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一种新的
探针
制备方法
01. 成果简介 荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)是一种以荧光标记取代同位素标记而形成的新的原位杂交方法。其通过杂交探针序列及其荧光,能提供标记位点在细胞核内的空间位置信息,与基于染色质构象捕获(Chromatin Conformation Capture,3C)等各种生物技术(如4C,5C,HiC,ChIA-PET等)互补,成为研究染色质结构不可或缺的重要技术之一。 传统的荧光原位杂交技术一般以含有目标物种来源的一段完整基因组片段作为模板,通过生物酶的作用进行片段化,之后进行荧光标记做出杂交探针,再固定细胞中,通过碱基互补配对原理对特定的基因组片段进行荧光标记并成像,获得具体的核内空间信息。但是,传统的原位杂交技术受限于模板本身的特性,具有准备时间长、所需模板量大、基因分辨率低、克隆中含有重复片段、需要加入物种特异的Cot-1DNA等缺点。尤其是其分辨率低的特点(分辨率在百kb的数量级),让它在应用中受到了很大的限制。 本项成果提供了一种新的针对目标核酸靶标探针的制备方法(见图1),该方法比传统的FISH技术的分辨率提高了1-2个数量级(见图2),可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的地方。该成果的具体步骤(见图1)包括:(1)获取感兴趣的靶DNA序列;(2)使用转座酶将靶DNA序列进行片段化的同时,在片段化的DNA序列两端加上接头序列;和(3)利用所述接头序列,获取所述片段化的DNA序列,以产生探针。本项成果的技术优势在于:快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA。 图1 探针制备方法的具体步骤。 02.应用前景 本项成果是一种快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA的荧光原位杂交方法,可作为现有的传统荧光原位杂交技术的可选替代方案。尤其是该方法的分辨率高,比传统的FISH技术的分辨率高1-2个数量级(见图2),因此可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的很多地方。 例如,在基因组的三维结构中,TAD(拓扑结构域)是结构和功能的基本单元。TAD内部和TAD之间的增强子和启动子发生的错误的相互作用,是一些癌症发生的根本原因。而传统的FISH技术因为分辨率的限制,探测不到这些错误的相互作用。因此本项成果在临床有着广泛的应用,可以用于癌症及一些其它疾病的极早期检测。 图2 相比于传统的BAC FISH(图上方绿条,长度为152kb),仅用1.170 kb(红条)长的TN5探针,就可以得到要标记的基因组位点的图像。 图中细胞核(蓝色)中,红色和绿色的点相互重叠,说明Tn5 FISH可以用传统的BAC FISH进行验证。黄色箭头表示用Tn5 FISH(红色通道,左上角插入图)或BAC- FISH(绿色通道,左下角插入图)进行成像。图中比例尺为5μm。03. 知识产权 本项成果已申请1项国内发明专利,目前正在申请国际专利。04. 团队介绍 本项目团队负责人为清华大学教授、博士生导师,国家首批千人。团队的主要研究方向涉及:生物信息学和基因组三维结构新方法的开发,利用细胞超分辨率成像、分子成像和生物信息学的方法进行基因组三维结构和系统生物学的研究选。团队负责人曾多次主持或参与美国NIH的R01科研项目、中国国家自然科学基金及科技部的科研项目,已发表高水平学术论文200余篇。05. 合作方式 专利许可、合作开发。06. 联系方式 邮箱:zhangxinrui@tsinghua.edu.cn
清华大学
2021-04-13
高频复合超声扫描
探针
显微镜
本项目在国家重大科学仪器专项项目支持下,经过4年产学研用相结合技术攻关,成功研制了能表征样品形貌与内部纳米级结构的新型扫描探针显微镜,并实现了产业化。 研制了高稳定度激光器、高灵敏度光学检测器、高Q值扫描探针等核心关键部件,突破了基于ARM+DSP的自适应随机共振微弱信号检测方法、基于脉冲发送皮层模型多频超声图像融合方法以及基于非下采样剪切波变换的局部方差融合方法等核心关键技术,建立了RBG 彩色图像融合模型,成功研制了能表征样品形貌与内部纳米级结构的新型扫描探针显微镜。同时,通过在航天、医学、生物材料、电子器件等领域的实际使用,进一步改进与完善,提高了仪器的可靠性、有效性和实用性。 图1 成果展示 【技术优势】 在内部超声图像分辨率、最大可检测样品厚度等指标方面达到了国际领先水平。 【技术指标】 与国内外同类仪器比较,总体技术指标到达了国际先进水平,部分指标达到了国际领先水平。经过具有国家仪器检测资质的第三方测试结果,各项技术指标见下表: 【资质荣誉】 2021年湖北省科技进步二等奖。
华中科技大学
2023-07-19
智能混凝土流变仪-冠
力
科技--GL-LBY L
概述 GL-LBY/L型流变仪提供了一种科学的测试混凝土和易性的方法,是一种全新多功能和轻便的混凝土流变仪,用于检测骨料粒径在32mm以下的混凝土流变性。可应用于科研、混凝土材料配比确定、生产质量控制等领域。软件自动控制采集数据,自动计算Bingham流变参数—屈服应力和塑性粘度,绘制曲线,储存试验结果及导出试验数据。 性能特点 可移动,适用于实验室内环境 结实耐用,低成本,多功能 实验快速,准确 操作简单,自动化 更好地确定材料和易性 提高混凝土质量和性能 提高工人生产效率 加速高效新材料的推广使用
杭州冠力智能科技有限公司
2024-11-06
力
加寿片
【成份】 刺五加浸膏、黄芪、淫羊藿、灵芝、白芍、人参总皂甙、维生素E。辅料为蔗糖、淀粉、羟丙基纤维素、硬脂酸镁。薄膜衣:欧巴代。 【性状】 本品为薄膜衣片,除去包衣后显黑褐色:味微苦、涩。 【适应症】 补脾益肾,滋阴养血,益智安神。适用于因年老体衰出现的疲乏、心悸、失眠、健忘、尿频,并可用于慢性病恢复期增强体质。 【规格】 每片重0.34克
广州白云山光华制药股份有限公司
2021-10-29
力
与机械(二)
宁波浪力仪器有限公司(余姚市朗海科教仪器厂)
2021-08-23
力
与机械(一)
宁波浪力仪器有限公司(余姚市朗海科教仪器厂)
2021-08-23
力
传感器
规格:6个操作键,内置锂电,具有LCD显示、数据储存功能,能脱离计算机进行采集、显示、记录数据。与计算机的连接支持两种方式:(1)通过数据采集线直接与计算机USB相连;(2)通过蓝牙与计算机相连 测量范围1:-50~+50N, 分辨率: 0.01N 测量范围2:-5~+5N, 分辨率: 0.005N
南京师范大学课程资源研究所
2021-08-23
聚
力
新师
教师培训解决方案
北京和气聚力教育科技有限公司
2021-02-01
注意
力
训练
改善注意,提高记忆 提高注意力,同时能做到记忆力、创造力全面提高 专心听讲,成绩提高 上课专心听讲,班级名次逐渐提高 自主学习,效率提高 不用爸妈操心,自己做作业,而且速度比以前快很多 建立自信,心态阳光 通过奖励机制,逐渐培养孩子自信,面对问题更勇敢 遵守秩序,常受表扬 朋友越来越多,上课秩序好,常常被老师表扬 细心耐心,习惯培养 形成认真学习的好习惯,做作业检查,会做的一定做对
北京金博智慧健康科技有限公司
2021-02-01
记忆
力
训练
记忆力是识记、保持、再认识和重现客观事物所反映的内容和经验的能力,分为瞬时记忆、短时记忆和长时记忆,很多家长发现,自己的孩子有记忆力不好的现象。
北京金博智慧健康科技有限公司
2021-02-01
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