菊粉内切酶是能够使菊科植物菊芋或菊苣所含多糖(-键连接的聚果糖)在糖链内部随机降解,生产低聚果糖的生物酶。低聚果糖具有增殖肠道双歧杆菌、排除体内有害物质、增强免疫力、降低胆固醇、预防结肠癌、抗衰老等多种生理功能,作为保健品具有巨大的市场。目前亚洲国家和地区,如中、日、韩、台湾等,都是以蔗糖为原料利用果糖基转移酶合成的(合成法)。产品纯度低、工艺复杂、成本高,需要色谱分离才能得到纯度高的产品。菊芋或菊苣产量高、种植成本低、富含菊糖(-键连接的聚果糖)。