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一种
DNA
标记用荧光探针及其合成方法和用途
本发明公开了一种DNA标记用荧光探针及其合成方法和用途,该方法步骤为以乙醇为溶剂,加入摩尔比为1.05~2:1的N-(4-丁磺酸基)-4-甲基喹啉内盐和3-甲酰基-6-(4-乙烯基吡啶)-9-乙基咔唑以及催化量的哌啶,加热回流4-8小时;反应完毕,减压蒸馏除去溶剂,用硅胶柱层析得到荧光探针。本发明的DNA标记用荧光探针与双链DNA(ds26)有强烈的相互作用,在抗肿瘤药物合成具有潜在的应用价值。本发明的DNA标记用荧光探针具有荧光背景低、与双链DNA(ds26)结合特异性强、制备简单和结构稳定等特点。
天津城建大学
2021-04-11
一种改进的海洋泥样微生物总
DNA
提取方法
本技术方法提取的DNA质量 高,产率达0.4ug DNA/g湿土,适 合进一步纯化以构建宏基因组文 库。
中山大学
2021-04-10
揭示非典型尿嘧啶
DNA
糖基化酶UdgX的催化过程
通过解析蛋白脱底物及其与配体、DNA等一系列晶体结构(图a-c),该研究揭示了MsmUdgX独特的催化过程。研究发现,MsmUdgX首先对含U底物的 DNA发生尿嘧啶切除作用,然后其第109位的组氨酸与单链DNA底物AP位点的糖环形成一个共价键,因此可以耐受变性剂的作用;同时也由于酶无法再生,从而失去其固有的尿嘧啶酶切活性。该研究共解析了五套 MsmUdgX 的晶体结构,各自代表其催化途径中不同阶段酶所处的状态,提出了如图e所示的催化路径模型,可能经历一个称为“oxacarbenium”的中间体。该机制不但合理解释了MsmUdgX酶独特的生化性质,而且发现酶在反应中通过一种“自杀”的方式抑制其自身活性,在已知的UDG酶中尚属首例。此外,由于MsmUdgX只存在于细菌中,研究者的MsmUdgX-DNA共价复合物的结构可能为新型抗菌药物的设计提供新思路,具有潜在的应用前景。
中山大学
2021-04-13
一种保持种子活力的玉米单粒胚乳
DNA
的提取方法
本发明公开了属于农业生物技术领域的玉米单粒胚乳DNA的提取方法。本发明先将种子浸泡,然后切去部分胚乳,再加入浸提缓冲液,在55℃水浴后将胚乳研磨;向胚乳中加入CTAB抽提液进行抽提,再加入蛋白酶K和醋酸钠,最后加入饱和酚和氯仿/异戊醇,离心;向上清液中加入异丙醇,离心,用70%乙醇冲洗沉淀,干燥,加入TE中溶解。本发明方法不破坏种子本身的生活力,切除部分胚乳后仍可育苗移栽,利于进行大规模分子标记辅助选择;其次,本发明方法提取的DNA浓度高、纯度高;此外,本发明方法可在室内对育种后代进行分子标记辅助选择,工作效率高,节约人力、物力和财力;最后,本发明被切割种子被感染发霉的概率低,育苗成功率高。
青岛农业大学
2021-04-13
上海科技大学
DNA
编码化合物库技术(DEL)方法专利许可
该项目获得2022年第五届上海科技大学创新创业大赛生命学科赛场教师组三等奖;获得2019年第二届上海科技大学创新创业大会创新组三等奖。
上海科技大学
2023-03-16
北京师范大学病毒进化
溯源
技术服务采购项目竞争性磋商(二次)
北京师范大学病毒进化溯源技术服务采购项目竞争性磋商
北京师范大学
2022-06-24
检测基因P53的比率电化学
DNA
传感器修饰电极及其制备方法
本发明涉及电化学检测技术领域,具体公开了一种用于检测肿瘤抑制基因p53的修饰电极及其制备方法。用于检测P53基因的探针,由一条单链DNA辅助探针S1和一条单链DNA捕获探针S2组成,所述S1的DNA链序列为:5’-Fc-CTC TCA GTG ATT TTT TTA GTG AGA GAG-(CH2)6-SH-3’,所述S2的DNA链序列为:5’-MB-TCA CTG AGT CTT CCA GTG TGA TGA TCA CT-3’。 本发明所提供的方法制备简单,操控方便,使用成本低,与毛细管电泳、变性高效液相色谱、变性梯度凝胶电泳以及酵母中分离的等位基因功能分析技术等方法相比较,电化学生物传感器的方式具有样品无需前处理,易操控,反应条件简单、成本低等优点。肿瘤抑制基因P53是一种被称为“基因组的守护者”的抑癌基因,是一系列同工型蛋白质(P53蛋白)的同源基因。由该基因编码的一系列蛋白质具有调控细胞分裂、修复和凋亡的作用。国际癌症基因组协会已经证明,P53基因是在人类癌症有关的基因中突变最为频繁的基因。在人类已知的所有恶性肿瘤组织中,该基因出现突变的概率在50%以上,是迄今为止人类发现的与癌症相关性最高的基因。因此检测P53基因对临床上预防和治疗癌症有着非常重要的作用,本方法制备简单,操控方便,使用成本低,在医学上有广阔的应用前景。
青岛大学
2021-04-13
研究揭示双加氧酶的低复杂度结构域调控
DNA
氧化去甲基化
该研究揭示了Tet双加氧酶催化活性中心的一个低复杂度结构域(Low complexity domain,LCD)介导该家族蛋白的酶活负调控,阐述了LCD保护卵母细胞甲基化组免受过度氧化的重要作用,显示DNA甲基化谱式的正常建立对于哺乳动物发育至关重要。
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心
2024-01-08
一种基于光诱导介电泳技术和纳米孔的
DNA
测序装置和测序方法
本发明公开了一种基于光诱导介电泳技术和纳米孔的DNA测序装置和测序方法,该装置包括介电泳装置、纳米孔单分子传感器、隧穿电流信号检测系统、离子电流信号检测系统以及激光系统;传感器位于介电泳装置的内部,将介电泳装置分为左右两个空腔,且该传感器设有将左右两个反应腔连通的通孔;隧穿电流信号检测系统与纳米孔单分子传感器电连接;离子电流信号检测系统的两端分别置于通孔左右两侧的反应腔内;激光系统位于介电泳装置的外部,其发射的激光束照射于介电泳装置上。本发明减慢了DNA过孔速度,提高了测序精度,这些为实现单碱基分辨
东南大学
2021-04-14
结直肠癌筛查、早期诊断及预后预测的循环肿瘤
DNA
甲基化分子标记物
在该研究的训练组和验证组人群中,CRC诊断模型和预后预测模型均表现出了令人满意的效果。在训练组和验证组的人群中,该诊断模型准确率均达到96%,并且在验证组中该模型诊断敏感性达87.9%,特异性达89.6%,相对于目前临床常用的结直肠癌血清标志物癌胚抗原CEA的准确率为67%,诊断准确度大幅度提高。在对患者预后预测的准确性方面,根据ctDNA甲基化标志物预后预测模型计算得到联合预后评分指数(cp-score)对患者的预后预测的准确性要明显高于临床常用的预后指标,如肿瘤原发部位、TMN分期、CEA等。而将cp-score与这些常规预后指标结合以后,对患者预后预测的准确性还能够得到进一步的提高,在训练组患者中对预后预测的准确性达到82%,在验证组患者中对预后预测的准确性达到87%。对预后的准确预测,可很好的指导医生对不同的患者进行更为个体化的精准治疗,例如对预后不佳者避免给予过度的治疗,而对复发高危患者则给予更为积极的辅助治疗等。 研究团队还在前瞻性队列中验证了单个ctDNA甲基化标志物在结直肠癌筛查中的价值。通过对1493例结直肠癌高危人群同时进行的肠镜筛查和血浆ctDNA甲基化检测结果进行比较,显示ctDNA甲基化标志物可检测出26例早期肠癌患者,26例进展期腺瘤(癌前病变),对肿瘤的检出敏感性达89.7%,特异性达86.8%,对进展期腺瘤的检出率敏感性达33.3%,敏感性和特异性均较现有的无创筛查方法有所提高。这一研究结果对于优化结直肠癌筛查,具有重要的意义,有非常广阔的应用前景。 徐瑞华教授团队的这项成果是我国科学家在肿瘤液体活检领域又一项具有国际领先水平的重大突破,不仅为CRC的筛查提供了新的方法,也为CRC的精准诊治提供了重要的参考。目前该团队仍在积极开展ctDNA分子标志物在其他肿瘤筛查、诊断、预后预测、靶向药物筛选等方面的基础和转化研究,为发现更多的早期肿瘤患者,进一步改善患者的疗效和预后,提供更多、更有力的工具和手段。
中山大学
2021-04-13
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