首次构建了完整的食道小细胞癌基因组图谱,发现了8个高频突变基因,包括5个在癌症中研究的比较广泛的基因TP53、RB1、NOTCH 1、FAT1和FBXW7;以及3个未在肿瘤中报道过的高频突变基因PDE3A、PTPRM和CBLN2。
研究还发现,细胞周期、p53、Notch 信号通路以及Wnt通路相关基因的体细胞改变积累。提示这些通路的改变可能是导致食道小细胞癌恶性进展的关键。其中Wnt/β-catenin通路中DVL3和上游基因的扩增、以及下游分子的表达上调,证实了该通路在食道小细胞癌中显著激活,是食道小细胞癌中重要的分子事件,今后需要进一步研究这一现象背后的机制。
研究还发现了与染色质重塑过程有关基因的显著改变,并观察到食道小细胞癌中与小细胞肺癌相似的体细胞基因组改变,如p53和RB1缺失以及Notch家族中的突变。其中,携带Notch家族基因突变的病人生存显著差于未携带Notch家族基因突变的病人。
此外,通过和多种肿瘤的突变图谱和拷贝数变异图谱对比分析发现,食道小细胞癌与小细胞肺癌相比更接近食道鳞癌和头颈部鳞癌,提示来源于食道的小细胞癌与来自肺的小细胞癌有不同的生物学背景。这些结果提示来自不同部位的小细胞癌具有异质性,并不能被作为同一类型疾病诊治。
本研究揭示了食道小细胞癌的基因图谱,发现了关键的基因组变异,并为更好地理解食道小细胞癌的发病机制和为这类恶性疾病患者制定更好的治疗策略提供了理论基础。
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