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曙古菌门(Aigarchaeota)微生物基因组代谢特征和起源进化研究
通过比较基因组和进化基因组学分析发现:Aigarchaeota和Thaumarchaeota由共同祖先分化形成,其祖先早期共同生存于高温环境中,至今生存于高温热泉中的Thaumarchaeota与Aigarchaeota仍呈现较高的功能相似性。它们的共同祖先共享1154个基因家族,其数目甚至超过现存Aigarchaeota基因家族数目,表明二者祖先的高度相似性。广为人知的Thaumarchaeota早期并无氨氧化能力,而是后期于高温生境中进化所得,随后Thaumarchaeota扩散至海洋生境中,由于海洋生境中氮源的匮乏,因此Thaumarchaeota展现出独特的竞争优势,而被保留于海洋生境中,从而实现高温氨氧化古菌向中温环境的转变。       本研究通过重构未培养古菌类群Aigarchaeota基因组信息,揭示其潜在的代谢潜能及其遗传多样性获得机制,并结合数据库中已有Thaumarchaeota和Aigarchaeota基因组进行比较基因组学和进化基因组学分析,勾勒出这两个近缘支系的演化历史场景,指出古菌类群 Thaumarchaeota和Aigarchaeota的共同祖先起源于高温生境,频繁的水平基因转移极大地提升了两者对各自生境的适应性,该研究极大地促进了我们对古老且神秘的古菌支系的认知。
中山大学 2021-04-13
一种鱼肠道微生物宏基因组总DNA的提取方法及试剂盒
本发明提供的一种鱼肠道微生物宏基因组总DNA的提取方法及试剂盒,其包括:(1)鱼样品取样及鱼体表微生物固定处理;(2)肠道微生物的获取及菌体的收集;(3)细胞的包埋与裂解;(4)DNA的提取;(5)DNA保存。试剂盒主要成分:溶液A:为Tris、EDTA的混合溶液;B为Tris、EDTA、NaCl、PVP、异硫氰酸胍、Triton?X100、PMSF、β?巯基乙醇的混合溶液;C为Tris、EDTA、NaCl和DTT的混合溶液;溶液D为蛋白酶K、溶菌酶、Tris、NaCl、SDS的混合溶液;E为Tris饱和酚和氯仿混合液;F为异丙醇;G为乙醇水溶液。本发明得到的DNA片段纯度高,宿主及宿主体表微生物DNA含量少。
青岛农业大学 2021-04-13
材料基因组工程
交叉集成上海交通大学在材料科学与其他科学与工程领域的综合优势,协同发展基于材料基因组理念的材料学理论与计算、实验、数据技术,加速创新在新模式下材料研究与应用。牵头建立校级“上海交通大学材料基因组联合研究中心”学科交叉平台;与MIT的Gerberd Ceder教授合作共建基于The Matenals Project的材料基因组亚洲中心;作为主要成员参与共建“上海市材料基因组工程研究院”;联合上海同步辐射光源共建“材料高通量原位制备和表征线站”
上海交通大学 2023-05-09
新型冠状病毒的基因组序列
2020年2月4日上海复旦大学公共卫生学院张永振团队在《自然》杂志发表了与中国呼吸道疾病爆发相关的病毒的基因组序列,该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。 张永振及同事研究了一名41岁的男性海鲜市场工人,其于2019年12月26日在武汉一家医院住院,表现出呼吸系统疾病症状,包括发烧、胸闷和咳嗽。联合使用抗生素、抗病毒药和糖皮质激素进行治疗,但患者表现出呼吸衰竭,治疗三天后病情无改善。团队对从患者收集的支气管肺泡灌洗液(肺分泌物)进行了基因组测序。他们鉴定出了一种新型病毒,并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒有89.1%的核苷酸相似性。尽管从单个患者的分析中不可能得出该冠状病毒是当前疫情爆发原因的结论,不过团队的这些发现已被针对其他患者的独立调查研究证实。 
复旦大学 2021-04-10
金属微生物防腐
已有样品/n研究发现SRB在厌氧条件下大量繁殖,产生粘液物质,加速垢的形成,造成注水管道的堵塞,且管道设施在SRB菌落下发生局部腐蚀,以致出现穿孔,造成巨大的经济损失。微生物腐蚀并非是其本身对金属的侵蚀作用,而是微生物生命活动的结果间接地对金属腐蚀的电化学过程产生影响,其关键在于生物膜内及其与金属基体间的相互作用。生物膜是环境中的微生物附着在物体表面, 并以非常复杂的方式相互作用而形成的, 从而在生物膜/金属界面上产生一个不同于本体溶液的特殊环境。市场预期:目前主要采用化学试剂抑制微生物引起的金属腐
中国科学院大学 2021-01-12
微生物菌剂
本品是一种超浓缩、高活性、多菌种、多功能复合微生物制剂。它是有生命的活体肥料,它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成。公司采用国际尖端科技,使复合微生物有益菌在土壤及作物根表、根际以及体内定植、繁殖。在生产应用中具有以下显著特点:1.减少化肥用量高达30%--60%微生物经再增植后含有大量的固氮菌,可以大大提高土壤中的中微量元素含量,减少氮磷钾和其它中微量元素的施用量;同时含有多种高效活性有益微生物菌,增加土壤有机质,加速有机质降解转化为作物能吸收的营养物质,大大提高土壤肥力,减少化肥用量。 2.增产效果明显配方科学、营养全面,有机无机微生物三元相互促进,以肥养菌、以菌促肥,强根壮根、有效解决根系衰弱造成的养分吸收障碍,有效解决土壤养分不均衡问题,由于菌剂的代谢过程中释放出大量的无机有机酸性物质,促进土壤中微量元素硅、钙、铁、镁、钼等的释放及螯合,从而使作物增产高达20%—60%。改善作物和农产品的品质,使农民增收。
山东沃土生物科技有限公司 2021-09-08
热泉微生物培养策略
通过高通量测序及共现网络分析预测热泉菌席微生物的互作模式的思路,实现了绿弯菌的定向分离(图1)。通过对潜在互作的微生物验证,确定了一株具有广泛促生活性的菌株Tepidimonas sp. SYSU G00190W;基于此,团队建立了基于物种互作的“SCM-定向分离”策略,成功分离到大量之前难以培养的微生物类群;最后作者还对其基因组和代谢组做了进一步机理解析和实验验证。 本研究首次应用网络预测的方法实现了热泉菌席生境中未培养绿弯菌的定向培养。基于两株代表性菌株的互作研究,初步阐明了热泉菌席中绿弯菌(自养微生物,优势类群)和温单胞菌(异养微生物,稀有类群)之间的互作关系,并为理解贫营养生境中优势类群与稀有类群的相互作用奠定了一定的基础,提出的分离策略为其它环境中难培养微生物的可培养化提供了思路。
中山大学 2021-04-13
微生物有机肥
微生物活体制剂,含有多种植物生长有益微生物,能够产生多种拮抗物质,抑制土壤病原菌,可有效抑制线虫和其它病虫害的传播与发生;促进植物根系发育、生长;降解土壤有机物料,降低重茬障碍;改善土壤结构、板结等,提高植物有益微生物种群数量,形成有益植物生长的土壤微生物种群结构。
山东凯翔生物科技股份有限公司 2021-09-09
催化臭氧氧化与微生物降解近场耦合技术
        对于难降解工业废水的处理,单独催化臭氧氧化技术存在臭氧剂量大、气体回收难、出水毒性高等问题,而单独生物降解处理难降解有机废水周期长、设备成本高。催化臭氧氧化与微生物降解近场耦合工艺则将按序进行的催化氧化装置和生物挂膜装置两个处理单元合并,利用催化臭氧技术提高难降解有机废水的可生化性,同时采用生物膜技术减少后续处理成本,能够实现低成本提高COD、色度和浊度去除率的效果,同时降低出水毒性,减少环境生物风险。
东北师范大学 2025-05-16
微生物采油调控技术
我国面临着能源短缺与大量石油资源未能有效开发利用的突出问题,目前平均石油采收率 不及35%,约有2/3的石油资源留在地下有待开发。微生物采油是一项经济有效的提高原油采 收率技术,该技术具有成本低、不伤害储层、环境友好等特点,符合能源与环境协调可持续发 展的战略方向。近10年来,针对微生物采油技术的难题进行攻关,系统地研究了微生物在位繁 殖效应与驱油机制和微生物驱油传递与界面反应过程,提出并建立了驱油过程中微生物在位繁 殖效应模型;引入现代分子生物学技术,发展了油藏微生物群落结构与功能微生物的动态监测 与评价技术;开拓性地建立了微生物采油调控技术体系。
华东理工大学 2021-04-11
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