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一种与肝癌相关的非
编码
RNA生物标志物及其
应用
肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球第五大常见的消化道恶性肿瘤,也是全球第三大致死性癌症。我国肝癌病发率位居全球首位,肝癌已成为严重威胁我国人民健康和生命的疾病。由于肝癌的早期诊断缺乏可靠的生物标志物,肝癌患者通常在肝癌晚期才被诊断,其5年生存率仅为15%。目前肝癌诊断主要依赖于影像学检查或者血液活检中的甲胎蛋白(AFP)标志物等手段。但这些传统方法对于癌变早期存在敏感性低、特异性低等局限性,例如,血液活检中的甲胎蛋白特异性差,且往往到癌症晚期才能检测到其含量升高,可能延误最佳的治疗时机。因此亟需找到一种可用于肝癌诊断及预后的可靠的新型液体活检标志物。 液体活检为一门新型的检测技术,越来越受到关注。目前可以作为无创检测的生物标志物大多数是蛋白质分子和DNA分子,但这些标志物在灵敏度、误诊率和经济成本高等方面的缺陷导致它们很难被普及。RNA分子在细胞中拥有多个拷贝并且存在多种转录调控形态,可以更加准确地反映细胞状态和癌症动态发展过程,而且其检测成本也很低。 过去体液中的RNA标志物研究主要集中在miRNA等小RNA的研究,相对于细胞中大量的长RNA,miRNA的数量要少一个到两个数量级,因此提供的信息也有限。本项目另辟蹊径,通过对大量肝癌患者(HCC)、慢性乙型肝炎患者(CHB)和健康个体(HD)进行血浆中非编码RNA表达谱的高通量测序检测和分析,发现了一种非编码RNA,srpRNA (RN7SL1),的功能结构域可以稳定存在于血液中,并在区分肝癌患者和阴性对照组时具有良好的敏感度和特异性(约90%)。并且,通过在独立验证集上的实时荧光定量检验(RT-qPCR),该srpRNA (RN7SL1)的功能结构域被证明在 肝癌的诊断及预后方面都具有可靠的临床表现。
清华大学
2021-02-01
一种与肝癌相关的非
编码
RNA生物标志物及其
应用
项目成果/简介:肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球第五大常见的消化道恶性肿瘤,也是全球第三大致死性癌症。我国肝癌病发率位居全球首位,肝癌已成为严重威胁我国人民健康和生命的疾病。由于肝癌的早期诊断缺乏可靠的生物标志物,肝癌患者通常在肝癌晚期才被诊断,其5年生存率仅为15%。目前肝癌诊断主要依赖于影像学检查或者血液活检中的甲胎蛋白(AFP)标志物等手段。但这些传统方法对
清华大学
2021-01-12
一种小麦抗穗发芽
基因
TaZFP18及其
应用
项目成果/简介:本发明公开了一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含与SEQ?ID?NO.1序列互补的核苷酸序列,该基因编码CCCH型锌指蛋白18,可作为小麦穗发芽抗感品种的分子标记基因.该小麦抗穗发芽基因TaZFP18为一种新的小麦抗穗发芽主效基因,利用其开发分子标记,可以迅速鉴定小麦是否为穗发芽抗性品种,也为小麦穗发芽抗性育种提供了新的基因资源.
安徽农业大学
2021-04-10
一种小麦抗穗发芽
基因
TaZFP18及其
应用
本发明公开了一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含与SEQ?ID?NO.1序列互补的核苷酸序列,该基因编码CCCH型锌指蛋白18,可作为小麦穗发芽抗感品种的分子标记基因.该小麦抗穗发芽基因TaZFP18为一种新的小麦抗穗发芽主效基因,利用其开发分子标记,可以迅速鉴定小麦是否为穗发芽抗性品种,也为小麦穗发芽抗性育种提供了新的基因资源.
安徽农业大学
2021-04-29
VvSUC27
基因
在促进植物摄取外界蔗糖中的
应用
本发明涉及基因工程技术领域,具体公开了VvSUC27基因(GenBank登录号:AF021810)在促进植物摄取外界蔗糖中的应用以及其在促进植物生长(尤其是在弱光环境或无光环境中生长)中的应用。本发明通过过表达VvSUC27基因,促进了植物摄取外界蔗糖,同时可使转基因植物出现快速生长的表型,并且可以在微光甚至使无光下快速生长,证实了该基因的一个新的功能应用。VvSUC27基因的克隆和转基因的应用,有望应用于肉质根或块根植物及花卉等植物的培育中,使得植物即使在无光下也能快速生长,有利于节约光能减少能源的浪费。
中国农业大学
2021-04-11
HPSE
基因
做为猪免疫性状相关的分子标记及其
应用
研发阶段/n这是免疫性状相关基因专利,通过本专利的应用,在猪育种中可以提高猪的免疫力和抗病力,节约医药成本,提高经济效益。
华中农业大学
2021-01-12
一种端粒酶启动
基因
表达方法及其
应用
本发明公开了一种端粒酶启动基因表达方法(Telomerase?Activating gene Expression,Tage)及其应用,该表达方法基于端粒酶可结合并延长DNA分子末端的端粒酶识别序列,合成新的端粒重复序列的特性,将端粒酶特有的生物学功能与人工转录因子调控细胞基因表达技术相结合,发展了Tage新方法。Tage技术在细胞中可以有效发生,人工转录因子可激活效应基因在端粒酶阳性细胞中的表达,效应基因的表达产物可有效杀灭肿瘤细胞,本发明证明Tage技术可用于杀灭肿瘤细胞,而对无端粒酶活性的细胞
东南大学
2021-01-12
基于CRISPR/Cas9
基因
编辑系统的载体组合及其
应用
01.成果简介 CRISPR/Cas9是细菌在长期演化过程中形成的一种适应性免疫防御系统。其工作原理是crRNA通过碱基配对与tracrRNA结合形成tracrRNA/crRNA复合物,此复合物引导核酸酶cas9蛋白在与crRNA配对的序列靶位点剪切双链DNA。经过研究,通过人工设计tracrRNA/crRNA,改造形成具有引导作用的sgRNA,可以引导Cas9蛋白在多种细胞的特定基因组位点上进行切割、修饰,并最终实现基因突变、插入或缺失。因此,CRISPR/Cas9系统已经被广泛应用于基因编辑技术领域。 近年来,CRISPR/Cas9基因编辑系统在真核生物和原核生物中得到了广泛的应用。在大肠杆菌等革兰氏阴性菌中,用一个载体表达cas9基因,同时由于革兰氏阴性菌重组效率低,需要在这个载体上表达λ-RED重组酶;在另一个载体中表达sgRNA和用于同源重组的同源臂序列。两个载体都转入大肠杆菌中时,sgRNA介导Cas9蛋白切割基因组上特定序列,形成双链断裂,刺激同源重组的发生,从而实现基因编辑。 本项成果构建了适用于盐单胞菌的基于CRISPR/Cas9的基因编辑系统。该系统由两个载体组成:第一个载体表达Cas9基因,且不需要表达λ-RED重组酶,实际操作中不再需要诱导λ-RED重组酶的表达,简化了步骤流程;第二个载体表达sgRNA,并含有用于同源重组的同源臂序列。从而实现了基因编辑。本项成果的技术优势包括: (1)基因编辑时间由原有的20余天缩短到7-8天; (2)N个基因编辑时间由原有的N个月缩短到3+5N天; (3)无需表达λ-RED重组酶。 图1 盐单胞菌TD01进行基因编辑的流程示意图02.应用前景 本项成果可作为CRISPR/Cas9基因编辑系统的载体,广泛应用于基因编辑领域。03.知识产权 本项成果已申请1项发明专利。04.团队介绍 本项目为多团队合作项目,其中一个团队的负责人为清华大学教授,博士生导师,长江学者特聘教授,国家杰出青年基金获得者。主要研究方向为合成生物学、微生物代谢工程、生物材料、工业生物技术。已发表国内外高水平学术论文数十篇,申请专利70余项。05.合作方式 投融资。06.联系方式邮箱:zhangxinrui@tsinghua.edu.cn
清华大学
2021-04-13
一种
基因
工程红球菌及其构建方法与
应用
1. 痛点问题 红球菌是具有高抗逆性(耐有机溶剂、耐高温、耐酸碱)的特殊放线菌,日本30年前首先使用红球菌高效催化丙烯腈水合生产丙烯酰胺——其聚合产物广泛用于石油开采、水处理、土壤改良剂等领域——迄今为止仍是工业生物技术领域最成功的案例之一。开发红球菌基因编辑方法,一方面可以实现红球菌细胞自身性能的按需调控(如敲除副产物基因),解决丙烯酰胺、丙烯酸铵等酰胺、羧酸类大宗/精细化学品生产中的高成本和高排放问题,另一方面有望以红球菌细胞为普适性宿主,高表达各种外源功能酶,从而实现重组红球菌全细胞催化技术的普遍应用,尤其是解决手性医药中间体现有制备工艺中路线长、工艺复杂、原子经济性差、环境污染严重等各种主要问题。但是,作为一种革兰氏阳性放线菌,红色红球菌存在基因组中GC含量高、基因转化率低、非法重组严重等问题,基因组改造困难。目前红色红球菌基因组改造主要依赖于自杀质粒介导的同源重组,但自杀质粒转化效率和单交换成功率很低,正确编辑率更低。因此,迫切需要开发高效的红球菌基因组编辑工具。 2. 解决方案 本技术核心成果是一种基于CRISPR(成簇规律间隔短回文序列)-Cas9(DNA剪切蛋白)技术的红色红球菌基因组高效编辑方法。该技术通过红色红球菌特有启动子及质粒元件,首先实现了Cas9蛋白在红色红球菌中的表达及切割功能;其次成功规避了红球菌的限制修饰系统,将红色红球菌基因转化效率提高了80多倍;接下来,又通过红球菌重组酶的引入,显著提高了外源基因在红色红球菌中的同源重组效率,最终率先成功建立红色红球菌的CRISPR/Cas9基因编辑系统,不仅可以实现基因组上目标基因的敲除、替换和改造,也可实现多个基因的同时敲除以及无痕叠加敲除,为红球菌全细胞催化平台技术开发及其在化学品绿色先进制造中的应用奠定了坚实基础。 合作需求 开展合作开发、技术许可等,寻求有志于生物制药、生物合成、石油开采、日化洗涤等不同应用领域进行红球菌全细胞催化法生产目标产品的企业合作,尤其是在上述不同领域具有生产和销售优势或经验的企业。
清华大学
2021-12-16
花生维生素E合成相关
基因
AhPK及其在提高植物维生素E含量
和
耐盐性中的
应用
本发明提供了花生维生素E合成相关基因AhPK及其在提高植物维生素E含量和耐盐性中的应用,将该AhPK基因在花生中超量表达后,得到生育酚含量和活性最高的α生育酚含量显著提高的转基因植株。实验证明,将本发明的AhPK基因超量表达可显著提高花生叶片的维生素E含量,且可明显增强转基因花生种子的耐盐性。本发明的蛋白及其编码基因对于植物维生素E合成机制的研究,以及提高植物的维生素E含量、活性和植株的抗逆性具有重要的理论及实际意义,应用前景广阔。
青岛农业大学
2021-04-11
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