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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题
癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一，基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性，对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义，而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析，还面临很多挑战。
肿瘤样本具有其独有的特点，在样本制备和单细胞分离过程中，其细胞应激反应大、坏死细胞多，为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战；
肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题，比如复杂的微环境和高度的异质性，而如何充分考虑这些难点，并从信息学的视角进行深入研究，有待建立全面、自动的分析框架；
肿瘤单细胞数据的分析，对科研人员的编程能力和分析经验要求很高，亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛，提高研究的效率。
2.解决方案
本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括：
1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题，提出了全面、精细的数据质量控制方案；
2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程（数据标准化、降维、聚类、差异表达分析）；
3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法；
4)从重要表型（细胞周期、干性）、基因集（已知的和潜在的）两方面深度解析了肿瘤内部的异质性；
5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法；
6)构建了自动化、智能化分析的软件平台，能够自动生成全面、直观的分析报告。
基于本项成果产生的产品、服务或解决方案：
1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer；
2)针对软件使用和分析结果解读的服务；
3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。
3、合作需求
团队要求：合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验，能为本项目的应用与落地提供条件；
资金需求：合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学
2022-08-30
一种室内可见光ＯＡＭ组播通信系统发射端
本发明公开了一种室内可见光ＯＡＭ组播通信系统，其下行链路通过激光器ＬＤ产生调制有组播信息的高斯光束，经二维激光分束器和空间光调制器，将准直的激光变成带有螺旋相位的ＯＡＭ光束。空间光调制器在进行ＯＡＭ螺旋相位调制的同时，通过将光束打旋的方式，扩展每一束光的覆盖面积，同时各光束照射区域重叠，以此弥补单一光束的中心暗斑，实现无盲区传输。针对组播通信系统，本
东南大学
2021-04-14
苜蓿木葡聚糖转葡糖苷酶(MtXET）及其编码基因与应用
本发明公开了一种苜蓿木葡聚糖转葡糖苷酶(xyloglucanendotransglycosylase，xet)及其编码基因与应用，所述苜蓿木葡聚糖转葡糖苷酶(mtxet)及其编码基因可以用于调节植物的根系发生发展，由此调节提高植物的抗旱和抗寒能力。本发明的苜蓿木葡聚糖转葡糖苷酶在培育根系更加发达的植物品种中具有重要意义。
北京林业大学
2021-02-01
动物源食品致病菌鉴定及其耐药和毒力基因检测复合芯片
本发明提供了动物源食品致病菌鉴定及其耐药和毒力基因检测复合芯片。本发明提供了用于鉴定动物源食品致病菌、致病菌耐药基因和/或致病菌毒力基因的探针，由序列1‑序列171所示的单链DNA分子组成。本发明实验结果表明：本发明的动物源食品中致病菌鉴定及其耐药和毒力基因检测复合芯片，能够有效的达到同时鉴定细菌及其毒力和耐药基因的综合目的。
中国农业大学
2021-04-11
用于鼻咽癌发病风险预测的试剂盒及基因芯片
鼻咽癌是鼻咽上皮来源的恶性肿瘤，多发于鼻咽顶部和咽隐窝，是一种多因素影响的复杂性疾病，其 发生与发展与遗传因素、EB病毒感染及环境因素密切相关。本研究成果提供了一种用于鼻咽癌的发病风 险预测的试剂盒以及相应的基因芯片，可同时检测多个鼻咽癌易感基因SNP位点，为个体罹患鼻咽癌风险 程度、鼻咽癌高发区人群普查，筛查鼻咽癌发病高危人群以及进行相应预防措施提供参考。本研究成果涵 盖了11个鼻咽癌易感基因SNP位点及EB病毒分型，运用本研究成果设计的Taqman探针及引物，采集受试者 的生物样本进行核酸提取及荧光定量PCR最终获得其基因分型。本研究成果对于鼻咽癌发病风险预测的效 果良好，曲线下面积可达0.737，95%置信区间为0.672-0.802；p值达到了5.06E-10。此预测模型预测鼻咽 癌发病风险的灵敏度和特异度分别为87.41%和53.00%。
中山大学
2021-04-10
基于聚乙烯亚胺的靶向非病毒纳米基因载体的设计与构建
基因治疗现已成为攻克肿瘤最具希望，也是研究最为活跃的领域。基因导入系统是基因治疗的核心技术。现阶段面临的最大难题在于尚未找到理想的基因载体，治疗基因的导入仍然是肿瘤基因治疗的瓶颈。非病毒载体近年来发展迅速，其中聚乙烯亚胺(polyethylenimine PEI)是近年来研究最为广泛的阳离子多聚物非病毒基因载体。
本项目针对聚乙烯亚胺（PEI）转基因载体使用中存在的转染效率与细胞毒性相矛盾及靶向性差等问题，采用生物可降解技术、金属离子配位技术等连接低分子量聚乙烯亚胺(LMW PEI)，得到多分枝状或网状结构的高分子量PEI衍生物，进而选择肿瘤主动靶向多肽RGD、tLype-1等，与细胞穿膜肽TAT(49-57)、核定位信号肽NLS连接，合成具有多功能的数种功能肽RGDC-TAT、RGDC-TAT-NLS、tLype-1-NLS等，利用交联技术将多功能与PEI衍生物偶联，从而构建新型非病毒基因载体系统，旨在保证较高转染效率情况下，降低PEI细胞毒性，增加其对肿瘤的靶向性，克服当前非病毒基因载体的瓶颈问题，为基因治疗探索一条有效途径。
本项目受国家自然科学基金、上海市科委国际学术合作项目及上海市教委科研创新项目资助，发表学术论文数十篇，申请发明专利10项，其中授权7项。
上海海洋大学
2021-05-11
牛传染性鼻气管炎ΔTK/ΔgE基因缺失标志活疫苗
已有样品/n牛传染性鼻气管炎ΔTK/ΔgE基因缺失标志活疫苗。 成果简介：本成果属于动物传染病基因工程技术领域，具体涉及一种牛传染性鼻气管炎病毒（IBRV）ΔTK/ΔgE基因缺失标志活疫苗及制备方法。所述的重组牛传染性鼻气管炎病毒毒株缺失了TK和gE基因。制备的牛传染性鼻气管炎ΔTK/ΔgE基因缺失标志活疫苗毒力大大降低，潜伏的病毒也不易被激活，具有很高的安全性。此外，除了被缺失的TK和gE基因，该缺失毒株仍能表达其他所有毒力基因，具有很好的免疫原性。本成果适用于奶牛、肉牛、耕牛等牛传染性鼻气管炎
华中农业大学
2021-01-12
一种C型凝集素编码基因及其蛋白制备和应用
本发明涉及分子微生物学领域，具体的说是一种C型凝集素(C-type?lectin)及其制备和应用。C型凝集素为序列表SEQ?ID?No.1中的氨基酸序列所示。制备方法：以许氏平鮋cDNA为模板PCR扩增C型凝集素基因，构建质粒pLecC；将pLecC转化大肠杆菌BL21Transetta(DE3)，对转化子进行诱导表达后，收集上清，浓缩后即得重组C型凝集素。所述C型凝集素对多种弧菌具高效凝集作用，经C型凝集素处理后的细菌对许氏平鮋的侵染能力显著降低。因此，该C型凝集素有望应用于鱼类细菌性病害的防治。
青岛农业大学
2021-04-13
用种子蛋白质基因工程改良超大穗小麦的品质
本项目是采用种子蛋白质基因工程手段，将富含赖氨酸的豌豆球蛋白基因（Vicilingene）转入超大穗小麦体内并令其表达，以期大幅度提高超大穗小麦的种子蛋白质含量和赖氨酸含量，改良超大穗小麦的营养品质和加工品质，使超大穗小麦尽快成为大面积推广种植的超高产优质小麦良种。其次，本项研究将丰富分子遗传学理论并开辟一条高蛋白品质育种的新途径，所
西安交通大学
2021-01-12
猪WFIKKN2基因作为胴体性状相关的分子标记及应
研发阶段/n可用于猪胴体性状的遗传改良，在猪的遗传改良中胴体性状的测定需要进行屠宰测定，只有背膘厚度性状可在达到目标体重时进行活体测定，利用这3项专利，可以进行胴体性状的改良（不需要进行屠宰测定），降低背膘厚度，降低板油率和内脂率，提高瘦肉率和腿臀肉骨率。
华中农业大学
2021-01-12