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碱基编辑系统BEACON
研究人员基于前期构建的dCas12a碱基编辑器,筛选多种胞嘧啶脱氨酶(APOBEC/AID)和对碱hA3A-dCas12a-BE进行优化改造,最终构建完成新型碱基编辑系统BEACONs (Base Editing induced by human APOBEC3A and Cas12a without DNA break)。BEACON系统不但能够精准高效地介导碱基编辑,而且避免激活细胞DNA损伤响应通路造成的细胞凋亡。 此外,研究人员把BEACON系统应用到小鼠动物体内,成功实现精准安全的碱基编辑。BEACON为拥有碱基编辑体系底层平台性自主知识产权的Cas12a-BE和hA3A-BE两大系列碱基编辑系统升级而成,且具有高效、精准和安全等优势,为碱基编辑系统在基础研究及未来临床领域的全面深入应用提供了更优的选择。 科研人员还构建了新一代全转录组RNA编辑检测计算分析流程RADAR (RNA-editing analysis-pipeline to decode all-twelve-types of RNA-editing, https://github.com/YangLab/RADAR),准确高效地检测碱基编辑中存在的RNA水平脱靶效应。
上海科技大学 2021-04-11
RNA修饰m6A单基因单碱基检测新技术
( i )能够阻碍 DNA 聚合酶在反转录过程的单碱基延伸;( ii )能够降低缺口连接酶的连接效率。 SELECT 方法采用荧光定量 PCR 的方法进行定量。结合方法优化,发展了 SELECT 方法的 3 个应用实例:( i )在生物学样本总 RNA 或总 mRNA 中检测 mRNA 或 lncRNA 上单位点是否含有 m6A 修饰;( ii )检测生物学样本中特定 m6A 位点的修饰比例;( iii )鉴定 m6A 甲基转移酶或去甲基酶的生理作用靶点。 SELECT 方法不仅简化了生物学样品中 m6A 修饰的检测过程,实现低丰度 RNA 中 m6A 单碱基分辨率的检测,还能够应用于其他 RNA 化学修饰的检测中,例如 N1- 甲基腺嘌呤( N1-methyladenosine , m1A )和 2’-O- 甲基化修饰( 2’-O-methylation , Nm) 等。
北京大学 2021-04-11
非线性编辑系统--高清编辑工作站
产品详细介绍EDWS 1000 技术参数Intel 酷睿 四核 主频3.0GHz> 8G DDRIII SDRAM> 1G 显存专业显卡> SATA 1T 系统硬盘> SATA 2T素材硬盘> 蓝光刻录机 > 24寸高分辨液晶显示器> Windows7 64位操作系统> 最新版EDIUS编辑软件> 专业服务器机箱,木质音箱> EDIUS专用彩色快捷键标识键盘、光电鼠标> 系统光盘、全中文使用手册、系统保修EDWS 1000 产品特性> IEEE1394、S-Video、复合、RCA非平衡音频,HD/SD YUV分量(输出)、HDMI(输出)接口> 支持5层1080i高清视频及图文进行实时编辑及文件输出> 独有的手写动画效果制作、3D模型插件、2D图文转3D插件等图文编辑功能> 集成VisExporter和VisFileTransfer For EDIUS转码、传输专用模块,3维例子特效模块,VisMontage 图片制作模块> 完善的VISMAM视音频文件的转码、元数据管理、文件检索和下载视音频资料管理功能
长沙世诚电子科技有限公司 2021-08-23
5-醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用
本项目采用化学生物学手段,筛选出特异性成环标记5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——叠氮茚二酮和丙二腈,并且标记产物在随后的PCR扩增过程实现胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的转变,可实现全基因组5-醛基胞嘧啶的单碱基分辨率检测。用叠氮茚二酮标记作为标记化合物,可实现对含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再测序,将测序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作为标记化合物,可实现单细胞水平的5-醛基胞嘧啶单碱基分辨率检测。血液中细胞外游离DNA上的核酸修饰可以作为人类癌症的生物标记物,本项目涉及的核酸修饰检测技术,不会造成DNA降解,适应于临床小量珍贵样品,在癌症的液态活检上具有重大潜力。
北京大学 2021-02-01
5-醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用
本项目采用化学生物学手段,筛选出特异性成环标记5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——叠氮茚二酮和丙二腈,并且标记产物在随后的PCR扩增过程实现胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的转变,可实现全基因组5-醛基胞嘧啶的单碱基分辨率检测。用叠氮茚二酮标记作为标记化合物,可实现对含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再测序,将测序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作为标记化合物,可实现单细胞水平的5-醛基胞嘧啶单碱基分辨率检测。血液中细胞外游离DNA上的核酸修饰可以作为人类癌症的生物标记物,本项目涉及的核酸修饰检测技术,不会造成DNA降解,适应于临床小量珍贵样品,在癌症的液态活检上具有重大潜力。
北京大学 2021-01-12
非线性编辑系统--音频编辑工作站
产品详细介绍AEWS1000技术参数> Intel 酷睿 I7  四核 主频3.2GHz> 16G DDRIII SDRAM> 2G 显存专业显卡> SSD 2T 系统硬盘> SATA 2T素材硬盘> 蓝光刻录机> 24寸高分辨液晶显示器> Windows7/Windows8  64位操作系统> proTools编辑软件>舒尔专业录音话筒2个,舒尔监听耳机1个> 4U工控专用服务器机箱,专业监听音箱> USB键盘、光电鼠标> 系统光盘、全中文使用手册、系统保修卡  视音频输入/输出接口>4*4同步输入/输出通道> 4路麦克风输入(2路XL R麦克风/线路输入组合接口,)专业麦克风前置入大器、48V幻象电源和高通滤波> 2路1/4″前面板DI线路输入
长沙世诚电子科技有限公司 2021-08-23
新型基因编辑技术
该技术可利用人体自身存在的机制进行RNA的单碱基编辑,避免了任何由于表达外源效应蛋白而引起的潜在问题。 新型基因编辑技术(魏文胜团队)   LEAPER (Leveraging Endogenous ADAR for Programmable Editing on RNA)是一类具有我国自主知识产权的新型基因编辑技术,该技术可利用人体自身存在的机制进行RNA的单碱基编辑,避免了任何由于表达外源效应蛋白而引起的潜在问题。LEAPER技术具有高精度、易于递送、长时效、高安全性等多种优点,并在包括遗传性疾病治疗方面展现出了可观的优势及潜能,成功为生命科学基础研究和疾病治疗提供了一种全新的工具。    LEAPER技术原理   近年来,以CRISPR/Cas9为代表的基因组编辑技术在生物医学等诸多领域产生了深远的影响,但存在的一系列问题使该技术在临床治疗应用中遭遇瓶颈。根源之一在于当前的基因编辑体系依赖于外源编辑酶或效应蛋白的表达,从而造成 (1) 蛋白分子量过大使得通过病毒载体进行装载及人体内递送十分困难;(2) 由蛋白过表达引起的DNA/RNA水平的脱靶效应;(3) 由外源蛋白表达引起的机体免疫反应及损伤;(4) 机体内的预存抗体使外源编辑酶或效应蛋白被中和从而导致基因编辑失败等。   为解决上述问题,摆脱传统技术依赖于外源蛋白表达的桎梏,2019年魏文胜团队建立了具有我国自主知识产权的名为LEAPER的新型基因编辑技术。与RNAi类似,LEAPER充分利用了细胞中天然存在的机制:仅用一条RNA 就实现了精确高效的RNA单碱基编辑,从而避免了任何由于表达外源效应蛋白而引起的各种潜在问题。研究人员利用LEAPER成功修复了来源于Hurler综合征病人的缺陷细胞,为未来相关疾病的治疗奠定基础。此外,LEAPER还有希望衍生出多种延展型技术,为生物医学等研究提供新型工具。
北京大学 2022-08-12
非线性编辑系统--3D高清多格式编辑工作站
产品详细介绍EDWS 30003D 技术参数> Intel 酷睿 I7 四核 主频3.2GHz> 16G DDRIII SDRAM> 2G 显存专业显卡> SSD  120G 系统硬盘> SATA 2T素材硬盘> 蓝光刻录机 > 24寸高分辨液晶显示器> Windows7/ Windows8  64位操作系统> 最新版EDIUS编辑软件>5U工控EDIUS专用工作站机箱,木质音箱> EDIUS专用彩色快捷标识键盘、光电鼠标> 系统光盘、全中文使用手册、系统保修卡
长沙世诚电子科技有限公司 2021-08-23
评估基因编辑工具酶的新方法以及高保真的新基因编辑酶
CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins)是目前最常用的基因编辑工具酶,在科研领域被广泛应用,而在临床方面的应用因为其脱靶活性一度停滞不前。它通过guide RNA(gRNA)与靶向DNA序列的配对,从而将Cas9锚定在靶向基因并诱导产生DNA双链断裂(DSB)。在基因编辑诱发的DSB的修复过程中,一定几率会产生基因突变或者外源DNA片段的插入,从而达到基因编辑的目的。在实际应用过程中,一个好的基因编辑酶Cas9需要同时满足高效切割靶位点、低脱靶活性和低染色体异常三个特点。目前在这三个方面,有一部分基于PCR的方法用于估算基因编辑效率,但其结果可靠性有待提高;有一些基于高通量测序的方法可以在体内或者体外检测基因编辑酶的脱靶活性;尚无系统的可定量的测量基因组异常结构的方法。本项目开发了一种新的方法,可以用来同时定量检测Cas9编辑效率和脱靶活性以及编辑引起的染色体异常结构,即primer-extension-mediated sequencing(PEM-seq)。这是对基因编辑和DNA损伤修复等领域都有巨大促进作用的新技术。与此同时,该项目包括了该团队利用PEM-seq筛选出的一个相比于现有Cas9变体具有更低脱靶活性且与野生型Cas9切割效率相当的Cas9变体further enhanced Cas9 (FeCas9)。
北京大学 2021-02-01
时刻表编辑及在线系统
本成果可进行列车运行图编制,列车运行实绩图显示支持控制中心和车站两级。已在哈尔滨和苏州地铁应用。
西南交通大学 2016-06-27
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