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非编码RNA的染色质结合机制研究
哺乳动物基因组的广泛转录产生了大量的非编码RNA,相比于细胞质定位的蛋白编码mRNA,这些非编码RNA如长链非编码RNA(lncRNA)、启动子和增强子关联的不稳定转录本(uaRNA、eRNA)等更倾向于结合染色质参与调控染色质结构、转录和RNA加工等过程。尽管零星报导少数RNA核滞留的现象,但为何大部分lncRNA会滞留于染色质上行使调控功能,仍是个不解之谜。上世纪80年代初,Joan Steitz通过系统性红斑狼疮患者血液抗体分离提取 U1,U2, U4, U5和U6小核糖核蛋白粒子(又称为 snRNP),揭示了它们参与RNA剪接的经典功能。近年来施一公团队系统报导了真核生物剪切体的原子结构和生化功能。然而,一直让人困惑的是,细胞内U1 snRNP的数量为什么比其它剪接相关snRNP高 2-5倍。虽然Gideon Dreyfuss和Phil Sharp等团队曾揭示U1 snRNP调控转录终止和方向的非经典功能,U1 snRNP在细胞中的丰富存在仍然是一个让人困惑的问题。为了探究lncRNA的染色质结合机制,研究者首先建立和运用一套新颖的mutREL-seq方法来高精度筛选调控RNA定位的关键序列,意外发现了U1 snRNP识别位点参与调控候选RNA的染色质滞留。相比于蛋白编码基因,lncRNA转录本含有更多的U1识别位点(同时也是潜在的5’剪接供体位点),而其基因组区域具有更少的3’剪接受体位点。并且U1 snRNP更高水平地结合在lncRNA上。随后,研究者分别使用antisense morpholino oligos(AMO)和auxin-induced degron(AID)诱导蛋白降解系统,来抑制U1 snRNA和核心蛋白组分SNRNP70的功能。研究者发现小鼠胚胎干细胞中近一半的lncRNA受U1 snRNP调控。另外,与转录调控元件关联的不稳定非编码转录本如uaRNA、eRNA等,它们的染色质结合在U1 snRNP抑制后也显著下降。研究者进一步证明了U1 snRNP直接调控成熟lncRNA与染色质的结合,而不是通过影响RNA合成、加工或降解过程的动态变化所产生的间接影响。机制上,研究者鉴定了U1 snRNP在染色质上的互作蛋白,发现U1 snRNP结合特定磷酸化状态的RNA转录聚合酶II(Pol II)。转录抑制明显降低了U1 snRNP及其所调控的非编码RNA与染色质的结合,表明U1 snRNP通过与磷酸化的Pol II互作来介导其互作RNA与染色质的结合。最后,研究者通过以lncRNA Malat1为例,进一步验证了U1 snRNP对其染色质结合的调控作用。去除SNRNP70后,绝大部分Malat1 “核斑”定位信号消失,并弥散在核质及细胞质中。同时,Malat1在活跃表达基因染色质区域的结合信号显著下降,表明U1 snRNP不仅可以将Malat1滞留在染色质上,同时也参与调控后者在染色质上的移动及其与靶基因的结合。综上,研究者提出如下模型(图1):5’和3’剪接位点在lncRNA上的不对称分布,致使U1 snRNP持续结合在lncRNA转录本上,而不能通过RNA剪接过程释放,从而介导了lncRNA的染色质滞留。磷酸化Pol II进一步介导了lncRNA-U1 snRNP复合体在染色质上的移动(mobilization)。对于大多数低丰度、不稳定的lncRNA,它们只能靶向结合邻近的染色质区域(顺式cis作用);而对于少数稳定和高丰度的lncRNA,如Malat1,U1 snRNP促进了其迁移和结合更多的靶基因区域(反式trans作用)。图1. U1 snRNP介导非编码RNA染色质结合的模式图。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2105-3
清华大学 2021-04-10
计算资源可伸缩的视频编码传输优化技术
本技术成果是主要针对视频编码新标准HEVC或H264优化技术集合,其中包括一个已授权的专利和若 干正在申请的专利
中山大学 2021-04-10
可遗传编码的组蛋白光交联标签
组蛋白的翻译后修饰对于表观遗传调控及多种生物学过程具有重要意义。一系列新的赖氨酸化学修饰(如巴豆酰化、琥珀酰化等)展示出组蛋白修饰前所未有的多样性及动态变化特征。可遗传编码的光交联探针已经成为研究活细胞内蛋白-蛋白相互作用的重要工具,成功地将该技术拓展到组蛋白的化学修饰研究中,开发了可遗传编码的组蛋白光亲和标签,将会极大地推动组蛋白化学修饰的识别机制和功能研究。该技术的设计包括两个部分:a)一套带有翻译后修饰的赖氨酸遗传编码系统,可以在特定位点插入带修饰的赖氨酸。此外,在赖氨酸的主链上还带有光交联基团,可在UV光下与修饰相关的蛋白发生共价交联,可以用于研究该修饰特定的效应蛋白。b)一套带有保护基团的赖氨酸遗传编码系统,保护基团可以在大肠杆菌自身的还原性环境中发生脱除,将带有光交联基团的赖氨酸定点插入到组蛋白当中,用于证实交联到的效应蛋白的特异性。该团队以巴豆酰化修饰为代表,发展了该技术对应的赖氨酸巴豆酰化修饰的光交联探针(K*cr)和带有保护基团的光交联探针(PNBK*)两个探针,将这两种探针分别引入到组蛋白H3的56位和79位,并通过光交联基团捕捉到了H3上79位巴豆酰化的去乙酰化酶Sirt3。
北京大学 2021-04-11
小麦耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用
本发明公开了植物耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用。本发明所提供的蛋白质为如下a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;a3)将a1)或a2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物耐热性相关的蛋白质。实验证
中国农业大学 2021-04-14
一种 APD 阵列地址编码主动输出电路
本发明公开了一种 2<sup>m</sup>×2<sup>k</sup>APD 阵列地 址编码主动输出电路,属于 APD 阵列领域;现有的无扫描输出只能实 现单点像素地址的输出;本发明提供的主动输出电路,通过地址控制 电路控制地址编码电路的输出开关,经地址输出电路输出对应的像元 块首地址,通过后续处理电路得到四个单元地址,无需复杂的时序控 制电路,效率高,速度快。
华中科技大学 2021-04-14
一种面向视频编码的背景建模方法
本发明公开了一种面向视频编码的背景建模方法,通过在图像块的基础上选择性地进行局部背景建 模、局部背景更新、局部多重背景保持,以克服现有以帧为单位的背景建模方法中存在的背景更新的最 佳时机难以确定、特定情况下背景建模困难、对周期性背景建模效率低下等问题,从而降低背景建模的 开销,提高背景模型的预测质量,最终提高视频编码的总体压缩效率。
武汉大学 2021-04-14
H264/WMV9视频编码器
产品详细介绍产品型号及参数产品分为独立式和机架式两类,其中独立式音视频编码器广泛适用于个人用户或企业单点使用,可同时支持1路D1或2路CIF视频输入;而机架式音视频编码器则广泛适用于各类企事业单位多点或密集型使用,产品分为1U和5U两种,单个机架式编码器最多可同时支持8路D1或16路CIF视频输入。产品图如下: 性能参数● 采用专用媒体处理DSP芯片,可实现多路D1/CIF实时WMV9/H264视频编码算法,多路WMA9/H264和优化的ADPCM/MP3/WMA音频编码算法。● 多路标准PAL或NTSC制模拟视频输入,多路标准模拟音频输入,音频/视频同步采样。● RTC实时时钟,为视频/音频采集、编码提供标准时基。● 嵌入式TCP/IP协议栈,10/100M自适应网口,可直接接入网络。● 内置强大的OSD功能。● 内置嵌入式Web服务器。● 输出流采用标准的HTTP流协议。特性特色● 算法代码针对DSP芯片资源、板载资源作大规模手工优化,目前的版本具有码率低、图像精美、CPU负荷低的特点。● 整机功耗小、发热低。● 硬件平台经各方多种环境测试,证明稳定可靠,适合24×7不间断长期工作。产品技术参数视频参数 视频输入电性能 共2/4、8/16路CVBS模拟视频信号输入 电压幅度(VPP):0~1V 信噪比(SNR)≥46db 特性阻抗(RL):75±3.75Ω 传输时延:最佳120ms 图像制式:支持PAL制式 传输有效率:≥99.3% 视频通道带宽:≥4MHz 灰度等级:≥10级 图像分辨率:≥400线(D1模式下) 接口方式:BNC阴性 视频压缩方式:WMV9/H.264 图像传输码率:32kbps~4000kbps 图像传输帧率:25±3帧/秒音频参数 音频输入:8/32路单声道声音输入 音频量化支持:8~48K采样率,16比特量化 音频压缩方式:WMA9或优化ADPCM音频压缩算法/MP3 音频码率:32k~128kbps 偏置电压:≥-3.3V且≤3.3V网络 接口标准:10baseT Ethernet 100baseTX Fast Ethernet /网络通道 连接口:RJ-45功率 设备功耗:8~16/32~64W工作环境 温度范围 0±3℃~55±2℃ 恒定湿度 ≤90℃ 大气压力 86~106KPa 电源电压 187V~242V 电源频率 50±1Hz
南京市感动科技有限公司 2021-08-23
字符的图形与编码相互独立的隐藏通信方法
本发明的主要目的是提供一种隐藏通信方法,其基本原理是改变字符图形与字符的编码在各种编码标 准规范中已确定的标准映射关系,采用自定义的方法进行字符图形与字符编码的映射,从而使得电子文件 显示出的字符图形与电子文件的编码分别构成显式通信信道和隐藏通信信道,这两种信道可以独立地进行 通信。 基于这种隐藏通信方法的文本数字水印技术有水印容量大、抗攻击性能好、水印难以被去除的优点。 此外,应用该隐藏通信技术制作成的自包含字符图形和编码信息的电子文件,便于现有搜索引擎利用文件 的属性进行搜索,从而增强了对这种电子文件的搜索能力。 本发明包括如下紧密相关的内容: (1)隐藏通信方法以及相关的电子文件。 (2)实现本发明的隐藏通信方法及生成相关电子文件的若干具体实现方法。 (3)两种典型的应用技术。 1.隐藏通信方法以及相关的电子文件 本发明提出一种隐藏通信方法,通过在包含字符的电子文件中添加隐藏信息进行隐藏通信。在这种 电子文件中,对于相同的字符编码,其按照标准编码规范定义的内容构成隐藏信息,按照自定义的字符编 码与图形的映射关系显示出的字符图形内容构成显式信息,从而在利用该电子文件显示出的字符图形
电子科技大学 2021-04-10
一种采用空间网络编码的网络传输方法
一种采用空间网络编码的网络传输方法,属于网络信息传输方 法,解决现有基于线性划分的空间网络编码方法当存在分簇现象时计 算量陡增以及求线性规划最优解时计算量较大的问题。本发明包括: (1)初始化步骤,(2)形成约束矩形步骤,(3)划分步骤,(4)求平衡前线性 规划最优解步骤,(5)调整中继点到平衡位置步骤,(6)求平衡后线性规 划最优解步骤。本发明通过采用非线性划分的空间网络编码,解决基 于线性划分方法中给定终端点存在分簇现象时计算量陡增的问题;通 过预处理移除虽在终端点约束矩形内但在终端点凸包外的中继点,可 进一步降低本发明中线性规划求解时的计算量,从而有效提升网络传 输的总体性能。
华中科技大学 2021-04-11
一种具有不等错误保护的编码方法
本技术成果属于数字通信和数字存储领域,特别涉及一种具有不等错误保护的编码方法
中山大学 2021-04-10
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