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关于冷冻电镜解析的人源蛋白酶体组装的变构选择机制
蛋白酶体是细胞用来调控特定蛋白质的浓度和清除错误折叠蛋白质的主要机制,是细胞中最普遍的不可或缺的大型 蛋白复合机器之一,也是迄今为止发现的最大的蛋白降解机器。 蛋白酶体全酶是由盖子 (Lid)和基座(Base)亚复 合体组成的调控颗粒RP(Regulatory Particle)所激活。基座亚复合体在组装过程中最重要的一个步骤是异质六 聚AAA-ATPase环的组装。这个过程至少需要被PAAF1, p28/gankyrin, p27/PSMD9和S5b这四种调控颗粒(RP)组 装伴侣蛋白分子所引导。天然的自由态19S调控复合体的构象存在大量的亚稳定态,并表现出大幅度的局部构象涨 落,使冷冻电子显微镜技术成为解析其结构的唯一手段。利用 冷冻电镜解析人源蛋白酶体全酶的基础上(见PNAS 2016, 113: 12991-12996),利用他们自主开发的基于统计 流行算法的高性能计算软件ROME(见PLoS ONE 2017, 12:e0182130)与优化的冷冻电镜处理方法对p28-RP复合 体细微动态构象进行深度分类,共解析出了1个4.5-? p28绑定的调控颗粒(RP)非AAA的亚复合体,3个近7-? p28 绑定的完整RP结构,1个亚纳米精度下的非p28绑定的完整RP结构以及7个亚纳米精度下的由Rpn1-p28-AAA组成的p28 绑定RP的亚复合体的动态构象。观察到自由态RP调控颗粒中p28-绑定的AAA环并没有组成的闭 环孔状通道,而是自发地在Rpt2-Rpt6和Rpt3-Rpt4界面上形成多个由“开”到“关”的拓扑变构。
北京大学 2021-04-11
细胞新型自噬受体调控机体抗病毒天然免疫反应的新机制
该研究发现RNA病毒感染宿主细胞可诱导表达一种新型自噬受体CCDC50,该自噬受体通过识别K63型泛素化修饰的RNA病毒模式识别受体RIG-I/MDA5(RLR)并介导后者的自噬途径依赖的降解,从而抑制病毒感染诱导的I型干扰素的产生,帮助机体恢复到静息状态,避免过度免疫反应造成的组织损伤和自身炎症。我校博士后侯盼盼为论文第一作者,郭德银教授为通讯作者,我校医学院、附属第七医院为第一作者单位。       天然免疫是一种非特异性的宿主抵抗病原微生物入侵的免疫反应,它广泛存在于机体的绝大部分细胞,被认为是机体抵抗病原体感染的第一道防线。随着近几十年的研究,人们对天然免疫系统愈发了解,已经发现并鉴定出天然免疫反应的关键调控因子和信号转导因子,然而某些重要调控因子的结构和功能机制依然不清楚,且这些调控因子的生理和病理作用尚有待于研究。郭德银教授课题组利用CRISPR/Cas9第二代文库在免疫细胞中进行了全基因组水平的大规模无偏差筛选,发现了一系列参与天然免疫反应调控的新型基因。进一步的验证过程中发现CCDC50蛋白在RNA病毒感染下表达量显著增加且其表达模式和RLR的表达模式一致,提示着CCDC50可能参与调控RLR介导的信号通路活性。为了进一步验证该观察结果,该课题组构建了CCDC50条件缺失的小鼠模型,攻毒实验结果证明缺失CCDC50后,病毒感染条件下,I型干扰素表达上调,其下游的ISGs表达水平也随之升高,小鼠清除病毒能力增强,肺部组织损伤和炎性浸润减少,且小鼠存活率增加,从而证明CCDC50在机体水平具有生理学功能。       进一步的机制探究中,该课题组发现CCDC50特异性识别K63泛素化修饰的RLR,并促进激活的RLR的自噬途径依赖的降解,此机制不同于以往了解较多的K48泛素化依赖的降解调控。该过程的发生并不依赖于常见的自噬受体p62, 因p62缺失后,CCDC50依然可以促进RLR的降解,但CCDC50可与p62协同作用。刘迎芳教授团队解析了CCDC50分子LIR结构域和LC3复合体的晶体结构,结构分析证明CCDC50中存在一段非典型的LIR基序,该基序可以结合位于LC3的LDS结合位点,将K63泛素化修饰的RLR拉进自噬小体。有趣的是,紧邻LIR基序,CCDC50有一段MIU基序,该基序可称为反向UIM基序,体外生化实验证实CCDC50-MIU可以结合在LC3的UDS位点,进而证明CCDC50是一种新型自噬货物受体,可以以两段不同的疏水基序结合在LC3的不同位点。这类自噬货物受体是首次在生物体内被发现
中山大学 2021-04-13
张东教授团队解析了转录因子MdWOX11抑制苹果不定芽形成的机制
近日,园艺学院果树发育生物学团队在《HorticultureResearch》在线发表了题为“TranscriptomeanalysisrevealstheregulatorymechanismbywhichMdWOX11suppressesadventitiousshootformationinapple”的研究论文。该论文报道了MdWOX11通过结合并诱导细胞分裂素(CTK)合成基因MdCKX5表达促进离体叶片受伤部位CTK的积累,进而促进不定芽形成。
西北农林科技大学 2022-07-11
促进稻麦同化物向籽粒转运和籽粒灌浆的调控途径与生理机制
该成果 2015 年获教育部自然科学奖一等奖, 2017 年获国家自然科学奖二等奖。成果首创了促进稻麦同化物转运和籽粒灌浆的水分调控方法,开辟了促进谷类作物籽粒灌浆生理调控的新途径,获得了作物产量形成机制的新认识,建立了促进稻麦同化物转运和籽粒灌浆的新理论。应用该技术,水稻增产 8~12%,灌溉水利用效率增 30~40%;小麦增产 6~10%,灌溉水利用效率增 20~30%。
扬州大学 2021-04-14
VASH2-SVBP蛋白复合物进行微管蛋白去酪氨酸化的分子机制
生物系黄鸿达课题组博士后汪娜等解析了VASH2-SVBP复合物的晶体结构,并且通过生化和细胞实验证明SVBP不仅能够帮助VASH2进行正确的表达和折叠,而且对于VASH2进行a-微管蛋白C末端去酪氨酸化的功能也起到至关重要的作用。团队还获得了VASH2-SVBP与两种抑制剂(epoY和TPCK)的复合物晶体结构,阐明了这些抑制剂的抑制机理。此后,团
南方科技大学 2021-04-14
金王紫糯 1 号
一代杂交种,株型紧凑,全株叶片数 18 片。鲜穗采收期 72 天,株高 258厘米,穗位 95 厘米,倒伏率 0.6%、无倒折。果穗短锥形,商品鲜穗穗长 21.2厘米,穗粗 4.7 厘米,秃顶 1.5 厘米,穗粒数 498 粒,商品果穗率 83.8%,白轴,鲜穗籽粒淡紫色,果皮中厚。2012 年经河北省农林科学院植物保护研究所抗病性接种鉴定:抗小斑病,高感大斑病,感弯孢叶斑病,高抗瘤黑粉病,抗矮花叶病。在 2011~2012 年全
青岛农业大学 2021-01-12
马铃薯品种华恩1号
可以量产/n成果简介:华恩1号由华中农业大学、湖北恩施南方马铃薯研究中心合作选育,利用晚疫病水平抗性材料393075.54和391679.12进行有性杂交,经抗性、产量、品质严格选择育成。该品种株高80cm左右,株型半扩散,茎叶绿色,浅紫色花。从出苗至成熟85天左右。结薯集中,薯形扁椭圆,薯块表皮光滑,芽眼浅。大中薯率80%左右。食用品质优良。块茎淀粉含量17.0%,还原糖含量<0.1%(鲜重)且抗低温糖化,Vc含量11.85mg/100g鲜薯,适于油炸薯片和马铃薯全粉加工。抗晚疫病且抗性稳定,感普
华中农业大学 2021-01-12
夏普短焦镜头0.9:1
镜头型号 YF-C08EXC 类型 短焦定焦 电动位移 YES 焦距(mm) 13.2 F值 2.1 镜头直径(mm) 90 重量(KG) 1.9 离轴率 1:1 投射比 0.9:1 投影距离(m) 尺寸(英寸) 长*宽(m) 0.7 40 0.8*0.6 1.1 60 1.2*0.9 1.4 80 1.6*1.2 1.8 100 2.0*1.5 2.2 120 2.4*1.8 2.7 150 3.0*2.3 3.7 200 4.1*3.0 4.6 250 5.1*3.8 5.5 300 6.1*4.6 6.4 350 7.1*5.3 7.3 400 8.1*6.1 适用机器型号:夏普XG-PH900X XG-PH905X
无锡羿飞教育科技有限公司 2021-08-23
夏普短焦镜头0.75:1
镜头型号 YF-C08MZB 类型 短焦定焦 电动位移 YES 焦距(mm) 13 F值 2 镜头直径(mm) 80 重量(KG) 0.8 离轴率 1:1 投射比 0.75:1 投影距离(m) 尺寸(英寸) 长*宽(m) 0.6 40 0.8*0.6 0.9 60 1.2*0.9 1.2 80 1.6*1.2 1.5 100 2.0*1.5 1.8 120 2.4*1.8 2.2 150 3.0*2.3 3 200 4.1*3.0 3.8 250 5.1*3.8 4.5 300 6.1*4.6 5.3 350 7.1*5.3 6 400 8.1*6.1 适用机器型号:夏普XG-C435XA/465XA
无锡羿飞教育科技有限公司 2021-08-23
NEC短焦镜头0.9:1
镜头型号 YF-NP06FLC 类型 短焦定焦 电动位移 YES 焦距(mm) 13.2 F值 2 镜头直径(mm) 80 重量(KG) 1.2 离轴率 1:1 投射比 0.9:1 投影距离(m) 尺寸(英寸) 长*宽(m) 0.7 40 0.8*0.6 1 60 1.2*0.9 1.4 80 1.6*1.2 1.7 100 2.0*1.5 2.1 120 2.4*1.8 2.6 150 3.0*2.3 3.6 200 4.1*3.0 4.4 250 5.1*3.8 5.3 300 6.1*4.6 6.2 350 7.1*5.3 7 400 8.1*6.1 适用机器型号:NEC NP4000+, NP4001+, NP4100+, NP4100W+
无锡羿飞教育科技有限公司 2021-08-23
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