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一种新的录组
测序
快速
建
库
方法
基于SHERRY方法的转录组测序建库流程如图1所示,样本可以来自裂解的单细胞或bulk RNA;RNA分子经过oligo-dT 引物的反转录后,RNA/DNA杂合链可直接被Tn5转座酶打断(图中灰色的波浪线及直线分别代表RNA及DNA分子);在Tagmentation之后,转座酶会在杂合链两端加上adaptor接头,进行之后的建库PCR扩增。 基于100pg的RNA起始量,SHERRY表现出了高的read匹配率,同时可检测出近9000个基因,其中72%的基因可在三个重复样本中检测出,可重复性较好。与目前普遍应用于单细胞转录组测序的Smart-seq2技术相比,SHERRY与其建库质量不相上下,并且具较低的GC bias。此外,SHERRY整个流程仅需要5个步骤,且可在一个管子中完成,整个时间仅约4小时,其中手工操作时间不到半小时。相比之下,Smart-seq2整个耗时约为SHERRY二倍的时间,且需要一些前处理等操作;此外,包含十个步骤的NEBNext方法则需要更加多的实验室操作和时间成本。值得一提的是,在成本方面,SHERRY方法仅为其他两种方法的五分之一,将大大节省实验成本。
北京大学
2021-04-10
智能无人化生物
样本
库
解决方案
主要用于保存生物大分子及部分小分子及组织生物活性,为生物样本提供超低温(-80℃)、深低温(-196℃)环境下的自动化无人存储及管理服务,包括生物样本稳定存储、信息记录与追溯、自动挑取整盒或单支管等。
青岛海尔生物医疗股份有限公司
2023-04-25
一种人工智能扫描内窥影像
样本
库
管理系统
医疗内窥镜是目前常用的一种临床诊断工具,尤其对于消化科的医生而言,他们通过内窥镜能直接观察到人体消化器官内部的病变情况,如溃疡、肿瘤等,甚至还可以利用内窥镜进行微创的外科手术,在医学界应用广泛。与放射科的阅片相比,消化内镜是消化道病变筛查和诊断的金标准,也是微创和无创治疗的主要手段。 由一款围棋人工智能程序AlphaGo(阿尔法围棋)开始,人工智能开始走进大众的视野。世界范围内对其的广泛讨论预示着人工智能时代已经到来。随着深度学习算法不断发展、日益成熟,人工智能已逐步用于医疗影像分析领域。近年来,关于内窥镜影像在AI领域的发明成果如潮水般涌现。 在内镜检查中,操作医师将抓取的图像和视频保存到内镜报告系统中,再由诊断医生根据这些抓取的影像出具诊断报告。由目前公开的内窥镜影像收集归纳系统中,尚未利用深度学习的方法来进行胃、肠的内窥镜影像学习,进而构建一个较为全面的内窥镜影像的样本库。目前的方法不利于简化医生的操作且不具有数据归一化处理和转换能力,无法根据数据适用范围的不同对数据进行管理和提供智能的数据分析功能。 一种人工智能扫描内窥影像样本库管理系统包括以下模块:图像输入模块,用于收集内窥镜图片;按官方标准,将胃部或者肠部内镜视野分成多个部位,通过人工智能系统对从医院内窥镜系统采集的图像进行预分类,并将影像数据上传至系统指定文件目录;登陆模块,用于在注册医生登录系统进入当前功能菜单后,对图片进行评图,确认该图片类别是否正确;系统主控界面,用于进行人机交互,并对图像进行显示;业务功能模块,包括:图像分类单元、视频库单元、病灶标记单元、我的任务单元、用户信息单元;系统设置模块,用于管理用户与权限。本发明界面美观友好、信息查询灵活方便;对上传影像数据智能分类,减少医生操作,只需最终确定。 本系统产生的价值在于: 一、界面美观友好、信息查询灵活方便; 二、对上传影像数据智能分类,减少医生操作,只需最终确定; 三、数据库管理模块,具有数据归一化处理和转换能力,根据数据适用范围的不同对数据进行管理,提供智能的数据分析功能; 四、集成第三方标记工具,标记过程简单清晰,结果数据稳定可靠; 五、用户权限设置合理,系统安全级别高; 六、防错退出模式,保证系统安全稳定运行。
武汉大学
2021-05-12
一种人工智能扫描内窥影像
样本
库
管理系统
项目成果/简介:医疗内窥镜是目前常用的一种临床诊断工具,尤其对于消化科的医生而言,他们通过内窥镜能直接观察到人体消化器官内部的病变情况,如溃疡、肿瘤等,甚至还可以利用内窥镜进行微创的外科手术,在医学界应用广泛。与放射科的阅片相比,消化内镜是消化道病变筛查和诊断的金标准,也是微创和无创治疗的主要手段。由一款围棋人工智能程序AlphaGo(阿尔
武汉大学
2021-01-12
样本
出入库系统
样本出入库管理系统是生物样本资源管理的核心部分,涵盖了样本采集、样本处理、样本入库、样本安全, 查询统计、样本存储、样本应用、样本质控、项目管理、权限管理等多个方面的内容,使用户能够对样本 信息的录入、检索、筛选和取用进行高效率地综合管理。
广州联智信息科技有限公司
2021-11-01
武汉大学人工智能扫描内窥影像
样本
库
管理系统亮相首届高等学校科技创新大会
首届高等学校科技创新大会上,武汉大学一种人工智能扫描内窥影像样本库管理系统在大会核心板块“献礼建党100周年”高校科技创新成果展科技抗疫-生物产业展区进行展出。该系统具有信息查询灵活方便、数据智能分类、数据归一化处理、集成第三方标记工具、系统安全级别高、防错退出模式,保证系统安全稳定运行等诸多优势。
云上高博会
2021-06-11
杨
建
杨建,男,党委副书记/副院长/副教授,所在学科:交通运输工程,硕导/博导:在职员工,主讲课程:汽车运用工程,研究方向:现代汽车轮胎技术;生物仿生学
杨建
2021-06-23
马
建
马建 博士 教授 博士研究生导师 副院长,吉林省遗传学会副理事长,主要从事作物遗传育种方面的教学、科研工作,主持国家级、省部级科研课题10余项,以第一完成人获得吉林省科技进步二等奖、三等奖,吉林省自然学术成果二等奖、三等奖,长春市科技进步一等奖、三等奖,吉林省农业技术推广一等奖等奖励多项项,作为第一选育人选育国审、省审水稻新品种10余个。
马建
2021-06-23
载玻片
样本
加热装置
本实用新型公开了一种载玻片样本加热装置,包括电源、电热丝、风扇、载玻片放置架、加热室和底座,电源为所述电热丝和风扇供电,载玻片放置架位于所述加热室内,加热室的上端设置有盖体,载玻片放置架通过齿轮齿条升降机构设置在所述加热室内,在所述底座上设置有与伺服电机连接的升降开关;所述盖体的一端铰接连接在所述加热室上;在所述加热室的上端一侧设置有电磁铁,在所述盖体上设置有与所述电磁铁对应的铁片;所述电热丝、风扇和电磁铁通过一个定时器与所述电源组成回路。本实用新型结构简单,操作方便,加热均匀快速,能够定时加热的适用于少量样本。
青岛农业大学
2021-04-13
便携式
测序
设备
郭佑民教授团队利用AI技术为新冠肺炎的影像诊断“赋能”。依托专家训练,人工智能结合传统的计算机视觉技术,对新冠肺炎患者肺部病变区域进行分割、计算,可以同时获取病变区域的体积、密度、磨玻璃成分等定量参数,尤其是对于患者随访的数据,可以实时进行图相配准,精准定位病灶位置、大小,方便比较病变的消长。
东南大学
2021-04-10
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