生物振荡网络作为生命体的内禀时钟,调节各种与时间信息相关的生命过程,因此需要在减小计时涨落的同时,保持对环境信号的敏感性。 对于处于热力学平衡态的系统,涨落耗散定理表明,高响应与低涨落不可能同时完成。但是生命系统处于非平衡态,并没有涨落耗散定理的约束。对于振荡网络这一非平衡态系统,如何保持高敏感性和精确性,以及对应的热力学的设计原理,是一个重要的利用物理原理理解生命系统的基本问题。
欧阳颀教授研究组与美国IBM沃森研究中心的涂豫海教授(北京大学物理学院/定量生物学中心教授)展开合作,首次从理论上揭示了生化反应网络优化振荡功设计原则。研究发现,通过增加系统的自由能耗散,振荡的计时精确性增加,这与之前的研究相符;更重要的是,耗散的增加还能够增强系统对于外界信号的响应,两者呈正比关系。通过对简单模型的解析发现,额外的自由能耗散可以加强振荡相位与振幅的耦合,借此来增强对信号的响应,从而打破了平衡态的涨落响应关系。为了同时达到高敏感性和精确性,系统需要精细的分配参与反应的非平衡环路中的自由能耗散。研究基于化学势与反应流提出了两条重要的能量分配原则,并在相关实验数据分析中得到验证。
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