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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义,而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析,还面临很多挑战。 肿瘤样本具有其独有的特点,在样本制备和单细胞分离过程中,其细胞应激反应大、坏死细胞多,为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战; 肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题,比如复杂的微环境和高度的异质性,而如何充分考虑这些难点,并从信息学的视角进行深入研究,有待建立全面、自动的分析框架; 肿瘤单细胞数据的分析,对科研人员的编程能力和分析经验要求很高,亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛,提高研究的效率。 2.解决方案 本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括: 1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案; 2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析); 3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法; 4)从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性; 5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法; 6)构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。 基于本项成果产生的产品、服务或解决方案: 1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer; 2)针对软件使用和分析结果解读的服务; 3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。 3、合作需求 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学 2022-08-30
一种时序网络与时序数据的多态聚类方法
本发明提出了多态聚类的概念,并公开了一种时序网络与时序 数据的多态聚类分析方法。多态聚类是一种针对时序网络或时序数据, 以多种标准作为相似性度量指标的聚类分析方法,包括以下步骤:首 先,如果处理对象为时序数据,则只对时序数据加工成特定的形式, 而如果处理对象为时序网络,则通过谱映射的方法把时序网络映射为 特定形式的时序数据。其次建立此时序数据的多态向量,最后,对多 态向量采用改进的同步化聚类方法聚类得到多态聚类结果。
华中科技大学 2021-04-14
一种基于 HBase 的大数据存储与检索方法及系统
本发明公开了一种基于 HBase 的大数据存储与检索方法及系统,本发明基于数据文件字段映射表, 利用 HBase?Thrift 客户端,通过定义好的 RowKey 表达式生成行键,将按行存储的数据导入到 HBase 数 据库中。在保持一致性的前提下,将数据对象的多特征值按照多种组合方式加入形成行键,与普通列值 数据组成 HBase 数据行,按不同行键组成方式存放在多张 HBase 数据表中,进行多特征值数据检索时 根据行键中的几个特征值匹配可快
武汉大学 2021-04-14
三维平行胶原纤维-蚕丝支架及其制备方法与应用
本发明提供了一种三维平行胶原纤维-蚕丝支架及其制备方法,所述支架由编织蚕丝基架和包覆在编织蚕丝基架上、下方表面的平行胶原纤维层构成,所述的编织蚕丝基架是由蚕丝编织成网孔大小为0.25~25mm2的网片结构,所述平行胶原纤维的孔隙直径大小为10~300um,所述的编织蚕丝是去除了丝胶蛋白的编织蚕丝;所述支架可作为生物支架应用于肌腱/韧带的修复;本发明三维平行胶原纤维-蚕丝支架制作方法简单,生物相容性好,力学性能佳,支架的拓扑结构与肌腱/韧带相似,能够促进其表面生长的干细胞向肌腱/韧带分化,促进肌腱/韧带再生。
浙江大学 2021-04-13
一种基于深度图像的手势识别方法与系统
本发明公开了一种基于深度图像的手势识别方法,训练数据集和测试数据集中的深度图像通过深度传感器采集得到,首先计算图像中人体区域的最小深度值,再利用深度阈值,结合人手是离传感器最近物体的预设条件,分割出深度图像中的手势;然后获取手势在三个正交平面上的投影图,分别称为正视投影图、侧视投影图和顶视投影图;接着提取三个投影图的轮廓片段包特征,并级联成原始深度手势的特征向量;最后训练分类器,对从待识别深度图像中获取的手势特征向量进行分类,得到待识别手势的识别结果。本发明还提供了相应的手势识别系统。本发明方法手势识别简单易行,推广能力强,识别准确率高,能有效克服杂乱背景、光照、噪声及自遮挡等不利因素的影响。
华中科技大学 2021-04-11
一种银铋卤化物单晶及其制备方法与应用
本发明属于光电半导体材料技术领域,具体为一种银铋卤化物单晶及其制备方法与应用。本发明改进的溶液蒸发结晶工艺,通过控制溶液浓度、溶剂挥发速率和退火温度,有效提升单晶的尺寸完整性,控制缺陷密度;具体包括:配制合适浓度前驱体溶液;量取前驱体溶液滴至柔性疏水基底上;将液滴蒸干批量获得单晶;进行热退火以释放晶格应力;所得高品质Cs<subgt;2</subgt;AgBiBr<subgt;6</subgt;单晶,元素分布均匀,具有(111)晶面择优取向和优异热稳定性。本发明方法显著缩短生产周期并提升工艺重复性。所述银铋卤化物单晶可用作高效稳定光电探测器的核心功能材料,在光探测领域具有巨大应用潜力。
复旦大学 2021-01-12
一种自动化光纤载氢装置与载氢方法
本发明提供一种自动化光纤载氢装置,包括沿光纤运行方向设置的收放纤模块、载氢模块、旋转模块、进给模块、自动锁紧模块、进排气模块、以及控制模块,所述各个模块分别与控制模块电气连接。载氢模块包括绕纤棒、水浴加热箱、载氢罐,载氢罐设置在水浴加热箱内,自动锁紧模块与载氢罐的密封盖连接,进排气模块与载氢罐的进排气口连接,绕纤棒与旋转模块和进给模块连接,同时配合收放纤模块的收放光纤,使绕纤棒在绕光纤的同时伸入载氢罐或从载氢罐伸出。本发明自动化程度高,提高了光纤载氢的生产效率;可对数公里的光纤进行载氢;避免了氢气泄露事故,提高了光纤载氢的安全性;保证了光纤在绕纤棒上的均匀绕制,提高了光纤载氢的一致性。
湖北工业大学 2021-01-12
机电系统教学实验台
“机电系统教学实验台”是北京科技大学机电工程研究所研制出的一种用于各层次机电专业或机械工程及自动化专业教学的实验设备。设备造价相当于国外同类设备的1/3~1/2。该实验设备为一台模拟的自动生产线,集机械、气动、PLC控制、交流调速和传感器等技术为一体,是一台典型的机电一体化产品。 系统概述 设备设四个加工工位,工件为35×35×8mm的方形铝件,料库中可存放15个工件。自动循环过程是: 卸料阻挡定位块升起;2.机械手爪抓取已加工工件、提升、旋转至卸料位,松开工件,工件由坡形滑道滑入工件箱内;3.卸料阻挡定位块下降;4.机械手爪转至取料位、下降、抓取工件、上升并旋转至工作台的上料位、下降、放入待加工工件;5.刀具旋转、快进;6.刀具工进;7.刀具延时停留;8.刀具快退、停转;9.旋转工作台定位销松开;10.工作台旋转90°;11.工作台定位销定位锁紧;12.推料缸送出一个工件至取料位。 除刀具旋转和工作台旋转两个运动外,其余动作均由气缸驱动,使用可编程控制器控制,通过编制难易不同的软件,即可做不同实验内容的实验。 本体装置占地750×600mm,高700mm,重量约50Kg,可以放置在一个1500×700mm的普通写字台面上,其余空间可放置一台用于编程的计算机。 机械系统 机械系统分为四个主要部件: 1.刀具进给部件:刀具旋转由一台220V、6W的交流电机驱动。转轴前端装有钻夹头,安装一把钻头做为刀具。刀具主轴由一个导杆气缸带动完成进给运动。导杆气缸上装有三个磁性开关,检测原位、快工进转换位及延时停留位。 2.工作台部件:工作台面上设有四个工位,其中一个为上下料位,与之成180°的工位是加工位,另外两个工位可增设其他加工刀具。工作台有两种形式,一种形式是电机驱动型,采用一台220V、6W的交流电机,通过i=50的减速器带动台面旋转,该电机有调速系统,调整范围是0~350转/分;另一种形式为气缸驱动型,气缸推动装有链条的推板运动,链传动带动工作台旋转。工作台由定位气缸实现工作台的定位夹紧。气缸上装有两个磁性开关,检测定位和松开两个位置。台面下端还装有三个传感器,一个接近开关检测台面的90°换位,另两个光电开关检测上下料位和加工位的工件有无。 3.运料机械手部件:该机械手属四自由度机器人。旋转气缸使大臂可在上料位、卸料位和取料位三个位置间旋转、停留。因此,旋转气缸上分别装有三个检测开关,升降气缸使机械手升降,实现提起和放下工件的动作,并有两个开关检测;机械手爪采用指形气缸并装有相应夹爪,实现夹紧和松开工件的运动,也由两个开关检测。为使大臂在卸料处停转,还设置了卸料阻挡气缸。当需要卸料时,则挡块升起,档住大臂;落下时,可允许大臂转至料库的取料位。因此,这两个动作位置也由两个磁性开关检测。 4.料库:料库可存放15个工件。出料时,推料气缸通过推杆将最下一层的工件推出,沿着出料导槽送到取料位,挡块使工件准确定位。当推杆在气缸牵引下缩回后,料库中的工件下降一层,以备下次推料。除推料气缸装有两个位置检测开关外,在料库的存料位置和取料位置分别装了两个接近开关,以检测料库和取料位处是否有料。 气动控制系统 气动控制元件均选用日本SMC的产品,并在设计中尽可能多的选择了各种不同形式的气缸。主要有导杆气缸、普通气缸、旋转气缸、薄形气缸和手指缸。意图是使学生认识不同类型的气缸,以及气动元件的选择与机械设计间的密切关系。控制阀使用汇流板安装,选择了两位五通电磁阀、三位五通电磁阀和两位三通电磁阀。气源选用普通的空气压缩机,经三联件向系统供给压力空气。各气缸的调速元件选用机构紧凑、安装方便的软管快插式管接头型单向节流阀。管路均使用软管连接,接头为快插式管接头,这样便于学生在实验中自己动手配管,多次插拔管路。 电气控制系统 电器控制系统的核心是可编程控制器。选用西门子S7系列224型产品,并配两块8入和一块16入/16出扩展模块。PLC由专用电源供电。整个系统共有41个输入点及18个输出点。用实验台上的个人电脑编出梯形图程序,由传输线将程序送入PLC中。传感器均选用日本OMRON产品. 保护开关、调速盒、端子排以及全部电气元件均安装在与实验台面垂直的立板上,所有的元件面向操作者开放,以便学生一目了然地学习电气控制原理和动手接线配线。 操作箱装在实验台面的前端,共装有显示灯及开关16个。即总开关、电源显示、手自动选择、报警显示、复位、钻头升降、定位伸缩、手指松夹、出料、转台旋转、手指升降、手指旋转、手指阻挡、钻头旋转、启动和急停按钮。
北京科技大学 2021-04-11
分离式FPGA实验箱
本发明公开了一种分离式FPGA实验箱,涉及一种教学用FPGA实验箱。该实验箱的核心板和底板采用分离式结构,核心板对底板引出多个引脚,所述的核心板可独立使用或者与核心板连接使用,所述的底板采用模块化设计,各模块在结构和功能上均相互独立。优点:能够用于教学、科研及大学生科技竞赛,既具有实用性与先进性,又具有针对性和通用性,有利于学生学习主动性、发散性思维及动手能力的培养,且维修、升级简单方便;使用范围宽、操作灵活、开放性高。
江苏师范大学 2021-04-11
汽车安全防护实验假人
汽车碰撞试验假人常使用在对人体有较大危险和不确定性的试验里,已成为评估汽车碰撞安全性不刻或缺的测试设备。假人要求最大程度上和真人类似,因此需要采用多种材料来模拟人体的不同部位。要研制出试验用的“中国造”假人,难度相当大,不仅涉及到海量基础数据的采集、加工、处理和假人的制造,最难的是制造工艺。经历上千次试验后,曹立波教授找到了合适的假人肋骨所用的阻尼材料。经过长期的研究,成功开发了包括混III 50百分位男性假人、TNO-10安全带假人、P系列儿童假人和可调规格配重假人在内的多款汽车碰撞试验假人。同时成功开发了一岁半、3岁、6岁和10岁等儿童人体有限元模型,并与儿童尸体实验进行对比,从而掌握更准确翔实的数据,更好地开展仿真对比研究。
湖南大学 2021-04-11
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