重庆大学附属三峡医院作为重庆市指定的渝东北片区新冠肺炎医疗救治定点医院，采取多学科会诊、中西医结合协同治疗等方式积极开展救治工作。中医药张先祥团队启动新冠肺炎“五位一体”临床治疗研究。研判疫情特征，拟订中医预防用处方，在全院临床科室推广应用，累计发放预防用中药汤剂2.6万袋，颗粒剂6000余袋。其中医预防用处方能够改善患者临床症状，抑制炎症反应，促进肺部炎症吸收。目前医院中医救治组形成了基本共识，在国家方案基础上，起草了附属三峡医院治疗点的中医诊疗方案，并在临床应用过程中不断优化。 在专家组的指导下，中医药累计干预患者 160人，250人次，临床证明中医药干预可以改善患者临床症状，抑制炎症反应，促进肺部炎症吸收，缩短患者住院日，降低患者费用，充分发挥了中医药的简便效廉的作用。目前出院患者住院日在 9 天左右。经过医护人员精心诊治截至2月12日，累计收治新冠肺炎确诊患者204例，治愈出院60例。 重庆大学附属三峡医院重症病区医生讨论

西南交通大学​​经济管理学院2017级硕士研究生袁韵在导师指导下与国内外多名教授共同合作研究，于伦敦时间2020年4月29日在国际顶级期刊《自然》（Nature）在线发表论文《人口流动驱动新冠肺炎疫情在全国的时空分布》（Population Flow Drives Spatio-Temporal Distribution of COVID-19 in China）。该论文构建了“人口流动-风险源模型”，模型能利用有关人口流动的匿名整合数据准确预测新冠肺炎疫情的扩散时间和地域分布，便于决策者进行有效地风险评估和资源分配。在开发该模型时，研究人员基于匿名移动电话位移数据，对在2020年1月1日至1月24日期间武汉流出或途经武汉的11478484人次进行了分析，这些人口迁移至全国31个省的296个地级市。他们的研究显示，湖北省的封城举措是非常正确的，它能及时控制传染源的传播，有效降低了各地疫情的风险。此外，研究人员发现，根据2020年2月19日武汉外流人口的分布，能够准确预测到全国新冠病毒感染者的相关频率和地理位置分布。此外，通过“人口流动-风险源模型”衍生出的一个疫情发展的基准趋势和一个指数，可以用来评估随着时间的推移不同地区新冠病毒传播的风险。与大多数流行病学预测模型不同的是，他们团队构建的模型基于人口的实际流动情况来预测疫情的地域分布和传播趋势。对于新冠肺炎疫情，该模型至少提前一周预测了全国范围内的病例感染情况和地理分布。团队的研究结果能够对各地疫情风险的大小进行预警，并探测出社区传播严重的地区，在疫情发展的早期为相关部门提供决策依据，以便其能够及时采取应急措施。论文作者在摘要中提到，任何国家的决策者都可以使用这种方法，利用现有的人口流动数据进行快速而准确的风险评估，并在疫情爆发之前规划有限的资源分配。本文的作者之一，美国耶鲁大学教授尼古拉斯·克里斯塔斯基称：“这项研究结果揭示了中国有关新冠病毒案例报告的准确性，从不同来源获得的完全不同的信息（移动通信显示的人口流动）可以很好地预测病例数，这符合流行病学的预期（至少在2月19日之前）。”该项研究发布后，国际上有BBC等30多个新闻媒体报道，国内媒体也有许多报道，其中，央视国际电视CGTN、中国日报、中国科学报、环球时报、文汇报、中新网等政府官方媒体都强调了这项研究对于疫情防控的重要意义。除了文章本身的学术贡献之外，该项研究也表明，中国的疫情研究是国际合作并且是公开透明的：论文于2020年2月18日提交至世界权威学术期刊《自然》并传递给相关的国际机构，第一时间与世界分享了我国抗击疫情的经验。此外，通过论文可以看出，我国武汉以外的疫情数据是有时空规律的，与第三方的手机流动性数据完全契合，以学术证据反驳了国际上的某些谣言和诽谤。

2020年2月24日，重庆大学附属三峡医院刘雷课题组在预印本网站medRxiv上发表了研究成果，题为“Clinical characteristics of 51 patients discharged from hospitalwith COVID-19 in Chongqing，China”，对重庆市51例新冠肺炎出院患者的临床特征进行了分析。  为了总结非武汉地区新冠肺炎的流行病学和临床特征，并探讨有效的治疗方法，研究组对重庆大学附属三峡医院收治的51例确诊为新冠肺炎的住院患者进行了一项回顾性单中心病例系列研究。 这51例患者于2020年1月20日至2月3日住院，除1例死亡外，其余50例于2020年1月29日至2月11日出院。研究组收集和分析了51例新冠肺炎患者的流行病学、人口统计学、临床表现、实验室检查、影像学和治疗数据，对入院和出院时的血常规和生化指标的变化进行比较，同时还比较了重症患者和非重症患者的临床特征。51例住院的新冠肺炎患者中，中位年龄为45岁，男性32例（62.7%）。43例（84.3%）患者曾到过湖北，其中4例（7.7%）在病发前有明确接触史，4例（7.7%）无明确接触史。 常见症状包括发烧（84.3%）、咳嗽（74.5%）和疲劳（43.1%），一些患者有明显的呼吸困难。26名患者发生淋巴细胞减少（51.0%），32名患者的C反应蛋白（CRP）水平升高（62.7%）。CT典型影像学表现为磨玻璃影（80.4%），部分患者肺炎局部实变（33.3%）。 大多数患者接受了中药汤剂治疗（54.9%），所有患者均接受雾化吸入重组人干扰素a-1注射，洛匹那韦和利托那韦片口服进行抗病毒治疗（100%）。大多数患者服用地衣芽孢杆菌胶囊来调整肠道菌群（86.3%）。10例（19.6%）患者接受了短期（3-5天）糖皮质激素治疗。与44例非重症患者相比，7例（13.7%）重症患者的年龄更大，糖尿病比例更高，大多数需要抗生素治疗和营养饮食，更有可能出现呼吸困难，其中大多数需要无创机械通气。除1例患者死亡外，其余50例均按标准出院，一般临床症状基本消失，淋巴细胞明显增多，CRP明显下降。中位住院时间为12天。 总之，对于新冠肺炎，目前尚无特殊药物可治疗，除吸氧和抗病毒治疗外，中药辩证治疗、肠道菌群调节、营养支持治疗等综合治疗均可临床获益。这项研究存在一些局限：1）样本量很小，特别是重症患者；2）大多数出院患者是非重症患者，重症和危重患者通常并发症更多，住院时间更长；3）重庆有四个新冠肺炎治疗中心，目前还未进行相关的比较分析。

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上海交通大学公共卫生学院蔡泳团队和上海交通大学医学院附属瑞金医院张欣欣团队合作完成了一项最新研究结果，分阶段估计了武汉市的新型冠状病毒感染的流行趋势，并提出在各项防控措施的有序开展下，二月下旬疫情有望得到有效控制。该研究成果2月17日已被Cell Discovery接收。 该研究采用了在学界较为认可的传染病动力学SEIR模型（Susceptible，Exposed，Infectious and Removed model；SEIR model），这是一种常用于对病毒流行趋势进行分析的模型，其参数包括感染者（S）-暴露者（E）-感染者（I）-康复者（R）、传播率、感染率、治愈率、基本再生数（R0）和有效再生数（Rt）等。 研究表明面对疫情的发生，中国采取的措施，特别是1月23日做出的武汉“封城”等断然决定，是非常有效的，这一决定和后续的一系列措施从根本上改变了疫情演变的格局。通过四个阶段的多阶段模型拟合，研究最终计算得到武汉地区感染人数可能在2月下旬出现流行高峰和拐点（两种不同暴露者E与感染者I的比例估计），高峰感染人数估计为55869-84520人。估计感染人数指的是模型中在某一时刻现存的感染人数，这些估值中包括了有明显症状的患者和潜在的无症状或症状很轻的感染者。 

2月26日，暨南大学吴建国课题组与湖北医药学院附属人民医院的刘龙在期刊Medical Virology上发表论文称，龟类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）也是潜在的新冠病毒中间宿主。研究者对比新冠病毒与SARS病毒、动物样本中发现的SARS样冠状病毒以及其他冠状病毒之间的刺突蛋白（S）指出，这一位于病毒外壳上的结构蛋白与新冠病毒侵入细胞所使用的ACE2受体间的相互作用，是决定冠状病毒宿主范围的关键因素。论文称，通过低温电子显微镜分析新冠病毒刺突蛋白的结晶体，有助于验证该蛋白与人类或其他宿主细胞间相互作用的结合点。研究团队从多个数据库中下载了ACE2受体与上述病毒的刺突蛋白序列。结构模拟中，就刺突蛋白结合作用点中一个残基（Asn501）与ACE2受体上的两个位点（41与353）的相互作用来看，比起蝙蝠，龟类与穿山甲与人类的更为近似。论文指出，目前已知龟类作为寄主能携带包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳头瘤病毒（PV）、甲鱼虹彩病毒（STIV）、甲鱼系统性败血症球状病毒（STSSSV）、龟细小核糖核酸病毒（ToPV）和中华鳖出血综合征病毒（TSHSV）等多种病毒。此外，与禁止交易的穿山甲相比，动物市场上龟类更为普遍。研究者认为，不能排除病毒感染龟类、演化后感染人类的可能。

2020年1月28日，复旦大学应天雷等团队在bioRxiv 在线发表题为“Potent binding of 2019 novel coronavirus spike protein by a SARS coronavirus-specific human monoclonal antibody”的研究，该研究首次报告SARS-CoV特异性人类单克隆抗体CR3022可以与2019-nCoV RBD有效结合。CR3022的表位在2019-nCoV RBD中不与ACE2结合位点重叠。因此，CR3022有潜力被单独或与其他中和抗体组合开发作为候选疗法，用于预防和治疗2019-nCoV感染。 该研究们首次报告SARS-CoV特异性人类单克隆抗体CR3022可以与2019-nCoV RBD有效结合。CR3022的表位在2019-nCoV RBD中不与ACE2结合位点重叠。因此，CR3022有潜力被单独或与其他中和抗体组合开发作为候选疗法，用于预防和治疗2019-nCoV感染。但是，一些针对SARS-CoV ACE2结合位点的最有效的SARS-CoV特异性中和抗体（例如m396，CR3014）未能结合2019-nCoV Spike蛋白。 

2020年2月4日，中国工程院院士、国家卫健委高级别专家组成员、浙江大学医学部教授李兰娟团队，在武汉公布治疗新型冠状病毒感染的肺炎的最新研究成果。根据初步测试，在体外细胞实验中显示：（1）阿比朵尔在10～30微摩尔浓度下，与药物未处理的对照组比较，能有效抑制冠状病毒达到60倍，并且显著抑制病毒对细胞的病变效应。（2）达芦那韦在300微摩尔浓度下，能显著抑制病毒复制，与未用药物处理组比较，抑制效率达280倍。李兰娟院士说，抗艾滋病药物克力芝对治疗新型冠状病毒感染的肺炎效果不佳，且有毒副作用。她建议将以上两种药物列入国家卫健委《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第六版)》。