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新冠肺炎传播风险预测分析
在2003年成功预测SARS流行趋势的基础上,西安交通大学数学与统计学院生物数学团队与陕西师范大学生物数学团队、加拿大吴建宏教授团队合作,基于新型冠状病毒的传播机理、密切跟踪隔离和封城等策略,建立了传播动力学模型,对新型冠状病毒肺炎传播风险进行了预测分析,此项研究成果“Estimation of the transmission risk of 2019-nCov and its implication for public health interventions”。 研究中利用2020年1月10日至1月22日的报告疫情数据,采用动力学模型和统计计算方法预测武汉新型冠状病毒肺炎传播的基本再生数为6.47 (95%置信区间为5.71-7.23),给出了疫情的达峰时间和峰值以及最终感染规模(若继续1月22日前的控制措施,疫情将在3月10日左右达到峰值)。研究中进一步采用似然函数方法加以验证,得到了与模型估计值一致的结果。如果续代时间大于6天或潜伏期越长,基本再生数可能更大,该结论说明了疫情传播的速度快。与23至25日的疫情数据相比,模型预测结果与报告疫情数据基本一致。 研究中进行敏感性分析,讨论了1月22日前武汉采取的防控措施的有效性以及在降低再生数中的重要作用。预测结果显示从23日起加强控制措施,报告病例数会在一个周后出现明显的下降,即加强的控制措施会在一个周后产生明显效果。进一步分析1月23日后武汉封城策略对其它地区疫情的影响,基于武汉到北京的航班、铁路等信息,计算武汉封城前后对北京疫情的影响,表明武汉封城(即北京无来自武汉输入病例)后,北京在未来7天的病例数将降低91.14%,这说明了武汉封城对全国疫情防控的关键作用。SSRN 截图 密切跟踪隔离措施的敏感性分析点击查看原文
西安交通大学 2021-04-10
新冠肺炎防控候选方药
山东中医药大学青岛中医药科学院海洋中药研究中心主任付先军教授带领的研究团队,筛选出18种可能与新型冠状病毒靶点Mpro结合的高频中药主要成分,为新型冠状病毒感染疾病的防控提供了可参考的候选方药,为开发用于临床治疗2019-nCoV感染的药物提供候选先导化合物。 山东中医药大学青岛中医药科学院海洋中药研究中心主任付先军教授带领研究团队,与中国石油大学宋弢教授团队、中国海洋大学王鹏教授团队、华南农业大学周武艺教授团队的多支研究团队通力合作,充分发挥中医药的原创优势,采用网络药理学方法和医学人工智能技术,挖掘中医药在几千年间与疫病斗争中积累的丰富经验,从十万余首历代方剂中筛选主治中医“温病”(“瘟疫”或“疫病”或“时疫”)的方剂574首,挖掘高频中药40种,高频药对36组,高频三味药组合配伍6组。通过基于分子对接的反向虚拟筛选,筛选出18种可能与新型冠状病毒靶点Mpro结合的高频中药主要成分,进一步采用网络药理学研究分析其可能的作用靶点和分子作用机制。 该研究结果为新型冠状病毒感染疾病的防控提供了可参考的候选方药,为开发用于临床治疗2019-nCoV感染的药物提供候选先导化合物
山东中医药大学 2021-04-11
新冠肺炎传播风险预测分析
在2003年成功预测SARS流行趋势的基础上,西安交通大学数学与统计学院生物数学团队与陕西师范大学生物数学团队、加拿大吴建宏教授团队合作,基于新型冠状病毒的传播机理、密切跟踪隔离和封城等策略,建立了传播动力学模型,对新型冠状病毒肺炎传播风险进行了预测分析,此项研究成果“Estimation of the transmission risk of 2019-nCov and its implication for public health interventions”。 研究中利用2020年1月10日至1月22日的报告疫情数据,采用动力学模型和统计计算方法预测武汉新型冠状病毒肺炎传播的基本再生数为6.47 (95%置信区间为5.71-7.23),给出了疫情的达峰时间和峰值以及最终感染规模(若继续1月22日前的控制措施,疫情将在3月10日左右达到峰值)。研究中进一步采用似然函数方法加以验证,得到了与模型估计值一致的结果。如果续代时间大于6天或潜伏期越长,基本再生数可能更大,该结论说明了疫情传播的速度快。与23至25日的疫情数据相比,模型预测结果与报告疫情数据基本一致。 研究中进行敏感性分析,讨论了1月22日前武汉采取的防控措施的有效性以及在降低再生数中的重要作用。预测结果显示从23日起加强控制措施,报告病例数会在一个周后出现明显的下降,即加强的控制措施会在一个周后产生明显效果。进一步分析1月23日后武汉封城策略对其它地区疫情的影响,基于武汉到北京的航班、铁路等信息,计算武汉封城前后对北京疫情的影响,表明武汉封城(即北京无来自武汉输入病例)后,北京在未来7天的病例数将降低91.14%,这说明了武汉封城对全国疫情防控的关键作用。SSRN 截图 密切跟踪隔离措施的敏感性分析点击查看原文
西安交通大学 2021-04-11
新冠肺炎致死元凶的研究
新冠肺炎已然强势侵袭全球,不论是泱泱大国还是弹丸之地均无法全身而退。尽管多数新冠肺炎患者为轻症,但不容忽视的是,重症患者死亡率竟高达10%以上。新冠病毒致死的主要原因之一,就是人体免疫系统过度激活导致的细胞因子风暴。 近日,重庆大学的钟莉教授团队在预印本网站Preprint.org上发表重要结果,认为ACE2在新冠肺炎病程中发挥的作用并不单纯:除了作为病毒结合的受体,ACE2还参与调节免疫过程。研究者发现ACE2表达上升的肺腺癌组织中,存在miR-125b-5p-ACE2-IL6表达轴,提示新冠病毒感染导致的ACE2水平下调,可能进一步引起细胞因子风暴和肺炎加重。 血管紧张素转化酶2(ACE2)是一把双刃剑:在病毒感染过程中,它是新冠病毒的膜上结合受体,与病毒和宿主细胞的融合、入侵过程有关;在流感病毒、SARS引起炎症和急性肺损伤的情况下,ACE2促进血管紧张素II转化为血管紧张素1-7,抑制血管紧张素II介导的NF-κB信号,从而避免大量炎症信号引发的细胞因子风暴,减缓病程。 前期研究发现,一旦被SARS-CoV结合,宿主细胞表面的ACE2表达量、mRNA水平和酶活性均会发生显著下降。尽管这是减少病毒入侵关卡的重要措施,但也给炎症的加剧提供可乘之机。因此,研究者们选取了一种ACE2表达上调的肺腺癌模型,来探究ACE2介导并调节免疫反应的上下游分子机制,并验证新冠病毒引起细胞因子风暴的可能性。 首先,研究者们从TCGA数据库中获取了830份样品的测序结果,其中347份来自正常组织,483份来自肺腺癌组织。比较发现,肺腺癌组织中ACE2蛋白表达水平显著上调,说明受SARS-CoV-2感染的可能性增加。 肺腺癌组织ACE2表达上调 进一步,研究者们探究ACE2表达量改变的分子机制,对ACE2相关的基因表达进行生物信息学分析。经过筛选和比较,研究者检测到7个差异表达的相关基因(DECGs)参与多种抗病毒过程;以及5个差异表达的相关miRNA(DECMs)与ACE2表达水平的调节有关。 其中,AZU1、FCN3、HYAL1、IRAK3和miR-125b-5p水平与ACE2表达正相关,而CXCL9、MMP12、IL6、miR-9-5、miR-130b-5、pmiR-381-3p和miR-421水平与ACE2表达呈负相关。 肺腺癌组织中差异表达的基因和miRNA 研究者分析以上分子涉及的细胞通路发现,DECGs中的CXCL9和IL6以及DECMs均在toll样受体信号通路中富集,与非特异性免疫有关。进一步排除,研究者明确了miR-125b-5p- ACE2- IL6的上下游通路;即,miR-125p促进ACE2蛋白表达,进一步抑制IL6的表达。 ACE2表达相关的上下游分子 巧合的是,IL6正是引起细胞因子风暴的主要因素。感染SARS-CoV-2后,激活的病原性T细胞就会产生粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)和IL6。GM-CSF可以激活CD14 + CD16 +炎性单核细胞,进一步产生更多的细胞因子,包括IL6。IL6在这个正反馈循环中扮演不可或缺的一份子,最终促成免疫系统的失控。 此时,肺中大量的免疫细胞和组织液会阻塞肺泡和毛细血管之间的气体交换,从而导致急性呼吸窘迫综合征。一旦形成细胞因子风暴,免疫系统在清除病毒的同时,会杀死肺中的许多正常细胞,从而严重破坏肺的通气功能,进而导致患者死亡。
重庆大学 2021-04-11
一种副球菌及其在降解间苯二酚中的应用
本发明公开了一种副球菌,所述副球菌为副球菌(Paracoccus sp.)JB‑3,于2017年01月13日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号:CGMCC No.13607。本发明还公开了该副球菌(Paracoccus sp.)JB‑3在降解间苯二酚中的应用。本发明的副球菌Paracoccus sp.JB‑3用于含间苯二酚的工业废水或自然水体中降解间苯二酚,不仅具有很高的降解速率和耐受浓度,且无二次污染,使用安全,具有广阔的应用前景。
曲阜师范大学 2021-05-07
新冠肺炎恢复期血浆疗法
上海交通大学医学院附属瑞金医院瞿介明、张欣欣、周敏、陈立等组成的团队参与协助中国生物、武汉三家参试医院和国家转化医学中心(上海)进行专家评估,研究数据显示,将恢复期供体中含有高滴度中和抗体的血浆输注给患者后,其临床症状在24-48小时即得到改善,同时实验室炎症指标和肺部影像学在短期内都得到了具有统计学意义的改善。其中5名患者在治疗后中和抗体的滴度升高,所有患者在治疗后7天内病毒核酸的检测均转为阴性。目前尚未观察到明显的不良反应,安全性良好。恢复期血浆有望成为挽救重症新型冠状病毒肺炎患者生命的有力武器。 人体感染病毒或细菌等病原体后,人体的免疫系统就会产生相应的物质来抵抗这些病原体,这就是我们大家熟悉的抗体。经历细菌或病毒性感染而幸存的患者,体内可产生较高滴度的特异性抗体。恢复期血浆治疗就是采集恢复期患者的血液,经过分离处理后,将富含中和抗体的血浆输注给其他患者的治疗方法,属于被动免疫治疗的一种。恢复期血浆疗法用于传染病的治疗已经有一百多年的历史。在1918~1920 年的西班牙流感、1920~1940 年代的猩红热、1970 年代的百日咳流行期间,恢复期血浆就已用于临床救治,发挥了一定的作用。后来这一方法又被用于麻疹、阿根廷出血热、流感、水痘、巨细胞病毒感染、细小病毒 B19 感染等。近二十年来,这一经典疗法又被用于严重急性呼吸综合征(SARS)、H1N1、H5N1、H7N9禽流感、中东呼吸综合征(MERS) 等新发突发传染病,取得了一定的疗效。当缺乏有效的特异性抗病原体药物时,尤其是新发传染病暴发流行时,恢复期血浆疗法可能是抢救危重症患者的唯一选择。 恢复者血浆治疗适用于重症患者,最好在起病2周内治疗,因为这个时候病人体内还有病毒复制或者病毒血症,用恢复期血浆可以快速中和血液中的病毒,减轻炎症反应,可以遏制病情恶化,改善患者预后。起病2周后机体内病毒载量明显减少,而且可能已经出现了严重并发症,如细菌感染、凝血功能障碍、多器官功能衰竭等,肺泡上皮细胞大量损伤,这个时候用恢复期血浆,可能疗效已经大打折扣了。 从既往治疗其他传染病的经验看,总体上说是安全的。但输注血浆仍然有潜在的输血感染病原体的风险和不良反应,包括过敏等。恢复期血浆在分离制备的过程中,需要经过严格的病原体灭活和生物安全性检测,感染风险较小,但不排除个别处于窗口期的供体病原体检测阴性的情况。其次,在输注恢复期血浆的过程中,有发生输血相关肺损伤的风险,尤其是在已经发生严重肺部炎症的患者,值得注意。
上海交通大学 2021-04-10
新冠肺炎疑似病例检测系统
天津大学精仪学院科研团队联合企业成功研发新冠肺炎疑似病例检测系统。据了解,该系统可快速检测新冠肺炎疑似病例并实现大数据监控预警,有望为疫情控制提供新思路。该系统的便携式检测仪单元已获得国家药监局医疗器械注册证书。该系统由“掌上模块”和“线上模块”两部分组成:“掌上模块”是一款便携式检测仪,从外观上看这款便携式检测仪只有鼠标大小,使用USB接口充电,能够连接手机电脑,满电续航超过24小时。检测仪可以单手控制,操作简单,便于入户排查。检测仪内部集成了精密的检测核心模块,与实验室大型仪器检测精度相当,能够快速判断出是否为疑似病例。掌上模块检测出的结果会自动上传到“线上模块”——疫情监测预警云平台。云平台会将检测结果进行智能化处理,上传至各级政府疾控和医疗监测机构云平台,给各级机构提供疫情预警、态势分析和决策支持,对疫情进行全方位、智能化管控。
天津大学 2021-04-10
新冠肺炎疫情卫星地图速查系统
学校卫星产业技术研究院与合作方联合推出的全国首款“疫情卫星地图”——新冠肺炎疫情卫星地图速查系统已于近日上线。新冠肺炎确诊病例陆续公布,他们是哪里人?去过哪些地方?离我们有多远?……通过“疫情卫星地图”,人们可以更加直观地了解确诊病例的具体位置。记者打开该系统发现,在卫星地图上,确诊病例的标注点像是一颗颗“图钉”,用户定位后,通过卫星遥感影像带来的“太空视角”,可以让确诊病例分布位置尽收眼底,并显示出附近的确诊病例分布与自己的距离。据了解,该系统由电子科技大学卫星产业技术研究院陆川博士和阎镜予博士组织技术力量自主研发,从研发到上线,用时不到10天。今年2月初,随着各地卫健委公布了越来越多的确诊病的例详细数据,使得开发“疫情卫星地图”有了良好的基础和可能。电子科技大学卫星产业技术研究院决定发挥自身的技术优势,为公众提供免费的疫情防控公益服务。科研团队利用AI卫星的数据智能处理和分发技术,处理遥感图片数据,并结合精确的语义识别和地理编码工具,把官方发布的疫情文字转化成了一目了然的“疫情卫星地图”。
电子科技大学 2021-04-10
云南省新冠肺炎影像云平台
2月19日,昆明移动依托云资源和数据链优势,协同昆明市第三人民医院、云南大学共同创立、建设的“云南省新型冠状病毒感染的肺炎CT诊断互联网协同会诊平台”(简称云南省传染性疾病影像云平台)在三方远程连线下正式启动。平台将在有相关诊断经验的影像专家帮助下,以多方协同工作的方式支持基层医院,帮助基层医院输出高质量的新冠肺炎诊断,同时通过互联网方式实现远程互动,方便医生和患者,减少传播感染机会、减少现场支援成本和隔离防护的物资消耗,集全省影像专家力量助力打好新冠疫情防控阻击战。结合为昆明医科大学第一附属医院创建的“5G智慧诊疗平台”的经验,昆明移动协同云南大学、昆明市第三人民医院建立相应的云服务、医学影像多方协同工作(会诊)系统,通过CT诊断新型冠状病毒肺炎的互联化服务系列关键技术以及运行服务的保障模式,将复杂、昂贵的医学影像处理系统互联化、低成本化。基层医院可以免费、免培训、自助地将本地设备接入云服务平台,随后将逐步发展成为云南省传染性疾病影像互联网协同诊断平台。
云南大学 2021-04-10
新冠肺炎疫情AI话题分析平台
RealAI首席执行官田天表示,新冠肺炎疫情暴发以来,各大媒体网站、社交平台上关于疫情的话题热度持高涨。在此环境下,信息的高效传播成为重要诉求。一方面,相关部门需要全面了解公众对疫情的话题讨论,辅助决策优化的同时也利于开展引导工作;另一方面,公众亟需第一时间获得最权威、最实时、最准确的疫情动态。分析称,互联网成为这次疫情主要的“信息源”平台,传播模式更是基于人手一机的“自媒体”,信息流不仅降低了大众获取信息的“信噪比”,更滋生出不同程度的谣言。据介绍,“新冠肺炎疫情AI话题分析平台”通过对多渠道海量媒体信息进行自动抓取采集、识别分析,解决了传统信息检索过程中因消息源头繁杂、消息过多、检索意图不明确而产生的困扰。同时,基于大数据分析和AI建模,自动识别出近期热点话题、新闻追踪和话题导向、地区关注度变化,为用户第一时间推送全网话题最新动态,满足用户对疫情舆情监测的需求,为作出正确舆论引导提供分析依据。
清华大学 2021-04-10
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