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我国科学家构建单细胞环形RNA分析技术及表达图谱
环形RNA(circRNA)是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子。单细胞全长转录组测序技术的发展,可以对单个细胞中环形RNA进行捕获测定,但效率较低,仅可部分揭示单细胞分辨率下环形RNA的表达模式。因此,单细胞水平的环形RNA表达及功能研究已成为该领域重点关注的问题。
科技部生物中心 2022-07-07
揭示转录因子Sox2调节体细胞重编程的新机制
揭示了转录因子Sox2同时结合DNA和RNA并协同调控体细胞重编程的新机制,着重强调了在体细胞重编程过程中Sox2与RNA的直接相互作用的功能。通过PAR-CLIP和RNA SELEX确认了Sox2与RNA直接相互作用,进一步的测序分析发现Sox2偏好性结合一个CCCY核心基序和一个CGCG的二级基序。随后,研究人员利用EMSA和RNA免疫沉淀(RNA-immunoprecipitation assay)等手段确定了Sox2的RNA结合结构域(RBM),该结构域具有优先结合富含GC的RNA序列的特征。另外,通过RNA fishing实验和竞争性结合实验等的进一步分析,发现在DNA和RNA共同存在的情况下,Sox2使用其HMG结构域结合同源DNA序列,并同时利用RBM结构域在体外介导三元RNA/Sox2/DNA复合物的形成。除此之外,通过比较Oct4、Klf4、c-Myc (OKM)“鸡尾酒”以及不同Sox2突变体诱导下iPSC生成的效率发现,删除Sox2 的RBM结构域会影响iPSC的生成,并且显著地改变了体细胞重编程过程中的选择性剪接事件。       该研究加深了人们对Sox2蛋白调控多能性重编程机制的理解,进一步阐明了DRBPs对RNA代谢的调控机制。
中山大学 2021-04-13
集电化学、光谱和质谱方法于一体的单细胞成像仪
世界上首台有机融合电化学、光谱学和质谱技术的优势于一体的“单细胞时空分辨分子动态分析系统” 一、项目分类 重大科学前沿创新 二、成果简介 南京大学化学化工学院陈洪渊院士领衔的科研团队,在国家自然科学基金重大科研仪器专项支持下,联合清华大学、东南大学、中国医学科学院药物研究所的研究人员,攻克了单个细胞内分子反应动力学过程高时空分辨和微弱信号精准测量的技术瓶颈,研制成世界上首台有机融合电化学、光谱学和质谱技术的优势于一体的“单细胞时空分辨分子动态分析系统”。 首次阐明单细胞内溶酶体中生物催化反应机制;创建了胞内不同空域热传导系数的准确测量,阐明胞内热量产生与耗散机制以及胞内“出汗”与机体“出汗”散热的生命整体一致性;研制成的极紫外(VUV)质谱成像,摆脱了MALDI技术对电离介质的依赖,极大地降低了二次离子质谱(SIMS)的电离碎片,从而降低了重构分子结构的难度,显著提升了我国生命与健康领域高端科研仪器的国际竞争力。 本项目迄今已发表研究论文逾百篇。包括PNAS 4篇,NatureComm. 2篇,Science Adv.1篇,JACS 6篇,Angew. Chem. Int. Ed. 6篇,Anal. Chem. 49篇等。申请了国内专利41件,国际专利1件,授权18件。项目组成员获得教育部“长江学者奖励计划”青年学者以及2018年度仪器仪表学会分析仪器分会“朱良漪分析仪器青年创新奖”;所研发的“单细胞活性分析仪”获“2018年度科学仪器行业优秀新产品奖”及“2021年度日内瓦发明金奖”。
南京大学 2022-08-12
癌细胞简化自身基因组冗余序列以便快速增殖
  核糖体DNA编码核糖体的关键组分-核糖体RNA,对蛋白质翻译和细胞增殖具有重要的作用。然而,核糖体DNA的拷贝数在人类基因组中是易变的,由于技术手段的限制,人们对哺乳动物细胞如何维持和控制核糖体DNA的拷贝数和稳定性所知甚少。本研究应用计算生物学和数字微滴式PCR(Droplet digital PCR)方法分析了正常和癌症状态下,人类和小鼠基因组中核糖体DNA的拷贝数和序列变异情况。发现人类癌症基因组中核糖体DNA拷贝数出乎意料地显著减少,并伴随许多其他基因拷贝数的变异。此外,癌症基因组的核糖体DNA序列也更易发生突变。      根据文献证据的提示,研究团队进一步探讨了癌症模型中mTOR(哺乳动物雷帕霉素靶蛋白,mammalian target of rapamycin)功能与核糖体DNA拷贝数减少的关系。发现Pten基因(mTOR信号通路的负调控因子)敲除的白血病小鼠模型中,癌症造血干细胞早期就出现核糖体DNA拷贝数的减少,但其细胞增殖、核糖体RNA合成和蛋白翻译水平等均显著提高。说明核糖体DNA拷贝数丢失是mTOR通路过表达的癌症的一种常见特征。这一研究结果提示,测定核糖体DNA拷贝数,可成为预测癌症对DNA损伤药物敏感性的一个简单而有效的新指标。
中山大学 2021-04-13
宫颈细胞保存液
1、几乎 100%保存细胞的形态结构和数量。2、能有效分解粘液、红细胞。3、含有梯度处理成分,将有效细胞与标本中黏液、碎片、血细胞等分层,使有效细胞沉积到细胞保存液瓶底部。4、制片后剩余样本仍有足够的细胞,可进一步直接做 HPV、DNA、衣原体、淋病及免组化测试。5、标本瓶既可存放标本,也可作为离心管使用,标本瓶底锥形内胆,便于收集细胞。
孝感奥华医疗科技有限公司 2025-01-21
揭示特殊转录激活分子的机制
转录调控是细菌应对环境胁迫和病原菌缓解抗生素压力的重要手段,由细菌的转录核心机器 RNA 聚合酶和一系列转录起始 sigma 因子共同完成。在通常情况下,细菌的看家 sigma 因子(如大肠杆菌的 sigma 70 )负责大多数的基因表达,而在环境胁迫下, sigma S 则快速占据主导,并通过开启特定基因的表达来帮助细菌适应不利环境。与细菌的看家 sigma 因子相比, sigma S 的活性通常较低,其功能的发挥通常需要转录激活因子的协助,而 Crl 正是一种 sigma S 特异的转录激活因子。 此前,对于 Crl 激活转录的分子机制不甚清楚。在该研究中,合作者首先解析了 E. coli Crl 转录激活复合物的 3.8 Å 的冷冻电镜结构,该复合物包括了 E. coli 的 RNA 聚合酶、转录起始因子 sigma S 、 Crl 、以及启动子 DNA 。在该结构中, Crl 主要与 sigmaS 的 domain  2 相互作用,同时也与 RNA 聚合酶的最大亚基 bet a’ 有少许相互作用。与绝大多数传统的转录激活因子不同,电镜结构显示 Crl 并不结合启动子 DNA ,因此单从结构本身较难完全解释 Crl 对于 sigma S -RNAP 的转录促进活性。在此基础上,上科大免化所团队进一步利用氢氘交换质谱( HDX-MS )对该系统进行了深入研究。氢氘交换质谱的结果揭示, Crl 不仅直接结合 sigmaS  的 alpha2-alpha3 螺旋( Figure 1A ),还能够通过变构调节作用稳定 sigmaS 的  alpha4 、 alpha5 等多个结构单元( Figure 1A-C ),而这些结构单元的稳定将能够促进 sigma S 与 DNA 以及 sigma S 与 RNA 聚合酶之间的相互作用( Figure 1D )。基于以上数据,研究人员提出 Crl 通过特异性结合转录起始因子 sigma S ,稳定 sigma S 的活性构象,从而促进 sigmaS 与 RNA 聚合酶以及启动子 DNA 的结合组装,进而激活 sigma S-RNAP 介导的转录。这一机制在后续的功能实验中得到了进一步验证。该工作呈现了一种新的转录因子与 RNA 聚合酶的结合方式,揭示了一种新的细菌转录激活分子机制。
上海科技大学 2021-04-11
延边大学李东浩教授课题组:靶型多腔电泳同时分离与制备细胞外囊泡
本研究提出一种基于连续梯度非均匀电场结合梯度凝胶孔径分布的靶型多腔电泳装置(Circular Multicavity Electrophoresis,CME)实现细胞外囊泡的分离制备。
延边大学 2025-02-12
干细胞促进毛发再生
技术成熟度:技术突破 脱发在全球范围普遍,中国脱发人群超2.5亿,且呈年轻化,30岁以下占比36%。这部分群体重视形象,脱发严重影响其生活与心理,对治疗方案需求迫切。 本成果利用干细胞,通过独特的作用机制促进毛囊发育与滋养,进而实现毛发再生。脱落乳牙中含有丰富的干细胞,这些干细胞具有多向分化潜能和强大的旁分泌功能,能分泌多种细胞因子和生长因子,如血管内皮生长因子(VEGF)、胰岛素样生长因子(IGF)、转化生长因子-β(TGF-β)等,这些因子可刺激真皮乳头细胞增殖,促进毛囊从休止期进入生长期,加速毛发的生长周期,同时改善毛囊微环境,为毛发的生长提供充足的营养和支持。此外,研究团队还开发了一套高效的乳牙干细胞提取、培养和应用技术,确保干细胞的活性和功能,使其能够安全有效地应用于脱发治疗。 相关研究成果已在国际专业期刊《Cell Transplantation》、《Cytotherapy》、《Stem Cells International》、《Journal of Proteomics》、《International Biological Macromolecules》等上发表,得到了国内外同行的高度关注和认可。
北京科技大学 2025-05-21
四支组音叉组
产品详细介绍
芜湖震洋教仪磁电科技有限公司 2021-08-23
生命科学学院韩管助课题组在逆转录病毒基因选配研究取得重要进展
逆转录病毒需要整合到宿主基因组中来完成自身的复制。当逆转录病毒感染宿主生殖细胞时,整合的逆转录病毒便会从亲代传到子代,从而形成内源性逆转录病毒。内源性逆转录病毒广泛存在于脊椎动物基因中。绝大多数的内源性逆转录病毒会积累各种突变,从而在宿主基因组中失活或片段化。宿主有时会利用内源性逆转录病毒基因来行使自身生物学功能(图1),这个过程在进化生物学中被称为选配(co-option)。例如,抑制多种逆转录病毒复制的限制性因子Fv1以及参与到胚胎发育的Syncytins都是选配的逆转录病毒基因。但目前对脊椎动物中逆转录病毒基因选配事件尚无系统的研究。 韩管助课教授题组在756种脊椎动物基因组中系统地挖掘了逆转录病毒基因选配事件,共发现177个逆转录病毒选配事件。其中,93个选配事件涉及到逆转录病毒gag基因,gag基因选配事件主要发生在哺乳动物和鸟类中。84个选配事件涉及到逆转录病毒env基因,env基因选配事件主要发生在哺乳动物、鸟类和鱼类中。通过对选配事件发生的时间进行分析,发现选配事件的数目随着时间的推移而增多,仅有少数的选配的逆转录病毒基因在长时间尺度上被维持,这些结果表明逆转录病毒基因选配可以在脊椎动物中频繁的发生和丢失。 一般认为,参与到病毒与宿主间进化军备竞赛的宿主基因会受到正选择。该研究通过选择压力分析在很多选配的逆转录病毒基因中发现了正选择的证据,表明这些基因可能参与到病毒与宿主间进化军备竞赛中。还有部分选配的逆转录病毒基因的进化主要受到负选择,表明这些基因可能主要参与到非抗病毒的宿主功能之中。选配的逆转录病毒基因受到不同的选择压力表明这些选配的基因可能行使了多种宿主细胞生物学功能。总之,该研究为在脊椎动物进化过程中发生的逆转录病毒选配事件提供了一幅全景图,对全面理解逆转录病毒和脊椎动物间互作的进化具有十分重要的意义。
南京师范大学 2021-02-01
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