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非编码RNA的染色质结合机制研究
哺乳动物基因组的广泛转录产生了大量的非编码RNA,相比于细胞质定位的蛋白编码mRNA,这些非编码RNA如长链非编码RNA(lncRNA)、启动子和增强子关联的不稳定转录本(uaRNA、eRNA)等更倾向于结合染色质参与调控染色质结构、转录和RNA加工等过程。尽管零星报导少数RNA核滞留的现象,但为何大部分lncRNA会滞留于染色质上行使调控功能,仍是个不解之谜。上世纪80年代初,Joan Steitz通过系统性红斑狼疮患者血液抗体分离提取 U1,U2, U4, U5和U6小核糖核蛋白粒子(又称为 snRNP),揭示了它们参与RNA剪接的经典功能。近年来施一公团队系统报导了真核生物剪切体的原子结构和生化功能。然而,一直让人困惑的是,细胞内U1 snRNP的数量为什么比其它剪接相关snRNP高 2-5倍。虽然Gideon Dreyfuss和Phil Sharp等团队曾揭示U1 snRNP调控转录终止和方向的非经典功能,U1 snRNP在细胞中的丰富存在仍然是一个让人困惑的问题。为了探究lncRNA的染色质结合机制,研究者首先建立和运用一套新颖的mutREL-seq方法来高精度筛选调控RNA定位的关键序列,意外发现了U1 snRNP识别位点参与调控候选RNA的染色质滞留。相比于蛋白编码基因,lncRNA转录本含有更多的U1识别位点(同时也是潜在的5’剪接供体位点),而其基因组区域具有更少的3’剪接受体位点。并且U1 snRNP更高水平地结合在lncRNA上。随后,研究者分别使用antisense morpholino oligos(AMO)和auxin-induced degron(AID)诱导蛋白降解系统,来抑制U1 snRNA和核心蛋白组分SNRNP70的功能。研究者发现小鼠胚胎干细胞中近一半的lncRNA受U1 snRNP调控。另外,与转录调控元件关联的不稳定非编码转录本如uaRNA、eRNA等,它们的染色质结合在U1 snRNP抑制后也显著下降。研究者进一步证明了U1 snRNP直接调控成熟lncRNA与染色质的结合,而不是通过影响RNA合成、加工或降解过程的动态变化所产生的间接影响。机制上,研究者鉴定了U1 snRNP在染色质上的互作蛋白,发现U1 snRNP结合特定磷酸化状态的RNA转录聚合酶II(Pol II)。转录抑制明显降低了U1 snRNP及其所调控的非编码RNA与染色质的结合,表明U1 snRNP通过与磷酸化的Pol II互作来介导其互作RNA与染色质的结合。最后,研究者通过以lncRNA Malat1为例,进一步验证了U1 snRNP对其染色质结合的调控作用。去除SNRNP70后,绝大部分Malat1 “核斑”定位信号消失,并弥散在核质及细胞质中。同时,Malat1在活跃表达基因染色质区域的结合信号显著下降,表明U1 snRNP不仅可以将Malat1滞留在染色质上,同时也参与调控后者在染色质上的移动及其与靶基因的结合。综上,研究者提出如下模型(图1):5’和3’剪接位点在lncRNA上的不对称分布,致使U1 snRNP持续结合在lncRNA转录本上,而不能通过RNA剪接过程释放,从而介导了lncRNA的染色质滞留。磷酸化Pol II进一步介导了lncRNA-U1 snRNP复合体在染色质上的移动(mobilization)。对于大多数低丰度、不稳定的lncRNA,它们只能靶向结合邻近的染色质区域(顺式cis作用);而对于少数稳定和高丰度的lncRNA,如Malat1,U1 snRNP促进了其迁移和结合更多的靶基因区域(反式trans作用)。图1. U1 snRNP介导非编码RNA染色质结合的模式图。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2105-3
清华大学 2021-04-10
计算资源可伸缩的视频编码传输优化技术
本技术成果是主要针对视频编码新标准HEVC或H264优化技术集合,其中包括一个已授权的专利和若 干正在申请的专利
中山大学 2021-04-10
可遗传编码的组蛋白光交联标签
组蛋白的翻译后修饰对于表观遗传调控及多种生物学过程具有重要意义。一系列新的赖氨酸化学修饰(如巴豆酰化、琥珀酰化等)展示出组蛋白修饰前所未有的多样性及动态变化特征。可遗传编码的光交联探针已经成为研究活细胞内蛋白-蛋白相互作用的重要工具,成功地将该技术拓展到组蛋白的化学修饰研究中,开发了可遗传编码的组蛋白光亲和标签,将会极大地推动组蛋白化学修饰的识别机制和功能研究。该技术的设计包括两个部分:a)一套带有翻译后修饰的赖氨酸遗传编码系统,可以在特定位点插入带修饰的赖氨酸。此外,在赖氨酸的主链上还带有光交联基团,可在UV光下与修饰相关的蛋白发生共价交联,可以用于研究该修饰特定的效应蛋白。b)一套带有保护基团的赖氨酸遗传编码系统,保护基团可以在大肠杆菌自身的还原性环境中发生脱除,将带有光交联基团的赖氨酸定点插入到组蛋白当中,用于证实交联到的效应蛋白的特异性。该团队以巴豆酰化修饰为代表,发展了该技术对应的赖氨酸巴豆酰化修饰的光交联探针(K*cr)和带有保护基团的光交联探针(PNBK*)两个探针,将这两种探针分别引入到组蛋白H3的56位和79位,并通过光交联基团捕捉到了H3上79位巴豆酰化的去乙酰化酶Sirt3。
北京大学 2021-04-11
小麦耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用
本发明公开了植物耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用。本发明所提供的蛋白质为如下a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;a3)将a1)或a2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物耐热性相关的蛋白质。实验证
中国农业大学 2021-04-14
一种 APD 阵列地址编码主动输出电路
本发明公开了一种 2<sup>m</sup>×2<sup>k</sup>APD 阵列地 址编码主动输出电路,属于 APD 阵列领域;现有的无扫描输出只能实 现单点像素地址的输出;本发明提供的主动输出电路,通过地址控制 电路控制地址编码电路的输出开关,经地址输出电路输出对应的像元 块首地址,通过后续处理电路得到四个单元地址,无需复杂的时序控 制电路,效率高,速度快。
华中科技大学 2021-04-14
一种面向视频编码的背景建模方法
本发明公开了一种面向视频编码的背景建模方法,通过在图像块的基础上选择性地进行局部背景建 模、局部背景更新、局部多重背景保持,以克服现有以帧为单位的背景建模方法中存在的背景更新的最 佳时机难以确定、特定情况下背景建模困难、对周期性背景建模效率低下等问题,从而降低背景建模的 开销,提高背景模型的预测质量,最终提高视频编码的总体压缩效率。
武汉大学 2021-04-14
山东永正产业技术研究院有限公司
山东永正产业技术研究院有限公司成立于2019-07-12,法定代表人为窦霆,注册资本为5000万元人民币,统一社会信用代码为91371625MA3Q6QHC66,企业地址位于山东省滨州市博兴县经济开发区兴博三路与兴业六路交叉口往东100米路北,所属行业为研究和试验发展,经营范围包含:环境保护技术、工业废弃物资源综合利用、高分子材料、硅酸盐材料助剂、工业废弃物利用生产设备的技术研发、技术转让、技术咨询与服务、技术成果投资。
山东永正产业技术研究院有限公司 2021-09-06
偃师市正浩仪器设备有限公司
偃师市正浩仪器设备有限公司(原偃师市化电讯仪器厂),位于“九都古都”洛阳境内,距世界文化遗产龙门石窟、白马寺、少林寺等名胜古迹仅数十公里,310、207国道、连霍高速、陇海铁路等横贯境内,交通十分便利。 我公司是中国教学仪器设备行业协会会员单位,河南省教学仪器设备生产骨干企业。本公司中有中、高级专职技术人员,专业从事中、小学教学仪器、电教仪器的研制、开发、生产、经营,已有二十余年专业生产历史。 我公司凭着严格的科学管理体系,先进的生产技术手段,雄厚的技术力量,以品种全、信誉高、服务好、价位合理为经营宗旨,多次被省市工商、质监等部门评为“诚信单位”、“质量管理达标企业”,通过ISO9001-2000国际质量管理体系认证,在世行贷款招标项目中多次中标,产品销往全国二十多个省市,深受用户一致好评。 我公司以“尊重知识、奉献教育、服务社会”为宗旨,以“重合同、守信用”为原则,竭诚与社会各界新老朋友全力为教育事业做了贡献。 总经理赵治安先生携全体员工竭诚欢迎您的光临指导,并期待着与您真诚合作!
偃师市正浩仪器设备有限公司 2021-01-15
一种正渗透汲取液及其应用、以及一种用于正渗透汲取液的有 机膦化合物及其制备方法
本发明公开了一种正渗透汲取液及其应用,该正渗透汲取液包 括质量分数为 5%~50%的有机膦化合物,所述有机膦化合物具有如 式 I 所示的化学结构式,其中,m 为 1~6,n 为 0~6,x 为 0~2m+4n+8, Y 为 Na , K 或 Li<img file=""DDA0000920592790000011.GIF"" wi=""1226"" he=""539"" />本发明还公开了用于该正渗透汲取液的有机 膦化
华中科技大学 2021-01-12
字符的图形与编码相互独立的隐藏通信方法
本发明的主要目的是提供一种隐藏通信方法,其基本原理是改变字符图形与字符的编码在各种编码标 准规范中已确定的标准映射关系,采用自定义的方法进行字符图形与字符编码的映射,从而使得电子文件 显示出的字符图形与电子文件的编码分别构成显式通信信道和隐藏通信信道,这两种信道可以独立地进行 通信。 基于这种隐藏通信方法的文本数字水印技术有水印容量大、抗攻击性能好、水印难以被去除的优点。 此外,应用该隐藏通信技术制作成的自包含字符图形和编码信息的电子文件,便于现有搜索引擎利用文件 的属性进行搜索,从而增强了对这种电子文件的搜索能力。 本发明包括如下紧密相关的内容: (1)隐藏通信方法以及相关的电子文件。 (2)实现本发明的隐藏通信方法及生成相关电子文件的若干具体实现方法。 (3)两种典型的应用技术。 1.隐藏通信方法以及相关的电子文件 本发明提出一种隐藏通信方法,通过在包含字符的电子文件中添加隐藏信息进行隐藏通信。在这种 电子文件中,对于相同的字符编码,其按照标准编码规范定义的内容构成隐藏信息,按照自定义的字符编 码与图形的映射关系显示出的字符图形内容构成显式信息,从而在利用该电子文件显示出的字符图形
电子科技大学 2021-04-10
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