一批潜在新冠病毒棘突蛋白抑制剂的研究

南方科技大学生物系副教授王冠宇研究团队、医学院教授张健研究团队联合深圳大学总医院李海鹰研究团队初步筛选出一批新型冠状病毒棘突蛋白(spike glycoprotein)潜在抑制剂，相关成果发布在预印版平台Research Square。

研究表明，新冠病毒利用其包膜上的棘突蛋白识别人类细胞膜受体蛋白ACE2，从而侵染人类细胞，引发严重的呼吸道感染症状。阻止病毒棘突蛋白与人类受体蛋白ACE2相互作用是研发有关药物、抗体和疫苗的重要方向。

新冠病毒棘突蛋白抑制剂筛选策略

联合研究团队为加快有关抑制剂的发现，采用“老药新用(Drug repurposing)”的策略，以公开的RBD-ACE2复合物晶体结构为靶点，通过同源建模(Homology Modeling)、计算机辅助药物设计(Computer-aided drug design, CADD)和虚拟筛选(Virtual screening)等计算生物学方法，筛选了近15000个小分子化合物。这些化合物包含Drugbank化合物库中所有的FDA批准药物，以及TCMSP化合物库中的天然活性产物。研究团队将这些化合物与病毒棘突蛋白受体结合结构域进行分子对接，发现一批结合非常紧密的化合物，如Digitoxin,Nilotinib,Lemborexant，Raltegravir,Bisindigotin和 Evodiamine等。

Digitoxin与棘突蛋白结合模式图 Bisindigotin与棘突蛋白结合模式图