Mpa六聚体除了与真核生物蛋白酶体调节颗粒Rpt1-Rpt6蛋白六聚体以及古细菌PAN蛋白六聚体具有一定的结构同源性之外,还具有一些明显不同的结构特征:(1)结核杆菌Mpa具有形成双环的两个串联寡核苷酸/寡糖结合(OB)结构域,而古细菌蛋白酶体相关ATPase调控颗粒(PAN)和真核生物蛋白酶体ATPase调控颗粒复合体(Rpt1-6)每个蛋白亚基都只具有单个OB结构域;(2)Mpa在具有蛋白酶体活化功能的C末端之前具有一个泛素样的β-grasp结构域,而古细菌PAN和真核生物Rpt1-6蛋白复合体并不具有这样的一个β-grasp结构域
由于β-grasp结构域的存在,Mpa六聚体中各个蛋白亚基C末端被埋在结构核心中而没有暴露在蛋白复合体结构的表面,这就影响了C末端的GQYL基序与20S 蛋白酶体复合体的对接,从而阻碍了六聚化的Mpa与七次对称的28聚体的蛋白酶体相互作用。我们通过功能研究进一步解释了为什么单独的Mpa六聚体在体外情况下不能有效结合蛋白酶体核心颗粒并启动蛋白质特异性降解,结合晶体结构域功能研究,我们提出了结核杆菌蛋白酶体ATPase调控颗粒Mpa与20S蛋白酶体复合体这一分子量超过1100KDa蛋白质机器的作用模型
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