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SARS-CoV-2基因组分析进化和起源的研究
2020年3月8日，安徽师范大学在bioRxiv上上传了一篇题为Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10个新测序的SARS-CoV-2基因组，并结合GISAID数据库中的136个基因组，通过不同的分析方法（如EBSP、错配和中性检测等）研究前三个月数据的遗传变异和统计。 结果显示80个单倍型共有183个突变位点，包括27个简约性信息位点和156个单一位点。对遗传多样性的滑动窗口分析表明，SARS-CoV-2基因组丰度的变化有一定范围，这可以解释目前这种病毒的广泛和高适应性。遗传学分析不支持穿山甲是中间宿主。在最初的单倍型（H14）中，一个患者样本居住在华南海鲜市场附近（约2公里），这表明患者有无意识接触该市场史的可能性很高。然而，基于这个线索，也无法准确断定这个市场是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，从这个市场收集的16个基因组，包含10个单倍型，表明市场在短期内出现循环感染，这可能导致武汉和其他地区爆发SARS-CoV-2。EBSP结果显示，第一个估计的扩展日期从2019年12月7日开始，这表明SARS-CoV-2的传染可能在11月中下旬开始。
安徽师范大学
2021-04-10
一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18及其应用
本发明公开了一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含与SEQ?ID?NO.1序列互补的核苷酸序列,该基因编码CCCH型锌指蛋白18,可作为小麦穗发芽抗感品种的分子标记基因.该小麦抗穗发芽基因TaZFP18为一种新的小麦抗穗发芽主效基因,利用其开发分子标记,可以迅速鉴定小麦是否为穗发芽抗性品种,也为小麦穗发芽抗性育种提供了新的基因资源.
安徽农业大学
2021-04-29
预测重型肝炎病情基因的甲基化检测方法及试剂
本发明涉及预测重型肝炎病情基因的甲基化状态检测的方法及试剂，提取病人外周血单个核细胞 DNA 进行亚硫酸氢盐修饰后，分别用谷胱甘 肽 S-转移酶 M3 甲基化（M）特异性和非甲基化（U）特异性引物对进行甲基化 特异性聚合酶链式反应，根据扩增产物判断其甲基化状态，有助于临床医生判 定重型肝炎患者的病情和指导治疗。
山东大学
2021-04-13
创制转基因技术中带有安全筛选标记的安全转化载体
选择标记转基因作物已成为近年来植物基因工程技术研究的重 点之一，随着转基因作物产品的商品化，转基因植物的生物安全性受 到公众越来越多的关注，尤其是目前抗生素标记基因在植物遗传转化 过程中的广泛应用，使人们对这些标记基因可能带来的潜在危害性心 存疑虑，抗性标记基因的存在严重地阻碍了转基因植物的商品化进程 和转化技术本身的有效性。 本项目培育的无抗生素标记基因（可视化标记基因）在建立高效、 安全、规模化的转基因作物技术体系方面取得突破，以紫色幼芽作为 沙 门 屎 肠 副溶血弧 霍 乱 小 肠 结 肠 亲水气单 粪 肠 金 黄 色 肺炎克雷 钩端螺 嗜 肺 军 志 贺 绿 脓可视筛选标记代替抗生素筛选标记，构建了新型转化载体并应用于作 物，已申请 2 项发明专利。
南开大学
2021-04-13
基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究
近日，东南大学生命科学与技术学院“发育与疾病相关基因”教育部重点实验室林承棋和罗卓娟课题组在国际顶级期刊《Science Advances》杂志发表了题为ENL initiates multivalent phase separation of the Super Elongation Complex (SEC) in controlling rapid transcriptional activation的文章，阐明了有关基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究工作成果。东南大学研究团队的研究揭示了SEC介导的多价相分离在RNA聚合酶II转录暂停释放中起着关键作用，并从全新的角度为基因快速协调性转录激活程序的机制探索提供了新的认识。
东南大学
2021-04-11
口蹄疫与伪狂犬病二价基因工程疫苗
研发阶段/n口蹄疫（FMD）是引起的人及偶蹄动物共患的一种烈急性、高度接触性、发热性传染病。FMD在世界上许多国家流行，造成重大的经济损失和政治影响。口蹄疫病毒（FMDV）属于小RNA病毒科（Picornaviridae），口蹄疫病毒属（Aphthovirus），该病毒为单股正链小RNA病毒，基因组长约8500个核苷酸，主要由结构基因（P1区）和非结构基因（P2、P3区）等构成。该发明具体涉及一种新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重组伪狂犬病弱毒疫苗株，该毒株属于猪伪狂犬病毒：Pseudorabi
华中农业大学
2021-01-12
HPSE基因做为猪免疫性状相关的分子标记及其应用
研发阶段/n这是免疫性状相关基因专利，通过本专利的应用，在猪育种中可以提高猪的免疫力和抗病力，节约医药成本，提高经济效益。
华中农业大学
2021-01-12
一种端粒酶启动基因表达方法及其应用
本发明公开了一种端粒酶启动基因表达方法(Telomerase?Activating gene Expression，Tage)及其应用，该表达方法基于端粒酶可结合并延长DNA分子末端的端粒酶识别序列，合成新的端粒重复序列的特性，将端粒酶特有的生物学功能与人工转录因子调控细胞基因表达技术相结合，发展了Tage新方法。Tage技术在细胞中可以有效发生，人工转录因子可激活效应基因在端粒酶阳性细胞中的表达，效应基因的表达产物可有效杀灭肿瘤细胞，本发明证明Tage技术可用于杀灭肿瘤细胞，而对无端粒酶活性的细胞
东南大学
2021-01-12
开发了一个在线的个人基因组解码平台
一直以来，自从第二代高通量测序技术开发至今，基因组测序成本已经降低到3000美元，我们马上就要来到1000 dollar genome 的时代。然而从复杂冗余的基因序列中解读出与疾病相关，与药物相关的重要信息，已经成为当前生物信息学已经成为生物信息学中最重要的挑战。面对该挑战，程容海等人开发了一个在线的个人基因组解码平台（Virtual Pharmacist）。它可以支持分析目前主流的生物信息学数据格式，并且通过该软件后台的数据库和算法，挖掘出个人基因组中的基因突变（Single Nucleotide Polymorphism）与药物反应的关联性分析。该平台只需要用户上传SNP数据文件，或者是高通量测序文件便可以自动完成包括生物信息学分析，基因组信息解读（genomic interpretation），并最终呈现给用户一份详细的，用户友好的，关于195种药物反应的基因检测报告。
南方科技大学
2021-04-13
基于CRISPR/Cas9基因编辑系统的载体组合及其应用
01.成果简介 CRISPR/Cas9是细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御系统。其工作原理是crRNA通过碱基配对与tracrRNA结合形成tracrRNA/crRNA复合物，此复合物引导核酸酶cas9蛋白在与crRNA配对的序列靶位点剪切双链DNA。经过研究，通过人工设计tracrRNA/crRNA，改造形成具有引导作用的sgRNA，可以引导Cas9蛋白在多种细胞的特定基因组位点上进行切割、修饰，并最终实现基因突变、插入或缺失。因此，CRISPR/Cas9系统已经被广泛应用于基因编辑技术领域。 近年来，CRISPR/Cas9基因编辑系统在真核生物和原核生物中得到了广泛的应用。在大肠杆菌等革兰氏阴性菌中，用一个载体表达cas9基因，同时由于革兰氏阴性菌重组效率低，需要在这个载体上表达λ-RED重组酶；在另一个载体中表达sgRNA和用于同源重组的同源臂序列。两个载体都转入大肠杆菌中时，sgRNA介导Cas9蛋白切割基因组上特定序列，形成双链断裂，刺激同源重组的发生，从而实现基因编辑。 本项成果构建了适用于盐单胞菌的基于CRISPR/Cas9的基因编辑系统。该系统由两个载体组成：第一个载体表达Cas9基因，且不需要表达λ-RED重组酶，实际操作中不再需要诱导λ-RED重组酶的表达，简化了步骤流程；第二个载体表达sgRNA，并含有用于同源重组的同源臂序列。从而实现了基因编辑。本项成果的技术优势包括： （1）基因编辑时间由原有的20余天缩短到7-8天； （2）N个基因编辑时间由原有的N个月缩短到3+5N天； （3）无需表达λ-RED重组酶。 图1 盐单胞菌TD01进行基因编辑的流程示意图02.应用前景 本项成果可作为CRISPR/Cas9基因编辑系统的载体，广泛应用于基因编辑领域。03.知识产权 本项成果已申请1项发明专利。04.团队介绍 本项目为多团队合作项目，其中一个团队的负责人为清华大学教授，博士生导师，长江学者特聘教授，国家杰出青年基金获得者。主要研究方向为合成生物学、微生物代谢工程、生物材料、工业生物技术。已发表国内外高水平学术论文数十篇，申请专利70余项。05.合作方式 投融资。06.联系方式邮箱：zhangxinrui@tsinghua.edu.cn
清华大学
2021-04-13