本发明涉及用于海洋细菌的培养装置。其包括培养箱、用于模拟水流流动的搅拌装置、用于去除杂质的过滤箱和用于控制培养箱内温度的控制装置，所述搅拌装置设置于培养箱顶部，所述过滤箱与培养箱相连通，所述控制装置设置于培养箱内侧壁上。通过搅拌装置模拟海洋细菌生存的真实水流环境，通过过滤箱对水草、藻类和部分纤维提前进行过滤，且将部分固体海洋杂质沉淀，通过析出装置使得重金属按种类不同排列在沉淀管内壁不同位置上，并通

本发明涉及用于海洋细菌的培养取样装置。其包括培养箱、用于模拟水流流动的搅拌装置、取样装置和用于控制培养箱内温度的控制装置，所述搅拌装置设置于培养箱顶部，所述控制装置设置于培养箱内侧壁上，所述培养箱底部形成有支座，所述取样装置螺纹连接于培养箱底部。通过搅拌装置模拟海洋细菌生存的真实水流环境，通过取样装置对培养箱内的含有海洋细菌的水样进行取样，在取样过程中，通过取样装置有效的避免了海洋细菌粘附在器具的外侧壁上，造成一定的污染；通过控制装置控制培养箱内的温度，满足细菌培养时对温度的要求。

光合细菌是地球上最古老的光合作用原核生物，广泛分布于海洋、湖泊和河流中，因其不仅具有极高的营养价值，可明显提高养殖动物的生长速度和抗病能力，而且具有重要的去除污染物净化环境的功能，在畜牧、水产养殖和环境治理等领域都有非常重要和广泛的应用前景与价值。 应用领域：下面都是光合细菌使用效果的文献报道。 水产养殖：可提高对虾出苗率30％左右，出苗对虾规格整齐强壮，提高了虾苗的抗病和促生长效果，同时可以改善水质。用量10毫升/立方水体。 观赏鱼病防治：可防治金鱼的烂鳃病和水霉病。用量1～4％。 轮虫养殖：对鱼、虾、蟹人工育苗养殖阶段的重要活饵料轮虫的培养具有明显的促进作用。用量0.6毫升/升。 肉奶牛养殖：奶牛日产奶量增加2～3公斤，增产幅度7－22％。肉牛日多增重0.2公斤。用量250毫升/牛日。 鸡饲养：出栏成活率提高1.9％，出栏效益增加0.57元/只。乌鸡生长率提高17％。蛋鸡产蛋率提高，蛋的品质更好。用量0.4毫升/只日。 兔饲养：兔月多增重150克，提高25％，同时提高了兔病的痊愈率和抗病能力。

本发明公开了一种鉴别革兰氏阳性细菌和阴性细菌的指示材料，这种指示材料为万古霉素和聚乙二醇修饰的金纳米粒子，能够通过目视比色法快速鉴定革兰氏阳性细菌和阴性细菌。本发明的革兰氏阳性细菌和阴性细菌的指示材料无毒、稳定、制备方法简便，鉴定细菌快速、无须使用显微镜放大设备，克服了传统染色鉴定法时间长的不足，有利于细菌引起的疾病的快速诊断。本发明还公开了这种鉴定革兰氏阳性细菌和阴性细菌的指示材料的制备方法和目视比色鉴别革兰氏阳性细菌和阴性细菌的应用，将在生物医学检验、菌属鉴别、食品安全、环境监测等方面具有良好的应用前景。

一种培养瓶，包括瓶身和底盖，底盖可拆卸的扣合在瓶身下端，瓶身下部设有圆环，底盖包括底壁和侧壁，侧壁上设有与圆环搭接的扣紧装置，侧壁上端与圆环接触部位设有第一密封垫；底壁内侧面安装第一支撑管，第一支撑管上端安装第一套筒，第一套筒外侧设置用于冲刷贴壁细胞的冲刷机构，第一套筒上端安装第二套筒，第二套筒下部外侧设置用于培养液混合的稳流搅动机构，第二套筒上端安装第二支撑管，第二支撑管上端穿过瓶盖后安装转动板，转动板通过第二支撑管可以带动第二套筒和稳流搅动机构旋转，第二套筒内安装用于驱动第一套筒和冲刷机构旋转的操作杆。本实用新型中稳流搅动机构和冲刷机构可以分别单独操作，也可以连成一体同时动作。

上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室吴更教授与武汉大学王连荣、陈实教授团队合作，揭示了细菌DNA硫化修饰中催化第一步反应的半胱氨酸脱硫酶发生构象变化，使其活性位点半胱氨酸朝向底物半胱氨酸移动5.5埃以发起攻击的催化机制。最新研究成果以“Structural Analysis of an L-Cysteine Desulfurase from an Ssp DNA Phosphorothioation System”为题发表在《mBio》杂志上。刘立琼等为第一作者，吴更、王连荣为通讯作者，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室为第一单位。本文是团队自2018年Nature Communications上发表的细菌采用SBD结构域识别硫化修饰DNA的结构机理及2020年Nature Microbiology上发表的II型DNA硫化修饰系统的SspB、SspE晶体结构的延续和扩展。在细菌的DNA硫化修饰（不管是早先发现的Dnd修饰系统还是新近发现的Ssp修饰系统）途径中，都由一个半胱氨酸脱硫酶催化第一步的反应，即半胱氨酸脱硫酶的活性位点半胱氨酸对底物半胱氨酸上的硫原子发起亲核攻击反应，将活化的硫原子转移到半胱氨酸脱硫酶的活性位点半胱氨酸上，以进行后续的将硫原子加进DNA的反应。2020年4月初团队在Nature Microbiology上发表的文章“SspABCD-SspE is a phosphorothioation-sensing bacterial defense system with broad antiphage activities”，从探索海洋弧菌的高频单链磷硫酰化修饰入手，通过比较基因组学和分子遗传学手段，鉴定出以SspABCD为修饰元、SspE为限制元的单链磷硫酰化限制-修饰系统。该系统与之前发现的磷硫酰化（以DndABCDE为修饰元以产生双链DNA磷硫酰化、DndFGH为限制元）的Dnd系统均迥然不同，并首次阐明了细菌磷硫酰化限制-修饰系统赋予宿主抑制噬菌体入侵的能力。同时，通过结构生物学和生物化学手段，解析了SspB蛋白的晶体结构，揭示其两个保守motif的关键残基对其DNA缺刻酶活性非常重要；解析了SspE蛋白的晶体结构，发现其N端结构域有依赖于DNA磷硫酰化修饰的NTP水解酶活性，而其C端结构域有DNA缺刻酶活性，从而阐明了该系统DNA磷硫酰化修饰与限制两部分功能耦合的分子机理。研究还发现SspABCD作为修饰蛋白在宿主基因组DNA上产生磷硫酰化修饰，SspE作为限制元能够感应基因组DNA上的磷硫酰化修饰从而区别宿主自身与外源的遗传物质，并利用其核酸酶活性对入侵噬菌体的DNA进行大范围的缺刻，从而抑制噬菌体DNA的复制。本研究解析了新发现的II型DNA硫化修饰系统中的半胱氨酸脱硫酶SspA（来源于弧菌）与底物半胱氨酸的复合物晶体结构，分辨率为1.8埃。结构揭示SspA通过其天冬酰胺N150和精氨酸R340残基来识别底物半胱氨酸，如果将这两个残基突变则会严重破坏细菌的DNA硫化修饰。在结构中，SspA的活性位点半胱氨酸C314与底物半胱氨酸的距离长达8.9埃，这就产生了一个有趣的问题——SspA是怎么催化脱硫反应的？通过计算机分子动力学模拟，作者发现SspA的活性位点半胱氨酸C314在催化过程中向底物半胱氨酸移动了5.5埃，从而把它们之间的距离缩短到便于发生反应的范围内。本研究通过简正模式分析，发现弧菌的SspA、大肠杆菌的IscS、链霉菌的DndA（这两个都是I型DNA硫化修饰系统的）的活性位点半胱氨酸虽然处在不同的相对位置和不同的二级结构上，但都有着向各自的底物半胱氨酸的运动。本研究进一步通过在上海光源BL19U2生物小角X射线散射（简称SAXS）线站收集的数据，从头搭建了SspA在溶液中结构的分子模型。发现SspA在溶液中的结构与分子动力学模拟后SspA的结构更为接近，它们之间的SAXS数据的χ2偏差只有1.04埃，远低于从SspA的晶体结构推算出的SAXS数据之间的χ2偏差3.70埃。这从实验上证实了前述的计算机分子动力学模拟和简正模式分析的结果。弧菌SspA的活性位点半胱氨酸在催化过程中，活性位点半胱氨酸朝向底物半胱氨酸移动了5.5埃的距离（A）分子动力学模拟  （B）简正模式分析  （C）小角X射线散射实验数据与晶体结构经过分子动力学模拟后的结果和晶体结构的比较  本研究通过X射线晶体结构解析、分子动力学模拟、小角X射线散射等多种研究手段的结合，揭示了细菌DNA硫化修饰这一神奇现象中催化关键的第一步半胱氨酸底物脱硫反应的酶的催化机理，解答了半胱氨酸脱硫酶家族是如何克服活性位点半胱氨酸与底物半胱氨酸之间很长的距离这一长期悬而未决的问题，使人们对于细菌DNA硫化修饰的认识和理解又前进了一步。该研究获国家自然科学基金（31872627、31670106）的支持。​​​​

已有样品/n本发明提供了一种趋磁细菌及利用其制备磁性磁小体的方法。从淡水中分离出一种能产生磁性磁小体的趋磁螺菌Magnetospirillumsp.ME-1。该菌株为大小2.62~4.83x0.44~0.62μm的趋磁螺菌，含有由10~31个磁小体颗粒组成的磁小体链，磁小体成分为四氧化三铁（Fe3O4），形态为立方八面体或立方体，大小为26-40nm。该菌株发酵性能优良，所产生的磁小体具有极大的产业化推广前景

发现血清抗性菌最重要的代谢特征为甘氨酸-丝氨酸-苏氨酸代谢通路显著下调，采用外源甘氨酸、丝氨酸或苏氨酸重编细菌代谢组，可以大大提高对血清补体的敏感性，同时也可以提高对抗生素的敏感性。其主要机制为外源甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸促进三羧酸循环中α-酮戊二酸的积累，以抑制ATP合酶；同时高浓度甘氨酸抑制嘌呤通路合成ATP; 使ATP合成的两条主要途径同时受到抑制，导致ATP生成下降；进而下调cAMP/CRP复合物，上调细菌外膜补体结合蛋白HtrE, NfrA和YhcD表达。高浓度的甘氨酸还可以增加质子动力势，促进血清补体与补体结合蛋白的结合，逆转血清抗性，实现血清补体高效杀菌（如上图所示）。甘氨酸促进补体杀菌在人血清、小鼠血清、猪血清、鱼血浆和对虾血浆均获得相似结果，在BALB/c小鼠和Rag1-/-（无T- 和B- 细胞免疫）细胞缺陷小鼠体内也得到证实，为控制人类和动物养殖病原菌感染提供了新的思路。       该研究不仅在解决百年难题上取得突破性进展，且在机制上有两个新发现：一是发现一条新的能量代谢调节通路，二是发现代谢物可以优于基因调控来主导物质代谢流向。