鉴于COVID-19是一种新的传染病，科学家仍然对此知之甚少。目前，COVID-19缺乏有效的治疗药物。迄今为止，尚未完成和报告任何临床干预试验。由于治疗和预防疾病的紧急情况，有必要研究和开发有效的COVID-19干预方法以促进疾病控制。自COVID-19爆发以来，中国许多研究人员立即开展了临床研究计划，旨在解决COVID-19的治疗，预防和诊断问题。但是，到目前为止，仍然缺乏系统的报告来分析注册临床试验的特征和存在的问题。因此，该研究对COVID-19的临床试验进行了首次系统评述，以便为控制COVID-19提供证据。  各地区注册临床试验的发起人地址 该研究检索了中国临床注册中心和ClinicalTrials.gov的数据库，收集已注册的COVID-19临床试验。检索起始日期为2020年2月9日。总共获得了75项COVID-19注册的临床试验（63项干预性研究和12项观察性研究）。97.3％的临床试验是由中国组织发起的。只有11个试验开始招募患者，所有注册的临床试验尚未完成。大多数试验是早期的临床探索性试验或处于试验前阶段（只有2项Remdesivir处于Ⅲ期试验），并且招募的样本量很小。主要干预手段包括中药治疗，西药治疗和中西医结合治疗。受试者主要是非严重的成年患者（≥18岁），主要结果是临床观察和检查。大多数试验的持续时间超过5个月，干预研究的中位数为180 天，观察期的中位数为334 天。总体而言，干预注册试验和观察试验的方法学质量均很低。总而言之，正在或将在中国进行使用中药和西药进行的COVID-19的无序和深入的临床试验。但是，由于质量差，样本量小且完成时间长，将在未来相当长的一段时间内无法获得有关COVID-19治疗的可靠，高质量的临床证据。在中国进行COVID-19的临床试验时，值得提倡和建议提高研究设计的质量，对有前景的药物进行优先安排以及使用不同的设计和统计方法。

南方科技大学与深圳国家感染性疾病临床医学研究中心/南方科技大学第二附属医院（深圳市第三人民医院）等联合，从临床新冠肺炎病例获取生物样本，首次使用冷冻电子显微镜观察到了新冠病毒经灭活后的真实形貌，为新冠病毒的识别、鉴定和临床相关研究提供重要的超微影像基础。该成果于当地时间2020年3月5日发布在生物领域最大的预印本发行服务BioRxiv上。自从2019年底新冠肺炎疫情爆发以来，南方科技大学冷冻电镜中心与深圳国家感染性疾病临床医学研究中心/南方科技大学第二附属医院（深圳市第三人民医院）等成立联合研究团队，启动对新冠病毒感染肺炎以及新冠病毒分离、培养、鉴定及结构解析等系统性研究分析。联合研究团队依托南方科技大学第二附属医院（深圳市第三人民医院）生物安全III级实验室条件，在2020年1月27日从1名新冠肺炎患者肺泡灌洗液中分离出病毒株，并迅速完成基因组测序和鉴定，及时向全球流感信息共享平台（GISAID注册编号：EPI_ISL_406594）注册共享信息，把其命名为“BetaCoV/Shenzhen/SZTH-003/2020”的新冠毒株。随后进一步完善了实验室病毒扩增、纯化及灭活技术，并综合应用间接免疫荧光法（IFA）、酶联免疫吸附试验（ELISA）、和基因组序列与谱系分析多种方案核实和确认灭活的新冠病毒。随后南方科技大学冷冻电子显微镜中心专家，利用冷冻电子显微镜分析技术，不仅首次观察到了真实的新冠病毒经灭活后的形貌，并且捕捉到了该病毒侵染宿主细胞中的一个重要中间状态。此时病毒正处于识别和附着宿主细胞后，准备与细胞发生融合的时期。经国内外文献检索，这是新冠肺炎疫情爆发以来，科研工作者首次在冷冻电子显微镜下观察到新冠病毒全病毒的真实形貌。冷冻电子显微镜避免了常温电子显微镜对生物样品的脱水、染色等破坏作用，最大限度地保持了生物样品生理状态下的真实形貌。联合研究团队现正在进一步揭示新冠病毒超微结构、病毒侵染人类宿主细胞的特性、与新冠肺炎临床预后关系。在深圳市的大力支持下，联合研究团队正在打造高等级生物安全临床冷冻电子显微镜研究平台，全力推进新冠病毒以及其他致命性病毒的超微结构生物学研究，为传染病病原鉴定、公共卫生突发事件防控和潜在的抗体、疫苗和新药研发提供坚实的科学基础。

新型冠状病毒（SARS-CoV-2）感染对孕妇造成的后果尚不确定，至今没有证据表明会对母亲和婴儿产生严重的后果。但是，严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒和中东呼吸综合征（MERS）冠状病毒可能导致不良的妊娠结局。近期寨卡病毒的防治经验也表明，当新的病原体出现时，医疗界应做好最坏的准备。因此，迫切需要对面临SARS-CoV-2感染风险的孕妇提出临床管理规范。来自瑞士、中国、美国和法国的专家联合制定的诊疗规范可协助一线医务人员进行临床管理，本规范于2020年3月3日在线发表于国际传染病学顶尖期刊《柳叶刀·传染病》。            引起严重急性呼吸综合征（SARS）和中东呼吸综合征（MERS）的冠状病毒可导致严重的不良妊娠结局，例如流产，早产，子宫内生长受限和产妇死亡。病毒的垂直传播尚未在2019年新型冠状病毒病（COVID-19）中发现，但怀疑其中1例是围产期传播。妊娠期间感染SARS-CoV-2的后果尚不确定，到目前为止，尚无证据表明母婴严重结局。然而，应该考虑这种可能性。寨卡病毒的最新经验表明，当出现新病原体时，医疗界应为最坏的情况做好准备。因此，对有SARSCoV-2风险的孕妇的管理建议迫切需要感染。为此，该兰州大学文章提出了针对医疗服务提供者的详细管理方法。      在准则中，我们建议在过去14天内曾在受SARS-CoV-2感染的国家中旅行过或与确诊SARS-CoV-2感染的患者密切接触的任何孕妇均应接受 SARS-CoV-2核酸扩增试验，即使无症状。实验室确认无症状的SARS-CoV-2感染孕妇应在家中自我监测COVID-19的临床特征至少14天。 由于宫内生长受限的潜在风险，应每两个月用胎儿生长超声检查和多普勒评估对这些患者。患有COVID-19肺炎的孕妇应由三级护理中心的多学科团队进行管理。当符合败血症相关的器官衰竭评估标准时，应将患者转移到重症监护病房。对于已确诊感染的孕妇，分娩时机的选择应根据妊娠周以及母体，胎儿和分娩条件而定。 只要有可能，应主张通过引产进行阴道分娩，以避免患者不必要的手术并发症。败血性休克，急性器官衰竭或胎儿窘迫应促使紧急剖宫产。应对SARS-CoV-2阳性的母亲的新生儿隔离至少14天，或者直到病毒清除为止，在此期间，不建议直接母乳喂养。这些建议应适应当地的卫生保健机构，以及SARS-CoV-2和COVID-19的任何进一步更新。

该研究首次鉴定到定位于线粒体的dsRNA受体ZNFX1，发现其通过与线粒体上的接头分子MAVS相互作用，在病毒感染的早期诱导I型干扰素（type I IFN）等ISGs的产生，从而正调控RIG-I介导的抗病毒免疫应答。该研究不仅为抗病毒免疫复杂性的理解提供了新的见解，也为病毒感染性疾病的诊断和治疗提供全新的分子靶点。另外，由于ZNFX1属于RNA解旋酶SF1家族的分子，该研究有望开启对SF1家族分子天然免疫功能的全面探索。 在此基础上，课题组进一步对IVT-SAPAS的测序数据进行深度挖掘，并利用siRNA筛选了数十个在病毒感染后发生表达量显著变化的基因，发现RNA解旋酶SF1家族成员ZNFX1具有显著抑制RNA病毒复制的功能。进一步功能分析表明，ZNFX1是一个干扰素诱导基因（interferon stimulated gene, ISG），定位于线粒体外膜上。病毒感染后，ZNFX1通过ARM和P-loop结构域结合病毒的dsRNA，并与定于线粒体的接头分子MAVS相互作用，激活I型干扰素信号通路，发挥抑制RNA病毒复制的功能。由于在静息状态下，ZNFX1具有较高本底蛋白表达，提示ZNFX1在RNA病毒感染早期阶段，即可通过诱导IFNs和ISGs表达形成对RLRs信号通路的正反馈调节。       值得一提的是，徐安龙教授课题组本年度还通过文昌鱼免疫学研究，发现了另一个进化上高度保守的dsRNA识别受体DDX23。通过回溯到哺乳动物中开展比较免疫学研究，发现DDX23主要定位于细胞核内。在病毒感染早期，DDX23可从细胞核转位到细胞质，通过识别病毒来源的dsRNA并激活type I IFN等ISGs的表达，正反馈调节RIG-I介导的抗病毒信号通路。

2020年2月7日，首都医科大学附属北京安贞医院朱光发及解放军总医院解立新共同在国际顶级医学期刊JAMA 在线发表题为“Epidemiologic and Clinical Characteristics of Novel Coronavirus Infections Involving 13 Patients Outside Wuhan, China”的研究，该研究报告了北京医院收治的13例确诊为2019-nCoV感染的患者的早期临床特征。 在该研究中，患者的中位年龄为34岁。2019年nCoV流行后（平均住院时间为2.5天），有12名患者到了武汉，一名患者与武汉没有任何已知的接触。十二名患者报告住院前发烧（平均1.6天）。症状包括咳嗽（46.3％），上呼吸道充血（61.5％），肌痛（23.1％）和头痛（23.1％）。4名患者进行了胸部X光片检查，而9名进行了计算机断层扫描。在6例患者中，在右肺或双肺中均观察到毛玻璃样混浊。截至2020年2月4日，所有患者均康复，但仍有12名患者在医院被隔离。 该病例系列提供了有关武汉以外地区疾病流行病学的信息。大多数患者来访或与武汉人密切接触，但有1名患者没有，表明北京可能存在主动病毒传播。为防止病毒大规模传播到中国其他城市，将需要进行严密监视。这些数据有助于了解2019-nCoV的早期临床表现。

中央指导组专家组成员、首都医科大学附属北京中医医院院长刘清泉团队与中央指导组专家组成员、中国工程院院士张伯礼团队合作完成的《中医药防治新型冠状病毒感染的肺炎各地诊疗方案综合分析》（以下简称《诊疗方案综合分析》），该研究在线发表于《中医杂志》。作为科技部“新型冠状病毒感染的肺炎疫情科技应对”应急攻关项目，该项研究全面收集并整理相关信息, 汇总分析我国卫生管理部门发布的系列《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》(简称“国家《方案》”)及各地区《方案》，对新型冠状病毒感染的肺炎中医证候分型、分期以及方药特点进行梳理，总结规律，以期为中医药防治此次疫情以及快速应对同类疫情。 研究团队对治疗性方案进行了比较分析：国家《方案》将新型肺炎按照病程进展，将治疗期分为寒湿郁肺、疫毒闭肺、内闭外脱、肺脾气虚四型。21个涉及治疗的地方《方案》中，对该疾病的分期分型基本遵循了病情由轻到重，邪气由表及里的规律。将新型肺炎分为医学观察期、治疗期的有山西、河北、宁夏、上海、内蒙古；按照病情轻重分型的有浙江、陕西、天津、北京、福建、重庆；21个地区 《方案》分型均涉及了中医证候。  《诊疗方案综合分析》通过梳理分析24个地区《方案》，认为各地中医在新型肺炎的证候分型和传变规律上认识是一致的，均在国家《方案》基础上，结合了本地区气候、人群特点从不同角度完善了证候分型，提出了具体化的防治措施，为我国战胜此次重大疫情给出了科学权威的中医方案。 该项研究还对方药推荐情况进行了梳理：治疗性地方 《方案》中仅列出药物组成，而未列出方剂名称的有26处，观其药物组成，多为数个经方合用加减化裁而成，具有明确名称的中药方剂共40种，中成药32种。按照应用频次排序，中药方剂中麻杏石甘汤频次最高为15次；其次为宣白承气汤和升降散；中成药中，安宫牛黄丸频次最高为15次，其次为血必净注射剂和连花清瘟胶囊（颗粒）。 通过分析，研究团队建议：１.随着病例的增多，应主动开展临床证候学调查，掌握临床第一手资料，根据病患临床表现，经过专家认真分析，进一步总结疫情病症特点，证候演变规律，从而完善全国防治 《方案》；２. 希望各地在全国《方案》 基础上，结合具体情况，因时、因地制宜，继续调整、优化本地区中医药防治 《方案》；３.在临床实践中注重总结治疗经验，观察病情转变规律，总结有效方药，不断完善方案，并将经验转化为临床评价证据；４.此次疾病恢复期，虽然两次病毒核酸检测阴性符合出院标准，但患者还有乏力、干咳、憋闷等症状，肺部影像仍有散发阴影，此时中医辨证多为气阴两虚、痰瘀阻络，可以采用益气养阴、通络散结法治之；５.建议在 《方案》制定及实践应用中，注重防治结合，充分发挥中医 “治未病思想”。在不同阶段采取有效措施，未病先防，已病防变，愈后康复，全程发挥中医药作用。

四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室研发的新冠病毒重组蛋白疫苗已开展动物实验，该实验室发挥自身的技术优势，联合浙江特瑞斯药业、成都国家GLP中心、四川省人民医院以及国药成都生物制品研究所等单位进行协同攻关。 该疫苗的研发得到了四川省、教育部与科技部以及成都市等方面的高度重视与大力支持。研究团队力争在3-4个月内，通过小鼠、兔与猴等动物实验与一系列的研究，证明该疫苗的有效性与安全性，向国家进一步申报人体临床试验。 新冠病毒重组疫苗动物实验研究

9新发现的小型基因编辑工具SauriCas9兼具活性和编辑范围优势）

01. 成果简介 荧光原位杂交（Fluorescence in situ hybridization，FISH）是一种以荧光标记取代同位素标记而形成的新的原位杂交方法。其通过杂交探针序列及其荧光，能提供标记位点在细胞核内的空间位置信息，与基于染色质构象捕获（Chromatin Conformation Capture，3C）等各种生物技术（如4C，5C，HiC，ChIA-PET等）互补，成为研究染色质结构不可或缺的重要技术之一。 传统的荧光原位杂交技术一般以含有目标物种来源的一段完整基因组片段作为模板，通过生物酶的作用进行片段化，之后进行荧光标记做出杂交探针，再固定细胞中，通过碱基互补配对原理对特定的基因组片段进行荧光标记并成像，获得具体的核内空间信息。但是，传统的原位杂交技术受限于模板本身的特性，具有准备时间长、所需模板量大、基因分辨率低、克隆中含有重复片段、需要加入物种特异的Cot-1DNA等缺点。尤其是其分辨率低的特点（分辨率在百kb的数量级），让它在应用中受到了很大的限制。 本项成果提供了一种新的针对目标核酸靶标探针的制备方法（见图1），该方法比传统的FISH技术的分辨率提高了1-2个数量级（见图2），可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的地方。该成果的具体步骤（见图1）包括：（1）获取感兴趣的靶DNA序列；（2）使用转座酶将靶DNA序列进行片段化的同时，在片段化的DNA序列两端加上接头序列；和（3）利用所述接头序列，获取所述片段化的DNA序列，以产生探针。本项成果的技术优势在于：快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA。 图1 探针制备方法的具体步骤。 02.应用前景 本项成果是一种快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA的荧光原位杂交方法，可作为现有的传统荧光原位杂交技术的可选替代方案。尤其是该方法的分辨率高，比传统的FISH技术的分辨率高1-2个数量级（见图2），因此可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的很多地方。 例如，在基因组的三维结构中，TAD（拓扑结构域）是结构和功能的基本单元。TAD内部和TAD之间的增强子和启动子发生的错误的相互作用，是一些癌症发生的根本原因。而传统的FISH技术因为分辨率的限制，探测不到这些错误的相互作用。因此本项成果在临床有着广泛的应用，可以用于癌症及一些其它疾病的极早期检测。 图2  相比于传统的BAC FISH（图上方绿条，长度为152kb），仅用1.170 kb（红条）长的TN5探针，就可以得到要标记的基因组位点的图像。 图中细胞核（蓝色）中，红色和绿色的点相互重叠，说明Tn5 FISH可以用传统的BAC FISH进行验证。黄色箭头表示用Tn5 FISH（红色通道，左上角插入图）或BAC- FISH（绿色通道，左下角插入图）进行成像。图中比例尺为5μm。03. 知识产权 本项成果已申请1项国内发明专利，目前正在申请国际专利。04. 团队介绍 本项目团队负责人为清华大学教授、博士生导师，国家首批千人。团队的主要研究方向涉及：生物信息学和基因组三维结构新方法的开发，利用细胞超分辨率成像、分子成像和生物信息学的方法进行基因组三维结构和系统生物学的研究选。团队负责人曾多次主持或参与美国NIH的R01科研项目、中国国家自然科学基金及科技部的科研项目，已发表高水平学术论文200余篇。05. 合作方式 专利许可、合作开发。06. 联系方式 邮箱：zhangxinrui@tsinghua.edu.cn

定量系统生物学是描述生命体的细胞、组织、器官以及整体水平上结构和功能各异的各种分子（包括基因、蛋白质、小分子代谢物等），以及分子在生命体的内部之间、与外界环境之间的相互作用，通过精准的分析测量技术、结合计算生物学来定性、定量构建生命的数字化模型，预测生理状态或者疾病的功能、表型和转化的前沿科学。生命体的运作是在基因调控下，由许许多多的生化反应形成