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一种新的录组测序快速建库方法
基于SHERRY方法的转录组测序建库流程如图1所示,样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA;RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后,RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断(图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子);在Tagmentation之后,转座酶会在杂合链两端加上adaptor接头,进行之后的建库PCR扩增。 基于100pg的RNA起始量,SHERRY表现出了高的read匹配率,同时可检测出近9000个基因,其中72%的基因可在三个重复样本中检测出,可重复性较好。与目前普遍应用于单细胞转录组测序的Smart-seq2技术相比,SHERRY与其建库质量不相上下,并且具较低的GC bias。此外,SHERRY整个流程仅需要5个步骤,且可在一个管子中完成,整个时间仅约4小时,其中手工操作时间不到半小时。相比之下,Smart-seq2整个耗时约为SHERRY二倍的时间,且需要一些前处理等操作;此外,包含十个步骤的NEBNext方法则需要更加多的实验室操作和时间成本。值得一提的是,在成本方面,SHERRY方法仅为其他两种方法的五分之一,将大大节省实验成本。
北京大学 2021-04-10
全自动基因测序建库仪-草履虫P3
长沙演化生物科技有限公司 2025-05-19
于录
学科专业:预防兽医学 研究方向:兽医药理学、人兽共患病 讲授课程: 本科生:环境毒理学:食品毒理学 硕士生:微生物耐药性研究进展、抗病毒分子药理学  
于录 2021-06-23
复录机
产品详细介绍1、带速:19cm/s 2、抖晃率:≤0.4(DIN WTD) 3、倒带时间:≤90S 4、工作电压:AC220±10% 5、谐波失真:≤4.5% 6、信噪比:≥50dB
天津市兴业达电子有限公司 2021-08-23
快速复录机
产品详细介绍
中国教学仪器设备上海公司 2021-08-23
快速复录机
产品详细介绍
中国教学仪器设备上海公司 2021-08-23
便携式测序设备
郭佑民教授团队利用AI技术为新冠肺炎的影像诊断“赋能”。依托专家训练,人工智能结合传统的计算机视觉技术,对新冠肺炎患者肺部病变区域进行分割、计算,可以同时获取病变区域的体积、密度、磨玻璃成分等定量参数,尤其是对于患者随访的数据,可以实时进行图相配准,精准定位病灶位置、大小,方便比较病变的消长。
东南大学 2021-04-10
便携式测序设备
该成果开发连接智能手机/移动设备使用的纳米孔仪器SmidgIon。可以通过充电接口和耳机接口与智能手机或其他移动设备连接,运行4-5小时。具备广泛的应用领域,包括疾病爆发中的冠状病毒病原体监测,分析环境样本或者农业样本,对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定,病毒宿主鉴定。建立基于测序技术和基因组学技术的健康管理多个应用场景。使用深度学习实现。其中有关测序技术平台的研发,团队研制的PDX2000高通量测序仪样机在华大运行,进行了炎黄1号基因组、唐氏综合症产前样本等高通量测序,以及生物信息分析等研究。相关成果在Lab on a Chip、Analytica Chimica ACTA、Analyst等期刊上发表,获国家发明专利授权14项和软件著作权授权1项,相关研究成果已实现企业转化。最小型化的二代测序仪仅仅实现了桌面化,体积远远大于手机配件化的三代测序仪。未来固态纳米孔(硅基、玻璃基、碳基)便携式测序仪将与手机融为一体,成为像镜头一样的手机标配部件(生物孔本质是蛋白质,需要冷藏,保质期短)。二代测序的典型场景是医院临检中心、测序公司、第三方检测中心,需要实验室场地、人员、分析软硬件等设施。三代纳米孔测序应用场景是任何人(人数以亿计的大众消费级),任何地点(任何可以使用手机的地方),任何时候(5G-边缘计算实现实时),对任何生物(所有生物包括人的最基本生物信息是DNA和RNA和它们的修饰)进行测序。
东南大学 2021-04-11
光学纳米孔测序芯片
现阶段牛津纳米孔公司所开发的MinIon测序仪尚存在若干内在缺陷,如单次使用成本极高,单次检测正确率低,检测通量小,检测速度慢等天然缺陷。在这个意义上,我国科研工作者尚存实现自主知识产权并超越国外同行的机会
南京大学 2021-04-14
安道录课大师
安道云教育科技(山东)有限公司 2021-08-23
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