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非编码RNA的染色质结合机制研究
哺乳动物基因组的广泛转录产生了大量的非编码RNA,相比于细胞质定位的蛋白编码mRNA,这些非编码RNA如长链非编码RNA(lncRNA)、启动子和增强子关联的不稳定转录本(uaRNA、eRNA)等更倾向于结合染色质参与调控染色质结构、转录和RNA加工等过程。尽管零星报导少数RNA核滞留的现象,但为何大部分lncRNA会滞留于染色质上行使调控功能,仍是个不解之谜。上世纪80年代初,Joan Steitz通过系统性红斑狼疮患者血液抗体分离提取 U1,U2, U4, U5和U6小核糖核蛋白粒子(又称为 snRNP),揭示了它们参与RNA剪接的经典功能。近年来施一公团队系统报导了真核生物剪切体的原子结构和生化功能。然而,一直让人困惑的是,细胞内U1 snRNP的数量为什么比其它剪接相关snRNP高 2-5倍。虽然Gideon Dreyfuss和Phil Sharp等团队曾揭示U1 snRNP调控转录终止和方向的非经典功能,U1 snRNP在细胞中的丰富存在仍然是一个让人困惑的问题。为了探究lncRNA的染色质结合机制,研究者首先建立和运用一套新颖的mutREL-seq方法来高精度筛选调控RNA定位的关键序列,意外发现了U1 snRNP识别位点参与调控候选RNA的染色质滞留。相比于蛋白编码基因,lncRNA转录本含有更多的U1识别位点(同时也是潜在的5’剪接供体位点),而其基因组区域具有更少的3’剪接受体位点。并且U1 snRNP更高水平地结合在lncRNA上。随后,研究者分别使用antisense morpholino oligos(AMO)和auxin-induced degron(AID)诱导蛋白降解系统,来抑制U1 snRNA和核心蛋白组分SNRNP70的功能。研究者发现小鼠胚胎干细胞中近一半的lncRNA受U1 snRNP调控。另外,与转录调控元件关联的不稳定非编码转录本如uaRNA、eRNA等,它们的染色质结合在U1 snRNP抑制后也显著下降。研究者进一步证明了U1 snRNP直接调控成熟lncRNA与染色质的结合,而不是通过影响RNA合成、加工或降解过程的动态变化所产生的间接影响。机制上,研究者鉴定了U1 snRNP在染色质上的互作蛋白,发现U1 snRNP结合特定磷酸化状态的RNA转录聚合酶II(Pol II)。转录抑制明显降低了U1 snRNP及其所调控的非编码RNA与染色质的结合,表明U1 snRNP通过与磷酸化的Pol II互作来介导其互作RNA与染色质的结合。最后,研究者通过以lncRNA Malat1为例,进一步验证了U1 snRNP对其染色质结合的调控作用。去除SNRNP70后,绝大部分Malat1 “核斑”定位信号消失,并弥散在核质及细胞质中。同时,Malat1在活跃表达基因染色质区域的结合信号显著下降,表明U1 snRNP不仅可以将Malat1滞留在染色质上,同时也参与调控后者在染色质上的移动及其与靶基因的结合。综上,研究者提出如下模型(图1):5’和3’剪接位点在lncRNA上的不对称分布,致使U1 snRNP持续结合在lncRNA转录本上,而不能通过RNA剪接过程释放,从而介导了lncRNA的染色质滞留。磷酸化Pol II进一步介导了lncRNA-U1 snRNP复合体在染色质上的移动(mobilization)。对于大多数低丰度、不稳定的lncRNA,它们只能靶向结合邻近的染色质区域(顺式cis作用);而对于少数稳定和高丰度的lncRNA,如Malat1,U1 snRNP促进了其迁移和结合更多的靶基因区域(反式trans作用)。图1. U1 snRNP介导非编码RNA染色质结合的模式图。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41586-020-2105-3
清华大学 2021-04-10
可遗传编码的组蛋白光交联标签
组蛋白的翻译后修饰对于表观遗传调控及多种生物学过程具有重要意义。一系列新的赖氨酸化学修饰(如巴豆酰化、琥珀酰化等)展示出组蛋白修饰前所未有的多样性及动态变化特征。可遗传编码的光交联探针已经成为研究活细胞内蛋白-蛋白相互作用的重要工具,成功地将该技术拓展到组蛋白的化学修饰研究中,开发了可遗传编码的组蛋白光亲和标签,将会极大地推动组蛋白化学修饰的识别机制和功能研究。该技术的设计包括两个部分:a)一套带有翻译后修饰的赖氨酸遗传编码系统,可以在特定位点插入带修饰的赖氨酸。此外,在赖氨酸的主链上还带有光交联基团,可在UV光下与修饰相关的蛋白发生共价交联,可以用于研究该修饰特定的效应蛋白。b)一套带有保护基团的赖氨酸遗传编码系统,保护基团可以在大肠杆菌自身的还原性环境中发生脱除,将带有光交联基团的赖氨酸定点插入到组蛋白当中,用于证实交联到的效应蛋白的特异性。该团队以巴豆酰化修饰为代表,发展了该技术对应的赖氨酸巴豆酰化修饰的光交联探针(K*cr)和带有保护基团的光交联探针(PNBK*)两个探针,将这两种探针分别引入到组蛋白H3的56位和79位,并通过光交联基团捕捉到了H3上79位巴豆酰化的去乙酰化酶Sirt3。
北京大学 2021-04-11
小麦耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用
本发明公开了植物耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用。本发明所提供的蛋白质为如下a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;a3)将a1)或a2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物耐热性相关的蛋白质。实验证
中国农业大学 2021-04-14
一种 APD 阵列地址编码主动输出电路
本发明公开了一种 2<sup>m</sup>×2<sup>k</sup>APD 阵列地 址编码主动输出电路,属于 APD 阵列领域;现有的无扫描输出只能实 现单点像素地址的输出;本发明提供的主动输出电路,通过地址控制 电路控制地址编码电路的输出开关,经地址输出电路输出对应的像元 块首地址,通过后续处理电路得到四个单元地址,无需复杂的时序控 制电路,效率高,速度快。
华中科技大学 2021-04-14
基于视频播放器精确获取原视频文件图像的实现方法
本新技术成果提供了一种基于视频播放器精确获取原视频文件图像的实现方法,通过客户端全程监测视频播放器,获取视频的参数,将获取视频的所有参数代入函数并运行函数,通过计算获取当前播放视频的视频数据范围,并对该视频数据进行差值平滑处理,获取到最接近该视频数据的原视频文件图像即当前帧图像。本成果根据视频播放器的播放视频获取原视频文件的图像,使截取的图像清晰,效果更佳。
西南交通大学 2016-06-27
基于视觉特征的视频指纹检测及视频序列匹配方法及系统
本发明提出一种基于视觉特征的视频指纹检测方法,具体为:按照帧间相关性对视频序列分段,在分段中提取关键帧;在各关键帧中提取视频特征;利用像素点特征字典对像素点分类;对各关键帧分别进行多次不同数量的分块,在各子块中依据像素点的分类结果统计像素点特征字典各元素的出现次数,得到该子块的特征向量;将所有子块的特征向量拼接得到关键帧的高维视频指纹;对各高维视频指纹进行降维;将各视频片段关键帧的低维视频指纹按照时间先后顺序连成关键帧视频指纹串。本发明还提供了基于上述指纹检测方法的视频匹配方法。本发明通过对视频内容的关键信息进行有效描述,在不影响匹配率的情况下,大大降低了算法的复杂度,有效提高了检测效率。
华中科技大学 2021-04-11
H.264视频编解码
支持格式:1080P@60Hz及以下各种格式兼容 ? 低延时: 720P低于90ms,1080P低于120ms ? 输入接口:CVBS、HDMI、Cameralink、HD-SDI ? 输出接口:CVBS、HDMI、以太网 ? 码率可调:适应不同的带宽环境 ? 误码保护:超强纠错与差错隐藏能力 ? 工作温度:-40℃~+85℃ ? 存储温度:-45℃~+105℃ ? 通信安全: 256位AES加密,有效的防止干扰与窃听 ? 适用场合:无人机、导弹地面控制
电子科技大学 2021-04-10
客流量视频检测系统
在机场、地铁、展览中心等场所,客流密度、实时流量、平均行人通过时间等是非 常重要的参数,对于安全防卫、日常管理、设计规划具有重要的意义。 客流量检测系统利用现有的闭路电视监控系统,结合计算机视觉与图像处理领域的 最新研究成果,对客流密集场所的客流密度、一定时间内通过检测区域的人数,以及行 人经过该区域的通过时间等参数进行实时检测。 系统通过对视频图像中行人的运动信息,以及纹理信息的提取,结合特征轨迹的聚 类,完成对单个行人的跟踪,从而得到客流的实时参数。 
同济大学 2021-04-11
交通视频信息分析系统
针对传统采用人力进行交通监控成本高、效率低的问题,开发了一套基于数字图像 处理和模式识别技术的智能视频交通监控系统(ITS)。通过架设在路边的摄像头采集的 道路监控录像,自动获取并记录包括交通流量、车辆速度、车型等在内的交通数据,并 检测交通事件,及时自动报警。
同济大学 2021-04-11
交通违章视频自动监测系统
成果与项目的背景及主要用途:采用视频对交通违章及其车牌进行自动判断、 记录和发送处罚信息。 技术原理与工艺流程简介:采用视频和图像处理技术自动识别测量违章并自 动记录存档、自动识别车牌和发送短信、传真通知司机和有关人员、单位进行处 理。 技术水平及专利与获奖情况:专有技术。 应用前景分析及效益预测:可以显著提高交通管理效益和水平。 应用领域:交通。 技术转化条件(包括:原料、设备、厂房面积的要求及投资规模):不需特 殊设备和条件。 合作方式及条件:技术入门费+产值提成:20 万+5%。 
天津大学 2021-04-11
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