定表达,在保留 α‐ MSH 生物活性的 同时,能够有效跨过血脑屏障,提高药效,同时具有延长半衰期的功 效。
兰州大学 2021-04-14
揭示RNA编辑核心蛋白ADAR全转录组RNA底物特征
开发了一个高效的捕获RNA结合蛋白双链RNA底物的建库测序技术(irCLASH)以及后续的一整套生物信息学分析方法;首次在转录组水平上系统地绘制了人类ADAR蛋白的内源双链RNA底物图谱;揭示了决定ADAR结合效率和编辑效率的底物特征和ADAR结合长双链RNA的体内模型。       该研究利用irCLASH技术系统构建和分析了人类ADAR1、ADAR2及ADAR3的双链RNA底物图谱,发现与之前根据计算推导的研究设想不同,ADAR具有大量的、长距离的双链RNA底物。该研究发现不完全互补配对的底物与ADAR蛋白也有很好的亲和度,特别是ADAR2家族成员。研究还进一步揭示了决定ADAR结合效率和编辑效率的底物特征。irCLASH测序技术及后续的整套生物信息学分析方法的开发为研究双链RNA结合蛋白的内源底物提供了新的工具。同时,该研究揭示的ADAR与底物相互作用及催化特性为研究人员开发高效的RNA编辑工具提供了资源宝库及改进方向。
中山大学 2021-04-13
癌细胞简化自身基因组冗余序列以便快速增殖
  核糖体DNA编码核糖体的关键组分-核糖体RNA,对蛋白质翻译和细胞增殖具有重要的作用。然而,核糖体DNA的拷贝数在人类基因组中是易变的,由于技术手段的限制,人们对哺乳动物细胞如何维持和控制核糖体DNA的拷贝数和稳定性所知甚少。本研究应用计算生物学和数字微滴式PCR(Droplet digital PCR)方法分析了正常和癌症状态下,人类和小鼠基因组中核糖体DNA的拷贝数和序列变异情况。发现人类癌症基因组中核糖体DNA拷贝数出乎意料地显著减少,并伴随许多其他基因拷贝数的变异。此外,癌症基因组的核糖体DNA序列也更易发生突变。      根据文献证据的提示,研究团队进一步探讨了癌症模型中mTOR(哺乳动物雷帕霉素靶蛋白,mammalian target of rapamycin)功能与核糖体DNA拷贝数减少的关系。发现Pten基因(mTOR信号通路的负调控因子)敲除的白血病小鼠模型中,癌症造血干细胞早期就出现核糖体DNA拷贝数的减少,但其细胞增殖、核糖体RNA合成和蛋白翻译水平等均显著提高。说明核糖体DNA拷贝数丢失是mTOR通路过表达的癌症的一种常见特征。这一研究结果提示,测定核糖体DNA拷贝数,可成为预测癌症对DNA损伤药物敏感性的一个简单而有效的新指标。
中山大学 2021-04-13
极小量细胞DNA蛋白相互作用捕获技术
1.痛点问题 细胞中蛋白和DNA相互作用对于细胞个体的生命活动至关重要,但是目前在极小量细胞样本中检测DNA蛋白相互作用的方法手段尚不成熟;而相关方法的升级可以极大地推动相关生命科学和基础医学研究领域的发展,诸如早期胚胎发育、肿瘤免疫、神经生物学等。 2.解决方案 本项成果基于ChIC手段,通过改造后的可以识别抗体的融合转座蛋白,特异性识别和标记基因组上对应蛋白的结合位点,并通过PCR扩增和二代测序,继而通过生物信息学分析,获取相应蛋白的DNA结合信息。 3.合作需求 寻找合适的应用场景,重点包括基于进一步样品小量化,例如单细胞情况下应用该方法。
清华大学 2022-10-11
揭示YPS蛋白影响果蝇生殖干细胞发育的分子机制
该项研究中,研究团队首先发现 YPS 蛋白缺失的2周龄果蝇卵巢干细胞显现出发育延迟,增殖变慢的现象,提示该蛋白对于果蝇生殖干细胞的维持、增殖以及分化具有重要作用。由于YPS的人源同类蛋白YBX1与mRNA m5C甲基化酶NSUN2共定位于外泌体中,且YPS本身含有能够结合核酸的保守的cold-shock结构域,研究团队推测YPS可能通过结合含有甲基化的mRNA来行使功能。
南方科技大学 2021-04-14
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