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细菌DNA硫化修饰研究新进展
上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室吴更教授与武汉大学王连荣、陈实教授团队合作,揭示了细菌DNA硫化修饰中催化第一步反应的半胱氨酸脱硫酶发生构象变化,使其活性位点半胱氨酸朝向底物半胱氨酸移动5.5埃以发起攻击的催化机制。最新研究成果以“Structural Analysis of an L-Cysteine Desulfurase from an Ssp DNA Phosphorothioation System”为题发表在《mBio》杂志上。刘立琼等为第一作者,吴更、王连荣为通讯作者,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室为第一单位。本文是团队自2018年Nature Communications上发表的细菌采用SBD结构域识别硫化修饰DNA的结构机理及2020年Nature Microbiology上发表的II型DNA硫化修饰系统的SspB、SspE晶体结构的延续和扩展。在细菌的DNA硫化修饰(不管是早先发现的Dnd修饰系统还是新近发现的Ssp修饰系统)途径中,都由一个半胱氨酸脱硫酶催化第一步的反应,即半胱氨酸脱硫酶的活性位点半胱氨酸对底物半胱氨酸上的硫原子发起亲核攻击反应,将活化的硫原子转移到半胱氨酸脱硫酶的活性位点半胱氨酸上,以进行后续的将硫原子加进DNA的反应。2020年4月初团队在Nature Microbiology上发表的文章“SspABCD-SspE is a phosphorothioation-sensing bacterial defense system with broad antiphage activities”,从探索海洋弧菌的高频单链磷硫酰化修饰入手,通过比较基因组学和分子遗传学手段,鉴定出以SspABCD为修饰元、SspE为限制元的单链磷硫酰化限制-修饰系统。该系统与之前发现的磷硫酰化(以DndABCDE为修饰元以产生双链DNA磷硫酰化、DndFGH为限制元)的Dnd系统均迥然不同,并首次阐明了细菌磷硫酰化限制-修饰系统赋予宿主抑制噬菌体入侵的能力。同时,通过结构生物学和生物化学手段,解析了SspB蛋白的晶体结构,揭示其两个保守motif的关键残基对其DNA缺刻酶活性非常重要;解析了SspE蛋白的晶体结构,发现其N端结构域有依赖于DNA磷硫酰化修饰的NTP水解酶活性,而其C端结构域有DNA缺刻酶活性,从而阐明了该系统DNA磷硫酰化修饰与限制两部分功能耦合的分子机理。研究还发现SspABCD作为修饰蛋白在宿主基因组DNA上产生磷硫酰化修饰,SspE作为限制元能够感应基因组DNA上的磷硫酰化修饰从而区别宿主自身与外源的遗传物质,并利用其核酸酶活性对入侵噬菌体的DNA进行大范围的缺刻,从而抑制噬菌体DNA的复制。本研究解析了新发现的II型DNA硫化修饰系统中的半胱氨酸脱硫酶SspA(来源于弧菌)与底物半胱氨酸的复合物晶体结构,分辨率为1.8埃。结构揭示SspA通过其天冬酰胺N150和精氨酸R340残基来识别底物半胱氨酸,如果将这两个残基突变则会严重破坏细菌的DNA硫化修饰。在结构中,SspA的活性位点半胱氨酸C314与底物半胱氨酸的距离长达8.9埃,这就产生了一个有趣的问题——SspA是怎么催化脱硫反应的?通过计算机分子动力学模拟,作者发现SspA的活性位点半胱氨酸C314在催化过程中向底物半胱氨酸移动了5.5埃,从而把它们之间的距离缩短到便于发生反应的范围内。本研究通过简正模式分析,发现弧菌的SspA、大肠杆菌的IscS、链霉菌的DndA(这两个都是I型DNA硫化修饰系统的)的活性位点半胱氨酸虽然处在不同的相对位置和不同的二级结构上,但都有着向各自的底物半胱氨酸的运动。本研究进一步通过在上海光源BL19U2生物小角X射线散射(简称SAXS)线站收集的数据,从头搭建了SspA在溶液中结构的分子模型。发现SspA在溶液中的结构与分子动力学模拟后SspA的结构更为接近,它们之间的SAXS数据的χ2偏差只有1.04埃,远低于从SspA的晶体结构推算出的SAXS数据之间的χ2偏差3.70埃。这从实验上证实了前述的计算机分子动力学模拟和简正模式分析的结果。弧菌SspA的活性位点半胱氨酸在催化过程中,活性位点半胱氨酸朝向底物半胱氨酸移动了5.5埃的距离(A)分子动力学模拟  (B)简正模式分析  (C)小角X射线散射实验数据与晶体结构经过分子动力学模拟后的结果和晶体结构的比较  本研究通过X射线晶体结构解析、分子动力学模拟、小角X射线散射等多种研究手段的结合,揭示了细菌DNA硫化修饰这一神奇现象中催化关键的第一步半胱氨酸底物脱硫反应的酶的催化机理,解答了半胱氨酸脱硫酶家族是如何克服活性位点半胱氨酸与底物半胱氨酸之间很长的距离这一长期悬而未决的问题,使人们对于细菌DNA硫化修饰的认识和理解又前进了一步。该研究获国家自然科学基金(31872627、31670106)的支持。​​​​
上海交通大学 2021-04-11
一种痕量铂修饰硫化钼高效析氢催化剂及其制备方法
本发明公开了一种痕量铂修饰硫化钼高效析氢催化剂及其制备方法,该催化剂由二水合钼酸钠、硫脲、碳布和铂丝/铂片,经水热反应和电沉积工艺制成。具体制备方法如下:将摩尔比为 1:3.5~1:4 的二水合钼酸钠与硫脲搅拌溶解于去离子水中,将溶液转移到反应釜中,加入碳布进行水热反应,然后自然冷却至室温,取出碳布,超声清洗、干燥,将获得的产物直接作为工作电极,铂丝或铂片同时作为对电极·827·和铂源,用 0.5M-H
华中科技大学 2021-04-14
二硫化钼层化硫化镉−硫化铜核−壳纳米棒用于高效光催化制氢
化学化工学院娄永兵教授课题组在国际顶级期刊《ACS Nano》上发表题为“MoS2-Stratified CdS-Cu2‒xS Core−Shell Nanorods for Highly Efficient Photocatalytic Hydrogen Production”(二硫化钼层化硫化镉−硫
东南大学 2021-01-12
硫化促进剂 TMTD
化学名称:二硫化四甲基秋兰姆 分子式:C6H12N2S4 产品指标:执行标准(HG/T2334-2007) 指标名称 指 标 一等品 合格品 外观(目测) 白色、淡灰色粉沫或粒状 初溶点,℃≥ 142.0 140.0 加热减量, % ≤ 0.30 0.30 灰分, % ≤ 0.30 0.30 筛余物(149um), % ≤ 0.0 0.1 (注:筛余物只适用于粉末) 性状:白色或淡灰色粉末或粒状,无臭,密度1.40-1.45,不溶于水,微溶于稀碱、汽油,溶于苯、丙酮、氯仿二硫化碳等。 用途:橡胶工业中用作硫化促进剂,农业上用杀菌剂和杀虫剂。 包装:塑编袋或纸塑复合袋,25公斤/袋。
山东斯递尔化工科技有限公司 2021-09-13
橡胶无转子硫化仪
产品详细介绍   橡胶无转子硫化仪的详细资料: 一. 橡胶无转子硫化仪主要技术指标 A.高精度传感器:0~20N.m。解析度:0.001N.m。 B.控制系统:采用计算机控制和接口板进行数据的采集、保存、处理和打印试验结果及曲线处理。 C.旋转系统:采用步进Electronics调速电机+振幅调整器。 摆动角度:±0.5o ±1o。 D.控温系统:采用Inteligent数字式温控仪表,实时Automatism调整PID控制参数。温度控制范围 0--200℃ 、 测温控制精度≤±0.3℃ 、温度分辩率 0.1℃。 E. 数据传输方式:RS232传输 F.显示方式:Vulcanize-105+WIN-XP测试软件计算机屏幕显示,加上优良的用户软件和先进的硬件设备使得整个测量变得非常方便、快捷、精确和愉快。 G.模腔:Cr6wv材质,符合GB/T16584-1996标准要求。 F.测控方式:人性化的测控方式,鼠标即点即用或主机面板轻触按键两种试验方式 二. 橡胶无转子硫化仪软件功能介绍 A.测试标准化:符合GB/T16584《橡胶-用无转子硫化仪测定特性硫化》、ISO6502:1991及ASTMD5289-95。 B.试品资料:设定的胶料编号名,如“外胎5号”,“RBS6“等等。用户如需另加标题名称说明打印的图纸时,可设定任何形式的标题文字说明。 C.高品质功能的特别说明:人性化设计的优良功能是在测试过程中可以修改测量时间,胶料估计20分钟硫化完成,设20分钟测量时间,实做11分钟时发现9分,10分处就已经硫化完成,这时已没必要再往下做,只需“修改测量时间”下的20分为9分或10分,按“送出”,实验立即停止在9或10分上,画出完整硫化曲线,计算出所有数据。如果实验做到18分,19分钟要结束时硫化曲线仍在往上升,硫化还未完成,实验必须再往下做,否则得出的数据是错误的。这时可修改测量时间为25分或更多,让实验继续,直到硫化完成为止。这一功能无疑大大方便了用户,节约了宝贵时间和胶料。 D.图形曲线尺度自动最佳化Auto Scale,测量完成后,软件将根据测量数值大小按0—5 Mv0—10Mv 0-20Mv自动调整Y标度,使曲线更美 观,多曲线对比,完全不同的胶料,不同的曲线形状,不同的测量时间,亦可进行对比。 E.数据库:软件预先设定了100个编号的数据库。每一个库可以存入无限组测量数据。面对几个月、几年、几十年成千上万组数据日后查询方便,用户可以将不同时间段的数据放入不同的数据库中,设定数据库地址的目的就在于此。 F.测试结束自动存档,测试完毕自动求算t10、t30、t50、t70、t90、ts1、ts2、Vc1、Vc2、最大扭矩、最小扭矩等等。 三. 橡胶无转子硫化仪附件 A.一年保固书及中文操作说明书各一份。 B. 橡胶无转子硫化仪专用测试软件一份。 C. 品牌电脑一套、彩色打印机一台。 四. 橡胶无转子硫化仪主要计数指标 A.测温范围:0℃-200℃ B.测温精度:≤ ±0.3℃ C.控温精度:≤ ±0.3℃ D.温度分辨率:0.1℃ E.力矩量程:0-10N.m 0-20N.m F.力矩解析度:0.001N.m G.模腔频率:1.7Hz H.振幅:±0.5o ±1o I. 环境温度:0-35℃ 相对湿度<80% J.硫化时间设定范围:2-300min K.配气0.5MPa L.电源 交流220V 800W M.机台尺寸:约660×580×1300mm N.机台重量:约210Kg
江都市韧恒机械厂 2021-08-23
炉前碳硫化验仪器
产品详细介绍主要特点:气体容量法差压式定碳、碘量法定硫;单片机控制电路,工作过程全自动操作、彻底消除人为误差、性能稳定可靠;进口精密传感器检测数据,测量准确,自动打印测量结果。启动一次完成碳硫全部测定。操作简单、维修方便。
南京金牛高速分析仪器有限公司 2021-08-23
鄂式平板硫化机
鄂式硫化机分胎面硫化机和挡边带硫化机两种,其中,胎面硫化机配多层自动推拉模,专用于胎面胶硫化生产,产品全部采用自动控制,获得国家专利。
青岛祥杰橡胶机械制造有限公司 2021-09-13
硫化黑2BR
山东昌邑灶户盐化有限公司 2021-08-23
全自动实心胎硫化机
项目背景:目前国内市场上生产的实心胎硫化机均采用 手动取胎结构,自动的设备现刚刚处于开发初级阶段。目前 实心胎硫化机生产过程需要大量劳动力,其工作环境恶劣, 手动操作效率低下,劳动强度大,产品质量差,招工困难。 所需技术需求简要描述:1.实心胎取放时轮胎机械手与 模具中心定位问题,机械手与模具中心定位差不应超过 3mm。 2.实心胎胎坯形状不规则,抓取定位问题。实心胎内径范围 300-600mm,且在成型时内径不光滑,重量在 50-260KG,机 械手许抓取牢靠与足够大的支撑范围。3.熟胎抓取机械手需 要抓取实心胎外径,外径范围 600-1000mm,轮胎重量在 50-260KG。4.硫化好的胎型芯回拉时有 10000KG 会拉力,需 要熟胎抓取机械手承受力量。轮胎顶出需要有 15000KG 顶出 力。5.硫化好的轮胎摆放问题,多条轮胎摆放要稳定。6.一 台辅机多台实心胎硫化机共用,辅机与硫化机定位问题。辅 机与主机对齐误差不应超过 1mm,否则模具推拉会错位,造 成模具不出拉出硫化机。7.模具规格在 600-1150mm 范围内, 模具拉出至辅机时需要模具中心与辅机顶出机构同心,误差 不能超过 1mm,否则轮胎无法顺利顶出。8.模具推拉装置与 模具结合定位,误差不能超过 1mm,否则无法顺利挂住模具 进行下一步动作。 对技术提供方的要求:拟与高校联合开发,要求团队具有类似经验,具备液压与控制技术相结合的实施案例。 
青岛祥杰橡胶机械制造有限公司 2021-09-13
出口 越南 实心胎硫化机
实心胎硫化机:开发出齐全系列产品,包括半自动、全自动控制共计4个系列。为轮胎(ATG)公司一次装备24台,越南公司一次装备26台,台湾捷泰公司一次装备32台。 实心胎硫化机特点:采用PLC控制,触摸屏设定,自动化程度高,操作方便,安全可靠。分段排气,可任意设定排气次数、时间、压力等;每层配有进出模轨道,辅机可上升下降,校具可手动进出,上模与轮胎制品可液压顶出,劳动强度低。
青岛祥杰橡胶机械制造有限公司 2021-09-13
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