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代谢组学研究技术的建立及临床应用
成果简介: 项目团队建立了基于GC-MS、LC-MS的靶向/非靶向代谢组学、细胞代谢组学研究技术。重点开展重大疾病的早期诊断、生物标记物筛选、病理机制探索及药物新靶点的发现。
南京工业大学 2021-01-12
火山滑坡海啸的地震学快速检测方法
提出基于地震波观测的滑坡快速检测和滑动几何形态的分析方法,可服务于滑坡次生灾害的预警。       2018年12月22日因无预警海啸致使印尼苏达海峡沿岸城市437人死亡,几千人受灾。叶玲玲教授等利用印尼的宽频带地震波数据,发现此次海啸由滑坡引发,与2018年活跃的Anak Krakatau火山活动有关。相对于地震滑动,滑坡造成的地振动以低频成分为主,高频成分较少(图1),造成目前常规基于高频地振动信号的地震-海啸预警系统失效。雷达影像资料分析进一步证实海啸源是Anak Krakatau火山西南侧的滑坡(图2)。采用震源单力模型,长周期地震波观测约束滑坡平均倾角为12°;结合地震波和卫星遥感资料观测,得到滑动体积约为0.2 km3。这些参数为海啸模拟提供了重要约束。 在2018年印尼火山滑坡事件中, 地震波信号10分钟传播到整个苏门答腊和爪哇地区, 被几十个地震台接收,利用Wphase反演方法15分钟可得到有效的滑坡信息。由滑坡引发的海啸波传播速度较慢, 半小时后传播到附近的海岸带地区。因而该研究中基于Wphase方法的滑坡快速检测和滑动几何形态的分析方法可有效运用于该类型滑坡海啸预警中。
中山大学 2021-04-13
构建组学数据库助力肿瘤信号通路
建设消化系统肿瘤的大数据平台,通过整合肿瘤临床信息、影像数据、生物样本库数据、高通量生物多组学的数据,系统地构建消化系统肿瘤大数据,并结合人工智能平台进行大数据的挖掘与分析。该团队基于肿瘤大数据平台开展肿瘤临床诊疗的真实世界研究,探索肿瘤的精准诊断、预后预测和耐药分子机制 徐瑞华教授团队开始着手构建磷酸化定量数据库qPhos。通过收集已发表的定量磷酸化组数据,共整合了199071个磷酸化位点上的3537533个定量磷酸化信息,其中86%的数据来自肿瘤组织样本及相关细胞系。有关定量实验的详细信息,包括实验条件、实验所用的细胞系或样本等数据也纳入了数据库中。对每个磷酸化位点,都注释了实验验证的或潜在的上游激酶,以便理解其分子调控机制。同时,通过整合UniProt,ExPASy和DrugBank等数据库中的信息,对磷酸化位点所在蛋白质的生化特征、上游激酶的靶向药物情况进行了详细的注释,方便查询和使用。       此外,数据库中还开发了qKinAct分析模块,研究人员可以基于自己的定量磷酸化组数据分析得到相应的激酶活性相关磷酸化位点信息,进而分析异常的磷酸化信号通路。因此,qPhos是首个全面涵盖肿瘤和疾病相关重要磷酸化修饰动态水平的数据库,为研究蛋白磷酸化修饰及其动态调控提供了一站式服务。
中山大学 2021-04-13
宏途教育致学智慧课堂解决方案
产品详细介绍 宏途教育致学智慧课堂解决方案 宏途教育致学智慧课堂是基于AIOT的“教、学、评、练、管”教育闭环云服务平台,平台通过智能笔与码点技术采集学生课堂与作业数据,结合人工智能、物联网、大数据等技术实现手写笔迹自动分析、并基于致学全学段全学科的多维评价模型实现学生全面的学情诊断分析,为教育管理者推动教学持续发展和助力教学管理提升提供有力保障。 平台应用场景 对教师:纸笔围绕课堂教学场景,智能批改,增效减负,双向互动,提升学生动能和效能。 对学生:不改变纸笔书写习惯,保护视力,成长数据驱动智适应学习,提高学生学习兴趣。 平台优势 传统纸笔书写、保护视力 错题归集、查漏补缺 作业自动批改、减负增效 大数据及时、全面统计分析 精准资源推荐、提分提质 联系方式: 广州宏途教育网络科技有限公司 地址:广州市黄埔区科学城南翔一路62号3楼宏途教育 联系人:王生 电话:18938695151 公司官网:www.gzhtedu.cn
广州宏途教育网络科技有限公司 2021-08-23
ZL-099动物行为学视频分析系统
简单介绍: 动物行为学视频分析系统是一套通过视频摄像机和计算机,采用图像处理技术,自动跟踪和记录动物活动的通用型运动轨迹记录分析系统,可以应用在神经药理,学习记忆药理,抗衰老药理和新药神经系统一般药理毒理研究,也可用于神经科学基础研究。可进行头中尾三点跟踪,适用于Morris水迷宫实验、旷场实验、条件性位置偏爱实验、T型迷宫、Y型迷宫、八臂迷宫、高架十字迷宫、Barnes迷宫、Zero迷宫、孔洞实验、新物体识别等各种动物实验。 ZL-099除了具有自动跟踪记录动物活动轨迹的基本功能外,还具有通过事件记录器记录视频系统无法自动识别的各项动物行为事件、轨迹数据导入再分析、实验数据管理以及实时录像功能,并能够接收16路外部输入信号,控制16路外部输出信号,充分体现了自动化与灵活性相结合的优势。 详情介绍: 一.详情介绍 1.可随心设计的平台区域图形 ZL-099可以使用户根据实验目的自行设计实验平台区域,用于计算机跟踪动物在不同区域内的各项指标。ZL-099提供了圆/椭圆、扇形、多边形、环形图元,用户可以使用这些图元设计任意形状的跟踪区域,从而在实验中获取动物在跟踪区域中的各项数据。实验平台设计的灵活性使ZL-099可以更好地适用于各种迷宫实验的研究。 2.稳定可靠的跟踪算法 ZL-099为用户提供了三种跟踪算法:灰度法、背景减法和色彩识别法。灰度法适合在动物与背景间的对比度较大,背景可能会有较小变化的场景下使用。背景减法适合在背景复杂、背景灰度接近甚至与动物灰度相同,但是背景基本不变化的场景下使用。根据背景情况选择跟踪算法,能够使跟踪效果达到*佳。色彩识别法适合对着色的动物进行跟踪。ZL-099也是能够进行头、中、尾三点识别的优良软件。 3.事件统计和分析功能 ZL-099能够记录26种键盘预定义事件、16路外部输入事件、12路外部输出控制事件以及目标所在区域事件,开创性地设计了事件关系图,形象地揭示各类事件之间的相互关系,为深入用户分析动物行为提供了有利支持。 4.可视化的实验数据管理功能 ZL-099内建的数据库通过实验目录树和属性页的方式,将实验过程中产生的大量数据有机地组织起来,使用户可以很方便地查阅实验历史数据和图形,使实验数据的管理成为一个有组织的数据系统。每个实验人员可以独立创建自己的实验数据库,设置密码保护,通过简单的拷贝命令即可实现数据的备份和携带,充分保障了数据的安全性。 5.强大的综合报表功能 ZL-099的综合报表功能允许用户进行实验数据的筛选,并将筛选后的数据进行统计和分析,输出动物在各区域的持续时间、游程、进入区域的次数、潜伏期、平均速度、静止时间等指标,以选定的属性项分组统计平均值和标准误差,并将其以直方图的形式呈现出来。用户可以通过对数据图表复制、粘贴的简单操作,很快形成自己风格的实验报告。同时系统还提供了导出数据的功能,,可以将原始数据和统计分析数据导出到Excel文件中,用户可以使用如:Excel、SPSS、SAS等第三方软件进行深入的数据统计分析。   6.灵活的实验启动和结束方式 ZL-099不但提供了手动开始/结束实验方式,还提供了自动开始/结束实验、延时开始/延时结束以及远程开关启动实验方式。在自动开始/结束实验方式下,用户设置开始区域、结束区域后,系统实时监测动物所在的位置,当动物运动到设定的开始区域、结束区域时,系统自动启动跟踪任务或结束跟踪任务。远程开关方式可以使用户在远离计算机的位置启动实验,极大地方便了研究人员的操作,降低了工作强度。     7.方便快捷的手动事件记录器 ZL-099提供一个可以自定义的事件记录器,通过键盘或鼠标用户可以方便、高效地将视频跟踪系统无法自动记录的事件记录下来。用户可以按照自己的操作习惯定义各个快捷键所对应的事件,如:站立、理毛、进食、排泄等,*多可以定义26个事件。事件记录器不但记录事件,同时还将事件的发生时刻和持续时间记录下来,并对事件发生的次数和事件总持续时间进行统计分析,便于用户对动物行为进行深入研究。 8.自定义实验动物的属性模板 ZL-099允许用户定义自己感兴趣的动物属性项,并将其作为模板存放在数据库中,这个模板不但可以在当前实验中使用,而且也可以在以后的实验中复用。通过动物属性模板,用户可以储存更多的关于实验动物的信息,这些信息在后期的批量数据处理中,作为分组条件进行分组统计分析,使研究人员可以更加深入地探究各个因素与动物行为之间的内在关系。   9.实时分析和录像分析以及压缩录像功能 能够在实验的同时进行实时动物行为分析,也可以进行实验录像视频文件的分析。录像文件批处理功能只需要用户指定录像文件所在的目录即可自动进行大量录像文件的动物行为分析而不需要用户的任何介入。提供实时压缩录像功能,可以将实验图像采用通用的视频文件格式保存下来,便于后期的研究分析和备案。ZL-099系统从设计实验、预定义属性模板、设计区域平台、执行实验、数据分析到数据的导入导出,为用户提供完整的解决方案,是一个适用于多种迷宫实验的通用型视频跟踪系统。     二.性能指标 视频源 摄像机:黑白/彩色 录像机、DVD:黑白/彩色 视频文件:黑白/彩色 解析度 视频摄像机:640×480点 视频文件:≤1024×768点 算法 灰度法 背景减法 采样频率 1~20帧/秒 启动方式 手动开始/结束 延时开始/结束 自动开始/结束 远程按钮启动 输出指标 各区域持续时间及百分比、游程、进入区域的次数、潜伏期、平均速度、静止时间及百分比 总持续时间、游程、进入次数、平均速度、静止时间及百分比 运动轨迹图、直方图、事件关系图 特点 自定义属性项、可设计的区域平台图形、自定义事件记录器、实时录像     三.软硬件配置 计算机 台式机/笔记本 Intel P42G,512M内存 视频源 低照度工业监控摄像机(推荐) 数字/磁带摄像机 USB摄像头 AVI视频文件 镜头 3.5-8mm变焦、F1.2或F1.4光圈 图像采集卡 PCI/USB接口 640×480点解析度,24位真彩色 输入输出控制器(可选件) 16路继电器输出(每路4A@220V) 16路光电隔离开关量输入 照明 泛光照明 操作系统 Microsoft Windows 2000/XP/7/10  
安徽耀坤生物科技有限公司 2022-05-26
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