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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义,而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析,还面临很多挑战。 肿瘤样本具有其独有的特点,在样本制备和单细胞分离过程中,其细胞应激反应大、坏死细胞多,为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战; 肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题,比如复杂的微环境和高度的异质性,而如何充分考虑这些难点,并从信息学的视角进行深入研究,有待建立全面、自动的分析框架; 肿瘤单细胞数据的分析,对科研人员的编程能力和分析经验要求很高,亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛,提高研究的效率。 2.解决方案 本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括: 1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案; 2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析); 3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法; 4)从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性; 5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法; 6)构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。 基于本项成果产生的产品、服务或解决方案: 1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer; 2)针对软件使用和分析结果解读的服务; 3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。 3、合作需求 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学 2022-08-30
中国科大实现多种空间转录组分析算法的系统性评估
中国科学技术大学生命科学与医学部瞿昆教授课题组通过设计一整套分析流程,系统性评估了16种空间转录组和单细胞转录组数据整合算法在预测基因或细胞类型空间分布方面的性能。
中国科学技术大学 2022-06-02
一种复杂结构耦合损耗因子的预示方法
本发明提供了一种复杂结构耦合损耗因子的预示方法,将系统切割成连续耦合的子系统,并对子系统在耦合边上的边界条件进行近似,分别建立耦合子系统的有限元模型,施加边界条件,并对结构有限元模型进行模态分析,提取模态数据,利用两个子系统耦合边的应力模态振型和位移模态振型计算模态相互作用的功,利用双模态方程法预示结构的耦合损耗因子。本发明结合了有限元法和双模态方程法预示复杂结构的耦合损耗因子,使用有限元法得到耦合边处的位移和应力模态振型、子系统的固有频率和模态质量,通过计算耦合子系统的相互作用功,再结合双模态方程法得到耦合损耗因子,能够准确且高效地预示复杂结构的耦合损耗因子。
东南大学 2021-04-11
基于因子综合评价的城市整体高度控制分区方法
成果介绍本发明公开了一种基于因子综合评价的城市整体高度控制分区方法,该方法基于因子综合评价的城市整体高度控制分区方法,首先从城市总体规划等相关法定规划成果中提取所需数据资料,结合研究构筑的高度控制数学模型,将数据资料导入数字技术平台转化为影响因子控制参数,得到各街区单元的高度控制值,然后进一步利用Saaty法进行标准化修正,转化得到最终的高度控制分区结果。本发明客观的理性分析为基础,较为综合全面的评价方式,且数据资料易于获得,从而有效地从宏观层面对城市高度进行控制。技术创新点及参数本发明提供了一种基于因子综合评价的城市整体高度控制分区方法,该方法客观的理性分析为基础,较为综合全面的评价方式,且数据资料易于获得,从而有效地从宏观层面对城市高度进行控制。
东南大学 2021-04-11
用于抗衰老的干细胞生长因子新型制备方法
已有样品/n生长因子和干细胞的缺乏是造成皮肤衰老的重要原因。生长因子对皮肤屏障的重建、干细胞对皮肤微循环的重建,是使皮肤年轻的的重要手段。直接将干细胞运用于工业化妆品中,由于成本高昂难以大规模应用。通过常规细胞培养,干细胞增殖后却丧失了自身性状。运用胡康洪博士发明的国际先进的独特三维灌流式培养技术,使干细胞体外增殖而不改变其性状,破碎细胞,采用一系列高效的抽提方法,获得具有抗衰老活性的干细胞抽提原液,其中含有肝细胞样生长因子(HGF)、前胶原蛋白等抗衰老因子,作为原料用于工业化妆品。通过双方合作,将
湖北工业大学 2021-01-12
基于切削激励的机床结构模态比例因子获取方法
一种基于切削激励的机床结构模态比例因子获取方法,包括:选择脉冲切削方式,脉冲切削方式包括铣削、车削和镗削凸台,建立与脉冲切削方式对应的切削力模型,根据切削力模型生成切削参数,并随机生成凸台参数,根据切削参数和凸台参数计算切削力的自功率谱,并判断自功率谱的频宽是否覆盖期望的频带范围,判断自功率谱的能量是否大于一阈值能量,若能量大于阈值能量,则根据所选的切削参数生成数控指令代码,以控制机床加工待切削试件,测量机床的响应信号,并计算响应信号的互功率谱矩阵,根据响应信号的互功率谱矩阵利用最小二乘复频域法计算系统极点以及模态振型向量。本发明能够估计激励力的能量大小,继而从互功率谱矩阵中获取模态比例因子。
华中科技大学 2021-04-11
人端粒酶逆转录酶生物学行为的临床应用
本项目针对上述问题,从分子、细胞和个体水平三个层面上研究人端粒酶逆转录酶(hTERT)生物学行为及相关技术的临床应用,旨在提高儿童肿瘤疗效。 1、主要科技内容和技术特点: 1) 率先在国内外建立RT-PCR和实时定量RT-PCR检测hTERT法,该法简便、快速、经济、安全,适用于临床推广应用。该项技术已经应用于儿童恶性肿瘤诊断、监测和指导个体化治疗,提高了儿童肿瘤的诊疗水平。 2)首次在国内外研究体内造血干细胞hTERT的生物学行为,证明了hTERT与促红细胞生成素的关系,并系统研究了恶性肿瘤细胞hTERT的生物学行为, 探讨肿瘤细胞中Aurora A与hTERT及端粒酶表达的相关性,提出hTERT与细胞因子网络紊乱相互作用促进肿瘤发生和发展的新观点,为恶性肿瘤在分子水平上的监测和以hTERT为靶点的生物工程治疗提供了依据。 3) 在国内外首次阐明端粒酶重建对成纤维细胞迁移能力和生物节律的调控,把端粒酶、hTERT生物学行为和生物节律与肿瘤择时治疗有机结合,为肿瘤治疗提供了一条新路径。实践证明,在该理论指导下进行化疗,可明显提高肿瘤化疗效果,且毒副作用明显减少。
四川大学 2016-04-22
土壤粪便样本前处理平台-草履虫P2
  土壤/粪便样本前处理平台是一款全自动快速处理土壤/粪便样本的设备,可实现从样本开/关盖、稀释、捣碎、混悬、离心、取样等步骤的全流程自动化。   工作很多,时间很少? 土壤/粪便样本前处理平台为您分担烦恼 一体化:全实验流程整合于一机,一键运行,实验无忧 全自动:360°旋转式抓放离心管机械手,实现全流程自动化 紧凑设计:极小空间内同时处理至少48个样本 整合模块:整合开/关盖、稀释、捣碎、混悬、离心、取样等模块   可在30分钟内一次性处理48个样本,实现无人值守,一键运行。 产品特点 精准移液 三轴机械臂定位准确,精准自动化移液,配置液面探测、空气/凝块/漏加/碰撞检测,全过程自动监控,防止少加、漏加 高效快速 自动完成样本的开/关盖、稀释、捣碎、混悬、离心、取样等步骤,快速处理大量样本,提高工作效率 智能混悬 多通道一次性捣碎头,捣碎力反馈精准 充分振荡/混悬,提高样本有效成分的检出率 灵载兼具 台面可根据实验需要,灵活摆放样本,可批量上样 灵活抓放 360°旋转式离心管机械手可抓放24个离心管适配器,带抓取反馈、掉落检测、自锁装置,实现离心管灵活抓放 直观易用 软件内置多种实验流程,可简单快速自定义编辑, 一键操作   在实验室自动化赛道,长沙演化生物科技有限公司正以自主创新引擎驱动,崛起为国产高端智造的新一代领跑者。  
长沙演化生物科技有限公司 2025-05-16
具有高填充因子的聚合物太阳能电池
通过合成新型高分子半导体并优化器件工艺,该工作取得了聚合物太阳能电池领域前所未有的高填充因子(76%-80%)。论文还通过对太阳能电池薄膜形貌、电子性质和器件物理的深入研究揭示了高填充因子的起源。其工作原理在于,聚合物和富勒烯取得与基底平行方向的相分离,与基底垂直方向的相渐变(图 1)。该形貌特征有效地抑制了电荷复合,使得电荷能有效和定向性地收集。研究发现,80%的填充因子接近硅太阳能电池,也预示聚合物太阳能电池能量转化效率可能远高于现有水平。
南方科技大学 2021-04-13
结瘤因子水解酶在共生过程中的作用
团队发现了一种结瘤因子水解酶 (MtNFH1),它虽然缺乏几丁质酶活性,但是能够特异地水解来自苜蓿中华根瘤菌中的结瘤因子,表明了MtNFH1对于结瘤因子具有更高的偏好性。在这篇文章中,Staehelin教授团队研究了结瘤因子水解酶(MtNFH1)在共生中的作用。研究发现,当接种苜蓿中华根瘤菌时,结瘤因子水解酶积聚在侵染腔中表达。截形苜蓿结瘤因子水解酶突变体研究发现,在突变体中根瘤菌入侵呈现延迟的现象,说明过量的结瘤因子会抑制侵染线的形成。结瘤实验研究发现,突变体早期根瘤呈现根瘤肥大和分支状(二分体或掌状-珊瑚状)。同时,根瘤的分支状表型也分别出现在结瘤因子水解酶过表达植株和野生型植物接种结瘤因子过表达菌株中。因此,结瘤因子水解酶对于结瘤因子浓度的精准调控是根瘤菌入侵根毛以及成熟根瘤形态发生所必需的。
中山大学 2021-04-13
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