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一种新的录组测序快速建库方法
基于SHERRY方法的转录组测序建库流程如图1所示，样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA；RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后，RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断（图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子）；在Tagmentation之后，转座酶会在杂合链两端加上adaptor接头，进行之后的建库PCR扩增。 基于100pg的RNA起始量，SHERRY表现出了高的read匹配率，同时可检测出近9000个基因，其中72%的基因可在三个重复样本中检测出，可重复性较好。与目前普遍应用于单细胞转录组测序的Smart-seq2技术相比，SHERRY与其建库质量不相上下，并且具较低的GC bias。此外，SHERRY整个流程仅需要5个步骤，且可在一个管子中完成，整个时间仅约4小时，其中手工操作时间不到半小时。相比之下，Smart-seq2整个耗时约为SHERRY二倍的时间，且需要一些前处理等操作；此外，包含十个步骤的NEBNext方法则需要更加多的实验室操作和时间成本。值得一提的是，在成本方面，SHERRY方法仅为其他两种方法的五分之一，将大大节省实验成本。
北京大学
2021-04-10
于录
学科专业:预防兽医学
研究方向:兽医药理学、人兽共患病
讲授课程:
本科生:环境毒理学:食品毒理学
硕士生:微生物耐药性研究进展、抗病毒分子药理学
于录
2021-06-23
录井安全的云模型系统
一、项目进展
创意计划阶段
二、负责人及成员
姓名
学院/所学专业
入学/毕业时间
学号
黄胤秋
计科院网络工程
2017.9/2021.6
201731063414
曾文杰
计科院软件工程
2017.9/2021.6
201731062520
倪江原
计科院软件工程
2017.9/2021.6
201831062413
王柄钞
计科院软件工程
2017.9/2021.6
201731062518
三、指导教师
姓名
学院/所学专业
职务/职称
研究方向
杨力
计算机科学学院
副教授
软件工程
四、项目简介
本项目通过云模型建立云滴代替传统模糊推理过程，通过采集录井过程的安全参数，在此基础上计算期望、熵和超熵进行定性概念到定量的转换，建立规则集合，然后建立正向云发生器和逆向云发生器，最后采用云模型处理数据实现一套完整的云推理过程，最后提出了基于云模型处理的综合录井安全预报方法。利用该方法构建相关云推理系统，保证录井安全预报的准确性并及时采用应对措施。
西南石油大学
2023-07-20
便携式测序设备
郭佑民教授团队利用AI技术为新冠肺炎的影像诊断“赋能”。依托专家训练，人工智能结合传统的计算机视觉技术，对新冠肺炎患者肺部病变区域进行分割、计算，可以同时获取病变区域的体积、密度、磨玻璃成分等定量参数，尤其是对于患者随访的数据，可以实时进行图相配准，精准定位病灶位置、大小，方便比较病变的消长。
东南大学
2021-04-10
便携式测序设备
该成果开发连接智能手机/移动设备使用的纳米孔仪器SmidgIon。可以通过充电接口和耳机接口与智能手机或其他移动设备连接，运行4-5小时。具备广泛的应用领域，包括疾病爆发中的冠状病毒病原体监测，分析环境样本或者农业样本，对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定,病毒宿主鉴定。建立基于测序技术和基因组学技术的健康管理多个应用场景。使用深度学习实现。其中有关测序技术平台的研发，团队研制的PDX2000高通量测序仪样机在华大运行，进行了炎黄1号基因组、唐氏综合症产前样本等高通量测序，以及生物信息分析等研究。相关成果在Lab on a Chip、Analytica Chimica ACTA、Analyst等期刊上发表，获国家发明专利授权14项和软件著作权授权1项，相关研究成果已实现企业转化。最小型化的二代测序仪仅仅实现了桌面化，体积远远大于手机配件化的三代测序仪。未来固态纳米孔（硅基、玻璃基、碳基）便携式测序仪将与手机融为一体，成为像镜头一样的手机标配部件（生物孔本质是蛋白质，需要冷藏，保质期短）。二代测序的典型场景是医院临检中心、测序公司、第三方检测中心，需要实验室场地、人员、分析软硬件等设施。三代纳米孔测序应用场景是任何人（人数以亿计的大众消费级），任何地点（任何可以使用手机的地方），任何时候（5G-边缘计算实现实时），对任何生物（所有生物包括人的最基本生物信息是DNA和RNA和它们的修饰）进行测序。
东南大学
2021-04-11
光学纳米孔测序芯片
现阶段牛津纳米孔公司所开发的MinIon测序仪尚存在若干内在缺陷，如单次使用成本极高，单次检测正确率低，检测通量小，检测速度慢等天然缺陷。在这个意义上，我国科研工作者尚存实现自主知识产权并超越国外同行的机会
南京大学
2021-04-14
单细胞基因组学高通量测序技术体系的建立及其生物医学应用
发展了国际领先的完整的单细胞高通量测序技术体系，将其创造性地应用于人类发育生物学和生殖生物学的前沿研究，并进一步在深入的基础研究基础上推广到临床应用上，使我国胚胎植入前遗传诊断技术处于世界领先水平。
北京大学
2021-02-22
变电所故障录波分析装置
牵引变电所故障录波装置按原电力部部标《220-500kv电力系统故障动态记录技术准则》（DL/T553-94）设计。采用32位微处理器，能在lms内完成模拟量和开关量的采集，所有通道同步采样，采样频率不低于原电力部部标规定的30KHZ。由便携式上位机（或由变电所综合自动化系统、运动系统）通过接口与本系统通信，对故障数据、波形进行分析。本系统能准确、及时地记录故障状态下变电所各支部电流、电压波形，相关继电器信号，以及开关设备的动作时序，并形成相应的波形图和开关信号时序图。系统能在故障后完整地再现事故发生的全过程以及继电器信号、开关动作的全部细节，以便技术人员或专家系统对故障进行辨识。在运行中本系统处于不断的高速巡检和动态记录状态。为了不丢失短路电流起始波形，准确捕捉短路瞬间，系统具有一定的提前量（500ms）及时启动记录信号。 牵引变电所故障录波装置具有体积小、接线简单、操作方便、应用软件丰富等特点，牵引变电所故障录波装置为铁道电气化牵引供电系统提供了一套极好的在线监视设备，必将进一步提高牵引供电系统运行的可靠性和安全性。
西南交通大学
2021-04-13
纳米孔靶向测序检测方法
介武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法，能大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性，阳性检出率仅为30％至50％，从而导致临床高度疑似新冠感染患者或低病毒潜伏的“假痊愈患者”检测“假阴性”现象频发。此外，qPCR核酸检测无法同时检测其他秋冬季高发、症状与新冠相似的其他呼吸道病毒，给疫情防控和患者分流管理带来极大挑战。
武汉大学
2021-04-10
两核苷酸合成测序技术
基于不同核苷酸参与合成反应产生检测分子均相同的原理，采用天然核苷酸为原料，按照二核苷酸同时合成获取测序编码信息，将待测序列进行两次循环测序，得到两组编码序列片段，最后解码、并组装出待测DNA模板的准确碱基信息（Pu D, et al. Analytica Chimica Acta, 2014,852,274-283；肖鹏峰，等.“一种两核苷酸合成DNA解码测序方法”，中国发明专利，ZL 2012 1012 8597.9）。该测序技术的两次循环测序可用于未知模板的高通量DNA测序，一次循环测序可用于低通量PCR产物的测序；可以获得更长的DNA测序长度、且提高检测灵敏度。
东南大学
2021-04-13