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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性检测新方法,助力肿瘤精准检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学 2021-04-10
【新闻动态】重庆大学四项成果获2019高校科研优秀成果奖(科学技术)
重庆大学共有4项获奖项目。其中牵头3项,包含科技进步一等奖1项,自然科学二等奖1项,科技进步二等奖1项。同时我校作为参研单位获科技进步二等奖1项。
重庆大学 2019-12-25
中国高等教育学会关于召开康复学科建设与人才培养论坛的通知
为推动我国康复学科发展,提升康复人才培养水平,促进全国康复高等教育单位间的合作交流,经研究,中国高等教育学会决定举办康复学科建设与人才培养论坛。
中国高等教育学会 2023-09-22
关于《重庆市科研项目和经费管理办法(征求意见稿)》公开征求意见的通知
为贯彻落实《关于深化项目评审、人才评价、机构评估改革的意见》《国务院关于优化科研管理提升科研绩效若干措施的通知》等文件精神,规范和加强我市科研项目及经费管理,根据《关于改革完善市级财政科研经费管理若干措施的通知》(渝府办发〔2022〕95号)有关要求,我局修订了《重庆市科研项目管理办法》(渝科局发〔2019〕11号),形成《重庆市科研项目和经费管理办法(征求意见稿)》。
重庆市科学技术局 2023-02-24
厦门大学医学院眼科研究所团队发现睡眠不足会影响角膜上皮干细胞
睡眠不足的人基本都有眼部不适的体验,刘祖国教授、李炜教授团队近5年来关注睡眠不足引起的眼部病变,发现睡眠不足导致眼表和泪液系统功能障碍,产生干眼,并阐明了其中的分子机制,同时在睡眠相关性眼表病变的治疗方面进行了有益探索。
厦门大学 2022-06-15
关于发布后摩尔时代新器件基础研究重大研究计划2023年度项目指南的通告
本重大研究计划面向芯片自主发展的国家重大战略需求,以芯片的基础问题为核心,旨在发展后摩尔时代新器件和计算架构,突破芯片算力瓶颈,促进我国芯片研究水平的提升,支撑我国在芯片领域的科技创新。
国家自然科学基金委员会 2023-02-14
大型低温多效海水淡化装置国产化基础研究及热力系统计算软件研发
我国现在运行的压水堆核电厂发电效率约为 33%,核燃料放出热量的 2/3被作为废热排入海中,造成热污染;较先进的火力电厂的发电效率也仅 40%左右。而水作为人类最宝贵的不可替代的自然资源,水短缺问题正日益影响着全球的生态环境和社会、经济发展。海水淡化技术是解决水资源紧缺问题的一条有效 途径,世界各国也越来越重视这种新技术。低温多效蒸发海水淡化(LT-MED)技术预处理简单,工作温度低,传热效率高,系统操作弹性大,并可有效地利用锅炉等余热或其它低位热能,电厂实现水电联产,成为海水淡化的主流技术之一。 针对日产万吨级 LT-MED 设备国产化,开展了相关基础研究,对 LT-MED 蒸发器的水平管结构、材料及布置形式,在低温低压、管内外均发生相变条件下进行了传热和流动的试验研究,获得了水平管降膜蒸发的基础数据,并确定了管外海水喷淋参数和管内蒸汽参数对传热特性及管内流动阻力特性的影响,得到了传热准则关联式和阻力计算关联式;建立了低温多效海水淡化装置单效蒸发器的热力计算模型,运用实验关联式,考虑了海水喷淋密度、温度、盐度,以及管内蒸汽流量、压力对传热系数的影响,也考虑了水和海水的物性随温度或盐度的变化。研发的计算程序可获得蒸发器内部流动与传热各参数的分布,结果与黄骅电厂工程实际符合良好。还研发了 TVC-MED 热力计算,该程序可用于蒸发器和 MED 系统的结构设计和运行参数优化,具有重要的实用价值和学术价值。为我国自行设计、开发高效水平管降膜蒸发器奠定了理论和实验基础。 
西安交通大学 2021-04-11
千万吨级大采高综放工作面设备配套选型及标准制定基础的研究
在调研国内千万吨级综放工作面生产地质条件的基础上,分析实现千万吨级目标综放面所需的基本条件。测试工作面煤岩力学参数,掌握了工作面煤岩力学特性,为理论分析提供理论基础。从地质因素、设备配套因素、开采技术因素以及管理因素等方面分析各因素对千万吨级大采高综放工作面设备配套的影响,分析千万吨级大采高综放工作面目标实现的地质条件适应性、顶煤的冒放性和实现安全高效开采的主要途径。采用相似模拟试验,获得采场围岩运移及应力分布规律,建立煤壁稳定性分析的力学模型,分析煤壁的稳定性,获得工作面支架支护强度的基本要求。优化研究工作面参数及开采工艺,探索各参数对工作面生产能力的影响并提出在不同开采条件下工作面参数的确定方法和基本要求,探索生产系统中各工序参数对工作面生产能力的影响规律,分析生产系统技术改造对工作面生产能力的影响,找出生产工艺系统中的薄弱工序和最优放煤工艺,提出在不同条件下的工作面生产工艺参数优化配置,为大采高综放面设备选型提供依据。研究 “三机”配套的总体原则,单机配套时的选型原则和工作面设备的基本要求,为试验面设备的配套、选型提供依据。(1)提出了年产千万吨级综放面开采地质条件的基本要求,分析了千万吨级大采高综放面安全高效开采的影响因素。(2)在系统研究大采高综放采场围岩运移及应力分布规律、煤壁片帮机理、工作面参数、回采工艺的基础上,深入研究了工作面“三机”配套选型,提出了相应的配套原则和配套参数。(3)研制了 ZF15000-23/43 正四连杆大采高综放低位放顶煤液压支架、整体自移式ZTZ20000/25/50 型端头自移支架、ZTC30000/25/50 型超前支护支架以及 KSW-1500EU 型电牵引采煤机,并进行了现场工业试验,保障了千万吨级大采高综放工作面平均日产达 3 万t。(4)制定了“千万吨级大采高综放工作面设备配套选型技术要求”技术标准。
安徽理工大学 2021-04-13
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杭州爱贝护医疗科技有限公司 2021-12-13
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