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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性检测新方法,助力肿瘤精准检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学 2021-04-10
动态云服务请求下数据中心多能源的在线控制方法和系统
本发明公开了一种动态云服务请求下数据中心多能源的在线控 制系统,包括系统状态监控模块、负载调度模块和多源供能系统管理 模块,负载调度模块包括延时敏感型请求调度子模块和延时容忍型作 业调度子模块,系统状态监控模块用于每隔一段时间接收来自用户的 云服务请求,判断云服务请求是延时敏感型请求还是延时容忍型作业, 并在云服务请求是延时敏感型请求时将该云服务请求发送到负载调度 模块的延时敏感型请求调度子模块,在云服务请求是延时容忍型作业 时将该云服务请求发送到负载调度模块的延时容忍型作业调度子模 块。本发明能够优化数据中心供能系统的长期运营开销,并且不需要 提前获取任何系统数据或者假设任何的稳态分布。 完成人:金海、刘方明、邓维 
华中科技大学 2021-04-11
【中国教育在线】关于创新人才培养,听听这些学校怎么说!
千秋基业,人才为本。党的二十大将教育、科技、人才“三位一体”统筹部署,明确了教育、科技、人才是国家的基础性、战略性支撑。人才是第一资源,创新是驱动力,创新人才培养是科技创新和国家发展的最关键因素。
云上高博会 2023-04-19
一种可同时在线活化和喷射脱汞吸附剂的方法
本发明公开了一种可同时在线活化和喷射脱汞吸附剂的方法, 其通过可同时在线活化和喷射脱汞吸附剂的装置对汞吸附剂进行在线 活化和喷射,其中,该装置包括用于喷射汞吸附剂的喷射机构、设置 在所述喷射机构侧面并与之相通的在线活化机构以及用于监测烟气中 汞浓度的汞浓度在线监测仪(11);根据监测得到的汞浓度,动态调节所 述调节风门(4);同时动态调节所述在线活化机构上的调节阀门(9);从 而对吸附剂进行在线活化,进而实现烟气脱汞。本发明的方法实现了 汞吸附剂的实时在线活化,适应汞浓度的频繁波动,并较大程度的提 高了汞吸附剂和活性组分利用效率,降低了吸附剂的用量,大大节约 了脱汞成本。
华中科技大学 2021-04-13
一种用于旋转机械在线振动监测的趋势曲线图显示方法
本发明公开了一种用于旋转机械在线振动监测的趋势曲线图显示方法,包括以下步骤:1)选择数据时间段及振动指标;2)读取数据库中的基础监测数据;3)选定绘图策略:将基础监测数据按点集密度绘图或按统计策略绘图;4)分坐标系绘制趋势曲线图。本发明通过选择数据时间段及振动指标,获取基础监测数据,选定绘图策略,并按照绘图策略处理数据,将处理所得分区域绘制趋势曲线图。本发明在趋势曲线图生成过程中,增加了数据处理,包括数据筛选和运算,使趋势曲线图更加直观、明确;再显示过程中分区域显示,便于进行数据对比。
华中科技大学 2021-04-13
两万多拟南芥公共RNA-seq文库的生物大数据在线分析平台
发布的数据库(Arabidopsis RNA-seq database, ARS)整合了来自GEO、SRA、ENA和DDBJ数据库的20,068个拟南芥RNA-seq数据,提供了“Google-style”在线查询工具。该研究对所有文库进行了基因表达水平定量和共表达网络分析,并将所有文库进行分类,总共涉及1176个突变体、1102种处理条件、12个
南方科技大学 2021-04-14
一种污水处理系统信息安全在线风险分析方法及系统
本发明公开了一种污水处理系统信息安全在线风险分析方法及系统。本发明先建立系统模型,包括资产损失分析模型、人员损失分析模型、环境损失分析模型、效益损失分析模型、安全事件模型、功能支撑模型以及贝叶斯攻击图;然后各网络节点作为从节点,监测其功能运行情况,并将监测结果发送给作为主节点的工程师工作站;最后主节点根据监测结果,利用建立的系统模型,分析系统损失。系统包括设置在工程师工作站上的主节点,设置在各网络节点上的从节点,
华中科技大学 2021-04-14
一种支持异质智能无线传感器在线开放规划的方法及系统
本发明公开了一种支持异质智能无线传感器在线开放规划的方法及系统,包括通过互联网在线注册 智能无线传感器元数据到 SOS 服务、构建并在线安装智能无线传感器规划插件、在线注册智能无线传 感器元数据到 SPS 服务、在线获取智能无线传感器任务规划参数描述、设置智能无线传感器任务规划参 数并在线验证智能无线传感器任务规划参数有效性、在线提交智能无线传感器任务规划请求、基于时空 位置在线获取智能无线传感器观测数据七步骤;本发明实现了异质智能无线传感器在
武汉大学 2021-04-14
一种基于软测量技术的汽轮机热耗率在线监测方法
本发明涉及一种基于软测量技术的汽轮机热耗率在线监测的方法。该方法通过建立的汽轮机回热系统的专家性能知识库和性能预测模型,校验汽轮机回热系统运行现场测点传感器采集的数据,预测汽轮机运行现场未采集的参数数据,以利用汽轮机输出功率计算主蒸汽流量,完成汽轮机回热系统热耗率的在线监测,从而获得准确、可靠的发电机组热耗率在线监测结果。本发明方法避免了传统的凝结水流量测量,采用汽轮机输出功率软测量的方法,获得热耗率的在线监测,
华中科技大学 2021-04-14
多维度资源性能干扰感知的虚拟机在线迁移方法及系统
本发明公开了一种虚拟机在线迁移方法,属于计算机虚拟化技 术领域。该方法具体为:中心控制服务器监控各物理服务器的资源消 耗状态,以优化资源消耗状态为目标确定迁移源物理服务器;在迁移 源物理服务器上选取候选待迁移虚拟机,按照一一对应方式构成候选 迁移方案;综合虚拟机迁移过程造成的迁移性能干扰以及迁移之后对 目的物理服务器造成的同机性能干扰评价候选迁移方案造成的整体性 能干扰;从各候选迁移方案中选取整体性能干扰最小者作为最
华中科技大学 2021-04-14
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