本发明提供一种脂肪酸修饰的有机荧光染料生物探针,该有机荧光染料生物探针是在有机荧光染料或量子点上连接脂肪酸形成的有机荧光染料探针或量子点探针。本发明的效果是该生物探针制备方法简单,对丝状菌细胞具有较好的标记靶向性,为标记丝状菌细胞进行污泥膨胀的预警研究提供方便。在标记过程中增加了生物探针与丝状菌细胞的生物相容性。该生物探针对丝状菌的毒性低,灵敏度高,使用量少。