本发明提供了一种油菜硼高效基因BnA3NIP5；1Q的转座子插入片段TEQ，涉及基因工程技术领域，所述转座子插入片段TEQ的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明所述的转座子插入片段TEQ来源于油菜硼高效基因的BnA3NIP5；1Q启动子，全长1415bp，通过确定油菜中是否具有该转座子插入片段TEQ可快速有效的鉴别油菜是否具有抗低硼胁迫性能，加快具有高硼利用率的油菜育种速度。