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基于转录调控网络的智善方开发及应用系统
1. 痛点问题 针对重大疾病与复杂性疾病(如肿瘤、代谢性疾病、心血管疾病、免疫性疾病等),目前西药的单靶点疗法治疗效果不佳,且易产生耐药性的行业痛点,开展天然植物、中药的功能研究和中药方剂开发。中药和中药方剂针对复杂性疾病的治疗具有独特优势,具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,但是中医是实践医学,中医药虽然临床疗效显著,却无法用世界通行的“语言”,让国外同行也能理解和验证中医原理,所以中医药很难进入国际市场。 因此,根据国家“十四五”规划、2035年远景目标和健康中国发展战略的要求,“坚持中西医并重和优势互补,大力发展中医药事业”,本团队在中医药核心思维和理论指导下的,基于现代生命科学的方法,系统解析天然植物和中药的物质基础与作用机制,阐释中药配伍理论的科学内涵,以“守正-创新”模式实现高效、快速、精准的智善方(理论指导的、药效完善的方剂简称智善方)开发。 2. 解决方案 本团队开发的高通量靶向转录组筛选技术(high-throughput targeted transcriptome screening, HT3S),可对与特定疾病表型相关的基因进行定量分析,可并行筛选多种天然植物或中药。目前已绘制了7000余种方剂、中药、天然植物和单体的分子功能图谱,形成了分子版“本草纲目”。在此基础上,针对重大疾病与复杂性疾病(如肿瘤、代谢性疾病、心血管疾病、免疫性疾病等),通过数据挖掘和计算分析,评价中药方剂对不同信号通路的调控作用,计算可显著改善疾病失调信号通路的候选中药方剂,并开展体内外验证,开发了一系列药效明确、作用机制清晰的中药智善方。
清华大学 2021-09-16
人类细胞图谱
跨越胚胎和成年两个时期、涵盖八大系统、建立70多万个单细胞的转录组数据库、鉴定人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类……世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功了。北京时间2020年3月26日,国际顶级期刊《自然》在线刊登了浙江大学医学院郭国骥教授团队的这项最新研究成果。 细胞是生命的基本单位。在过去的数百年时间里,科学家主要利用显微镜和流式分析等技术,依靠若干表型特征对自然界里不同物种的细胞进行分类和鉴定。这些表型特征的选取往往引入了较多的人为主观性。而单细胞测序技术的出现对这一传统的细胞认知体系带来了革命性的变化。 此前,郭国骥团队自主研发了Microwell-seq高通量单细胞分析平台,并于2018年在国际顶级期刊《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。此后,郭国骥团队一直在这个领域精耕细作,并与浙江大学医学院几家附属医院的张丹团队、王伟林团队、陈江华团队、梁廷波团队和黄河团队等保持紧密合作,时隔两年,再出重量级成果。一张单细胞水平的人类细胞图谱 团队对60种人体组织样品和7种细胞培养样品进行了Microwell-seq高通量单细胞测序分析,系统性地绘制了跨越胚胎和成年两个时期、涵盖八大系统的人类细胞图谱。 郭国骥介绍说,Microwell-seq具有成本低廉、双细胞污染率低和细胞普适性广等优势,由此团队建立了70多万个单细胞的转录组数据库,鉴定了人体100余种细胞大类和800余种细胞亚类。同时,团队开发了scHCL单细胞比对系统用于人体细胞类型的识别,并搭建了人类细胞蓝图网站。 “这项工作概括地说就是人体细胞数字化。我们能用数字矩阵描述每一个细胞的特征,并对它们进行系统性的分类。我们定义了许多之前未知的细胞种类,还发现了一些特殊的表达模式。” 通过这张图谱,团队发现,多种成人的上皮、内皮和基质细胞在组织中似乎扮演着免疫细胞的角色。“趋化因子阳性上皮细胞、抗原呈递阳性内皮细胞和白介素阳性成纤维细胞广泛地分布在成体的各种组织器官之中,并在分类上独立于传统的上皮、内皮、基质和免疫细胞。这些非专职的免疫细胞也在兼职干着免疫的活。我们认为成年人非免疫细胞的广泛免疫激活是人体区域免疫的一种重要调节机制。” 此外,通过跨时期、跨组织和跨物种的细胞图谱分析,团队揭示了一个普适性的哺乳动物细胞命运决定机制:干细胞和祖细胞的转录状态混杂且随机,而分化和成熟细胞的转录状态就变得分明且稳定,也就是说,细胞分化经历了一个从混乱到有序的发展过程。 该研究首次从单细胞水平上全面分析了胚胎和成年时期的人体细胞种类,研究数据将成为探索细胞命运决定机制的资源宝库,研究方法将对人体正常与疾病细胞状态的鉴定带来深远影响。在未来,临床医生就可能通过参照正常的细胞状态来鉴别异常的细胞状态和起源。 论文的第一作者包括浙江大学医学院韩晓平副教授(并列通讯)、17级硕士生周子茗、19级博士生费丽江、17级直博生孙慧宇、18级博士生汪仁英、16级直博生陈瑶、博士后陈海德和王晶晶。论文最后通讯作者为浙江大学医学院郭国骥教授。项目获得了国家自然科学基金和科技部干细胞与转化医学重点专项的支持。
浙江大学 2021-04-10
植物细胞模型
宁波浪力仪器有限公司(余姚市朗海科教仪器厂) 2021-08-23
免疫细胞存储
山东翰康生物科技有限公司 2021-09-01
李光鹏教授课题组研究揭示ZGA-regulator在体细胞重编程中作用机制
终末分化的体细胞可以通过SCNT或者诱导性多能干细胞(iPS)技术,重编程至全/多能性的状态。与SCNT和iPS技术相比,化学小分子诱导(CiPS)仅使用化学小分子就能使普通体细胞发生重编程,逆转为多潜能干细胞。CiPS技术不仅简单,而且不受试验材料限制及不涉及伦理方面的问题,因此CiPS具有更广泛的科研、临床及育种应用价值。然而,CiPS的诱导耗时长且效率低,如何提高CiPS的诱导效率,是化学诱导细胞重编程领域亟待解决的问题之一。 本研究针对哺乳动物SCNT和CiPS介导的体细胞重编程效率低与克隆动物出生率低等关键科学问题,利用课题组在2018年自主研发的“胚胎ZGA实时监测系统”,结合siRNA-repressor和mRNA-inducer技术,对16种“合子基因组调控因子(ZGA-regulator)”进行筛选。结果发现,Dux、Dppa2和Dppa4在体细胞重编程的早期阶段发挥关键作用。如用CRISPR-Cas9敲除Dux,克隆胚胎将完全被阻断在2-细胞时期。只有在瞬间过表达Dux(tOE-Dux),使其符合内源Dux时空特性时,才能提高核移植重编程效率,我们将这种方法称为D-SCNT。此外,D-SCNT结合干扰DNA甲基化酶(si-Dnmts)能够进一步提高克隆动物的出生率。研究还发现,特异性过表达Dux可以显著提高CiPS的细胞重编程效率和提高干细胞的多能性,并对相关机制做了阐释。 该研究首次揭示了ZGA调控因子Dux在体细胞重编程中的作用机制,时空特异性过表达Dux可大幅度提高克隆效率和化学小分子诱导多能干细胞的建系效率,为干细胞的再生医学与生物工程应用提供了新的途径。
内蒙古大学 2021-02-01
脂质体包裹bFGF微粒影响牵张性脊髓损伤后神经细胞凋亡的蛋白质组
独自拥有。
四川大学 2016-04-26
基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究
东南大学生命科学与技术学院“发育与疾病相关基因”教育部重点实验室林承棋和罗卓娟课题组在国际顶级期刊Science Advances杂志发表了题为ENL initiates multivalent phase separation of the Super Elongation Complex (SEC) in controlling rapid transcriptional activation的文章,阐明了有关基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究工作成果。 基因转录是承载于DNA之上遗传信息传递的首要步骤。细胞命运决定、个体发育以及疾病的发生发展决定于基因的差异性表达。林承棋教授之前的研究鉴定并发现,多亚基、大分子蛋白质复合物,超级转录延伸复合物(SEC)可通过磷酸化RNA聚合酶II等因子,让其从暂停的状态中释放出来,促进下游基因进行有效的转录。然而,长期以来,人们困惑于细胞内膜系统之外的分子如何有序活动调控生命过程。 东南大学研究团队的研究揭示了SEC介导的多价相分离在RNA聚合酶II转录暂停释放中起着关键作用,并从全新的角度为基因快速协调性转录激活程序的机制探索提供了新的认识。此外,作者还发现在混合谱系白血病(MLL)中,SEC与MLL基因的转位融合,可以极大促进SEC相分离,从而促进癌基因快速转录并维持高表达状态。这一发现将为SEC相关的人类疾病发病机制探索及药物靶向筛选方案提供了新的方向与思路。 本文第一作者为东南大学生命科学与技术学院林承棋课题组博士生郭澄豪,东南大学为第一通讯单位。  
东南大学 2021-04-11
生物转化甲烷气体联产细胞蛋白和多糖
针对我国蛋白饲料和多糖产品的巨大市场空间,团队借助专有的合成生物学技术平台自主研发了甲烷气体高值化生物转化技术,拥有我国行业内首个专利授权。利用该技术可以实现将页岩气、沼气等甲烷气体通过微生物高效转化为细胞蛋白和多糖。 所产甲烷基细胞蛋白富含包括全部必需氨基酸的 18 种氨基酸,菌体粗蛋白含量大于 60%,其中 9 种必需氨基酸在总氨基酸中占比达 30%,其在总氨基酸含量、限制性氨基酸含量等参数水平上明显优于豆粕蛋白,并与鱼粉蛋白相似。 所产多糖经权威机构鉴定,其结构与保湿霜类护肤品添加剂海藻多糖结构相似度达97%,具有保湿、修复等功能,目前主要应用于医美产品添加剂与化妆品添加剂。 本项目具有生产成本低、制备工艺简洁高效和制备过程环保无污染的优势。通过前期建立甲烷生物制造的全链条研发平台,该技术已完成从实验室向产业化的推进。
西安交通大学 2025-02-08
21032滑轮组
宁波华茂文教股份有限公司 2021-08-23
在线组卷系统
一、产品简介 万方在线组卷系统是一款专门为中学师生订制开发的选题组卷的工具。目前内置百万试题,覆盖了初、高中六个年级的所有升学考试学科,为保证试题质量,题库内录入的题目全部来源近年来各地的中高考的真题和名校名卷。 主要功能:人工选题、智能选题、试卷预览、设置卷参、试卷下载与存档、试题和试卷的收藏,试卷输出。用户可以对题库中的试题进行学科、学段、考试类型、难度、知识点等进行筛选;也可以对试卷的样式根据不同的应用场景进行调整;对组成的试卷可以存档、删除、修改,并且提供Word格式的文件下载。 万方在线组卷系统与国内多家名校的近千名一线教师正式签约,建立了长期合作关系。由他们精心地为试题提供分级解析,并定期地更新试题资源,以保证与时俱进地把握近年的中、高考的考频动向,成为广大师生练习与测试的在线组卷利器。 2015年万方在线组卷应广大客(用)户的迫切要求,推出了万方在线组卷的镜像版服务。可以独立部署到客户的服务器上,实现了客户自建题库功能,增加了后台管理功能:录题、分题、答题、审题、知识树的创建,账号及权限管理,对于题目入库流程实行规范权限和分级管理。 二、产品使用说明 通过首页的主题导航,您可进入在线组卷系统。首次进入需要您先选择关注的学科。为了能更好地保存您的使用记录,建议您使用个人帐号使用在线组卷系统。组卷系统主要包括三部分:组卷中心、试卷中心和个人中心。 (一)组卷中心 组卷中心选题方式有两种:人工选题和智能选题。 1. 人工选题 可以直接对题库中的题目进行条件筛选和检索。 1) 筛选条件有:知识点、年级、类型、题型、难度、地区、年份等;在检索框内输入关键字可以实现题目全文检索。 2) 确定筛选范围和检索条件后,对于结果页面的试题进行手动添加至试题篮,可以逐一添加,也可以整页添加。 3) 添加后试题的数量和题型会在试题篮中显示,试题篮不但可以查看所选的试题的题型和数量,还可以进行清空重置的操作。 完成选题后,可以进入预览试卷进行样式调整。 2. 智能选题 点击智能选题,进入智能选题页面。 1) 选择知识点,确定题型、难度和数量,注意,添写数字时不能超出题库中检出符合条件的试题数目。 2) 保存后进入确认页面,可以就选定的知识点下的题目数量进行修改和删除,也可以在左侧知识树上继续选择追加下一个知识点,重复设置题目的操作。如果没有需要修改和追加就可以点击右侧下方的确认设置。 3) 点击确认设置后出现智能选题的结果页面,可以手动全部加入试题篮,也可以逐一加入试题篮,选题结束同人工选题一样要进入预览试卷进行样式调整。 3. 试卷预览 在下图A区可以设置卷参,有四种常见样式可选,也可以自定义样式;在如下图B区对卷体进行设置,可以通过鼠标来拖动小题进行小题的重新排序,左侧的设置与右侧的预览界面内容是相互连动的。 1) 进行卷参设置时,会弹出对话框,在相应的位置填写文本注释即可。  2) 对于单个小题,可以进行查询详情、删除、上移、下移和智能换题的操作。 3) 试卷设置完成后可以存档备用,也可以直接下载WORD,同时可以下载答题卡和查看试卷分析。 4) 如果对现有题目还存在不满意的情况还可以选择返回选题,返回选题会直接回到组卷中心的人工选题页面。 (二)试卷中心 进入试卷中心后可在如下图A区进行选择筛选条件,在如下图B区输入关键字进行试卷的名称的检索。  1. 浏览试卷 点击试卷标题和浏览按钮可以进入试卷浏览页面,如下可以对题型进行筛选。在浏览页面可以对试卷中的单个题目进行手动添加到试题篮进行组卷,也可以对感兴趣的题目加入收藏。 2. 添加收藏 点击收藏后,操作按钮变为取消收藏,同弹出提示收藏成功,收藏成功的题目会被记录到个人中心的我的收藏中,更加方便查找。 (三)个人中心 个人中心包括两大部分:一部分是我的试卷,其中记录着我保存的组卷记录和我下载的试卷记录;另一部分就是我的收藏,其中记录着我收藏的试题和系统试卷。 (四)帮助中心 在组卷中心,试卷中心,个人中心,浏览试卷页面,单击右上方问号,可进入帮助中心,观看视频。
北京万方数据股份有限公司 2021-08-23
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