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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性检测新方法,助力肿瘤精准检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学 2021-04-10
猪骨骼肌生长和脂肪发育及分布相关功能基因和调控元件的筛选、鉴定和育种价值评估
项目阶段:在研
四川农业大学 2021-04-10
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四川农业大学 2021-02-01
华为发布《教育数字化转型的发展机遇》白皮书,首次探索智慧教育成熟度评估模型
在华为全联接大会2022曼谷站期间,华为在“释放数字生产力,加速教育信息化之旅”全球智慧教育论坛上,重磅发布《教育数字化转型的发展机遇》白皮书,首次探索智慧教育成熟度评估模型,并提出以全场景教育解决方案、创新教学模式、普惠教育资源、提升科研能力、升级管理水平,加速教育行业数字化升级。
华为技术有限公司 2022-09-21
点击报名 | 建设教育强国·高等教育改革发展论坛之平行论坛“城市与高校融合发展论坛”
建设教育强国·高等教育改革发展论坛之平行论坛2025“城市与高校融合发展论坛”
中国高等教育学会 2025-05-09
专家报告荟萃⑱ | 西南政法大学副校长王怀勇:政法院校新文科建设的探索与实践
他在报告中分析了政法院校新文科建设的背景和现状,并聚焦西南政法大学新文科建设的探索、政法院校推进新文科建设的思考进行了探讨。
高等教育博览会 2025-07-02
智能化可燃性气体传感器 & 智能家居安防系列产品
智能化可燃性气体传感器具有本质安全、自动调校等优点,在多个技术指标上有明显优势,成本低于同类产品。试生产产品在龙煤集团下属煤矿试用,其稳定性、可靠性、本质安全等优点得到使用人员、领导的高度认可。产品在重庆梅安森、中国矿业大学等生产或研究单位使用、实验,其性能、优点得到有关人员认可。智能化传感器等产品与WIFI及网络技术、通讯技术结合产生的智能家居安防系列产品已完成,将作为智能家居重要成员进入千家万户。
哈尔滨理工大学 2021-05-04
一种以智能物流叉车为载体的碳排放智能监控和减排系统
本发明公开了一种以智能物流叉车为载体的碳排放智能监控和减排系统,包括能读取物流中心订单数据库中订单信息的碳排放智能减排监控系统、设于智能物流叉车上的智能物流叉车硬件终端,智能物流叉车硬件终端包括:碳排放检测装置、GPS定位装置及能控制智能物流叉车动作的中央处理器,中央处理器能将碳排放量信息与位置信息发送给碳排放智能减排监控系统;碳排放智能减排监控系统能根据碳排放量信息与位置信息、并以低碳节能的执行原则将订单分配给中央处理器,又能自动规划出叉车最优作业路径,中央处理器会根据最优作业路径及分配订单进行作
东南大学 2021-04-14
激光测距与夜视关键技术的研究与应用
本项目涉及的结合先进光信息技术和电子技术的激光夜视测距系统具有智能、高成像质量、远工作距离的优势,在物联网、汽车辅助驾驶、安防等领域都有巨大的应用价值。本项目以解决夜视系统的光源和成像、智能图像识别等难题为突破点,以提高夜视仪成像质量和目标识别度为目的,在国家项目和省部级项目的支持下,开展了大量研发工作,获得了一系列的红外成像、图像处理独创技术,开发了激光红外夜视测距系统。项目的激光夜视测距系列产品已经广泛应用于国防、平安城市、铁路、 高速公路、森林防火、油田等行业,实现全天候视频监控。
扬州大学 2021-04-14
动脉与静脉解剖放大模型动脉与静脉解剖模型
XM-416动脉与静脉解剖放大模型   XM-416动脉与静脉解剖放大模型显示动脉和静脉的立体结构,动脉三层膜比静脉三层膜厚,动脉有内外弹性膜,而静脉平滑肌及弹性组织不如动脉,静脉内孔比动脉内孔大,静脉有瓣。 尺寸:放大,50×32×22cm 材质:PVC材料
上海欣曼科教设备有限公司 2021-08-23
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