碱基编辑系统BEACON
研究人员基于前期构建的dCas12a碱基编辑器,筛选多种胞嘧啶脱氨酶(APOBEC/AID)和对碱hA3A-dCas12a-BE进行优化改造,最终构建完成新型碱基编辑系统BEACONs (Base Editing induced by human APOBEC3A and Cas12a without DNA break)。BEACON系统不但能够精准高效地介导碱基编辑,而且避免激活细胞DNA损伤响应通路造成的细胞凋亡。
此外,研究人员把BEACON系统应用到小鼠动物体内,成功实现精准安全的碱基编辑。BEACON为拥有碱基编辑体系底层平台性自主知识产权的Cas12a-BE和hA3A-BE两大系列碱基编辑系统升级而成,且具有高效、精准和安全等优势,为碱基编辑系统在基础研究及未来临床领域的全面深入应用提供了更优的选择。
科研人员还构建了新一代全转录组RNA编辑检测计算分析流程RADAR (RNA-editing analysis-pipeline to decode all-twelve-types of RNA-editing, https://github.com/YangLab/RADAR),准确高效地检测碱基编辑中存在的RNA水平脱靶效应。
上海科技大学
2021-04-11