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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义,而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析,还面临很多挑战。 肿瘤样本具有其独有的特点,在样本制备和单细胞分离过程中,其细胞应激反应大、坏死细胞多,为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战; 肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题,比如复杂的微环境和高度的异质性,而如何充分考虑这些难点,并从信息学的视角进行深入研究,有待建立全面、自动的分析框架; 肿瘤单细胞数据的分析,对科研人员的编程能力和分析经验要求很高,亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛,提高研究的效率。 2.解决方案 本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括: 1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案; 2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析); 3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法; 4)从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性; 5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法; 6)构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。 基于本项成果产生的产品、服务或解决方案: 1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer; 2)针对软件使用和分析结果解读的服务; 3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。 3、合作需求 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学 2022-08-30
乙型肝炎病毒特异性T细胞检测试剂盒
利用已经进行功能验证的、被各种HLA-I类分子提呈的100余种HBV抗原肽,对乙型肝炎患者进行HBV特异性T细胞免疫功能状态的检测,为监测疾病进展、判断预后转归、评价药物疗效、预测复发以及评价疫苗效果等提供全新的实验室指标。目前HBV的诊断和疗效观察主要是乙肝两对半和HBV DNA定量检测。这些指标可以监测病毒复制增殖和体液免疫反应,但不能反映患者在抗病毒感染中起更重要作用的特异性T细胞免疫功能状态。本试剂盒目前在国内外市场上没有同类竞争者。
东南大学 2021-04-13
技术需求:用于检测人类白细胞表面抗原(HLA)基因型别
一、用于检测人类白细胞表面抗原(HLA)基因型别 1.本公司研发一款试剂是用于检测人类白细胞表面抗原(HLA)基因型别的。2.该试剂可检测HLA的A/B/C/DR/DQ位点的,采用PCR-SSP法,检测一人份共计需扩增112孔。引物是预先包埋在96孔板上。3.生产试剂后需要对112孔进行质检,确保每个孔的引物配制无误且能完成有效扩增。所以,质检时需要有已知型别的DNA样本进行试剂验证。4.现在产品质检存在以下问题:1.没有充足的DNA样本来源(仅为小体积血样提取的DNA,一次质检后就用完);2.没有大体积血样或细胞提取高浓度DNA的方法;3.罕见型别DNA样本很难筛选到。 二、研制具有消化黏液、保留有形成分形态及灭活功能的预处理液试剂配方 支气管肺泡灌洗液样本中有大量黏液,影响镜检检验。针对此点,拟研制具有消化黏液、保留有形成分形态及灭活功能的预处理液试剂配方。同时,将该试剂与一次性无菌标本收集器组合于一体,实现不用打开标本收集器盖子就完成预处理步骤,简化检验流程,降低生物安全风险。 三、研制针对肺孢子菌、隐球菌、曲霉、寄生虫等病原微生物的组合型染色体 研制针对肺孢子菌、隐球菌、曲霉、寄生虫等病原微生物的组合型染色液。该试剂盒拟申报体外诊断试剂二类注册证,产品开发需要整合微生物、医学检验、材料、化学、机械、软件等多学科的专业科研团队,形成相关关键技术来搭建病原微生物形态学检测平台。
江西业力医疗器械有限公司 2021-11-01
27位点单泛素分子降低树突状细胞免疫功能的方法
27位点单泛素分子降低树突状细胞免疫功能的方法,涉及基因工程技术领域。27位点单泛素分子是只保留27位赖氨酸的泛素分子,从小鼠骨髓中分离得到树突状细胞,用27位点单泛素分子预处理骨髓来源树突状细胞,再进行体外过继免疫,最后进行酶联免疫斑点实验和流式细胞术实验。实验证明,处理后的树突状细胞抗原提呈能力明显降低,其抗原特异性CTL诱生能力也降低;27位点单泛素分子可降低树突状细胞转输受体内淋巴细胞产生IFN‑γ、穿孔素、颗粒酶B的能力。27位点单泛素分子抑制转输受体脾细胞产生穿孔素和颗粒酶B由溶酶体途径实现。
厦门大学 2021-01-12
SCIENTZ08-IIIC非接触式超声波细胞粉碎机
产品说明 非接触式超声波粉碎机也叫杯式超声破碎仪,可在密闭容器、无菌、可超微量条件下进行破碎。相比传统的探头超声波细胞粉碎机,该仪器具有一次可同时检测多个样品、实验效率高、无需频繁操作探头、避免样本交叉污染等优势。仪器标配低温恒温装置(可根据客户需要选择不同型号),便于样品在4-10℃环境内工作,使能量分布均匀,超声作用 完全。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
宁波新芝生物科技股份有限公司 2021-12-08
证照阅读仪
身份证件是人们出出行时用于证明与出示个人身份信息的重要证件,故而对身份证件信息进行高效的采集与核验便显得极其重要。本中心研发了一套证照阅读仪系统。该系统不仅完成了对通用证件(各国护照、身份证、外国人居住证、港澳台居民证等)快速采集与机读,还引入了本中心最新研发的证件鉴伪防伪技术以及人脸验证技术以支持通用证件鉴伪,并对各客户端证件查验集中统一化管理。该系统极大地提高了证件查验工作的效率和准确率。
华中科技大学 2021-04-10
超声止血仪
超声止血仪是超声外科手术刀的一种,用于切割、移植重要的脏器和大血管,具有切口小、出血少、术后恢复快等优点。超声止血仪的原理是通过超声频率发生器使金属刀头以超声频率进行机械振荡,将与之接触组织中的水分子汽化、蛋白质氢键断裂、细胞崩解、达到切开或者凝固组织的效果。超声止血仪既能用于切割又能用于凝固血管,可以直接凝固直径达2mm的血管。由于手术中产生烟雾很少可以明显改善手术视野,同时又没有电流通过患者身体,因此,可以安全地在重要的脏器和大血管旁边进行分离切割手术。我国现有县级以上医院上1.5万家,预测我国有1000台的超声止血仪潜在市场,每台售价按30万元人民币计,将有3.0亿元人民币销售额。将成本降至10万元人民币,五年销售500台,约有1.0亿元人民币的利润。
北京理工大学 2021-04-13
幻影仪(产品)
成果简介:本幻影仪的用途与特点是应用电脑控制或多媒体制作的幻影技术 来演示真彩色、动态、三维物体影像的显示技术,以“看得见、摸不着”为 特点,能达到动感逼真再现的效果。 项目来源:自行开发 应用范围:幻影仪可用于人物动态造型;珍贵文物的再现;商品三维、真色彩、动态广告展示;典型历史人物三维显示,以及各种虚幻神鬼怪影的再现。 该仪器可以配合即时音响输出,具有声光影像效果。在科普馆、展览会、博物馆、游乐园、企业工厂入门正厅品牌文化宣传展示,有着
北京理工大学 2021-04-14
实时PCR仪
成果简介实时PCR是生物医学领域中的一次革命,已经广泛应用于临床分子诊断与科学研究,同时亦应用于食品安全和环境检测等领域,具有非常重要的经济与社会效益。课题组在国家重大科技专项资助下已经研发出了拥有自主知识产权的实时PCR仪的样机,正与国家疾病控制中心合作,进行性能与临床医学测试。整体样机成本低,精度高,具有明确而又急迫的市场需求。应用简介所处研发阶段:小批量生产适合应用领域:
北京工业大学 2021-04-14
康齿仪
成果与项目的背景及主要用途: 牙齿的过敏和脱钙、牙周炎、牙龈炎等是十分常见的疾病。本仪器功能强:几乎可以治疗所有的牙病和漂白、护齿。 技术原理与工艺流程简介:目前,人们治疗牙病的主要方法是口服药物与使用牙膏,但这两种方式的效果都很差。现有的牙齿脱敏仪,利用电离子对药物的导入作用,高效地将药液导入牙本质和牙周组织,但每次只能治疗一颗牙齿,效率低。本课题提出了“新型 PSPDC 电流及药物离子导入仪的改进电路”,该电路确实能提高药物导入的效率。康齿仪采用类似牙托的电极和膏体的药物(或牙膏),同时产生特定的电流波形,该波形不仅是断续恒流的波形,在无电流的输出期间,用电子开关将输出电极短路,可去除极化效应和降低离子堆积,大幅度提高药物导入的效率和治疗(脱敏和矿化)的疗效。 技术水平及专利与获奖情况:该机采用了当今最先进的微处理器技术和微电子技术。具有国家发明专利:一种药物电离子导入牙齿治疗仪(专利号:02121374.7)。 应用前景分析及效益预测:市场巨大、成本低、功能强(几乎可以治疗所有的牙病和漂白、护齿)。 应用领域:家庭保健。 技术转化条件(包括:原料、设备、厂房面积的要求及投资规模):不需特殊设备和条件。 合作方式及条件:技术入门费+产值提成:20 万+5%。
天津大学 2021-04-11
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