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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义,而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析,还面临很多挑战。 肿瘤样本具有其独有的特点,在样本制备和单细胞分离过程中,其细胞应激反应大、坏死细胞多,为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战; 肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题,比如复杂的微环境和高度的异质性,而如何充分考虑这些难点,并从信息学的视角进行深入研究,有待建立全面、自动的分析框架; 肿瘤单细胞数据的分析,对科研人员的编程能力和分析经验要求很高,亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛,提高研究的效率。 2.解决方案 本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括: 1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案; 2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析); 3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法; 4)从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性; 5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法; 6)构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。 基于本项成果产生的产品、服务或解决方案: 1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer; 2)针对软件使用和分析结果解读的服务; 3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。 3、合作需求 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学 2022-08-30
β-咔啉类生物碱及其在制备抗肿瘤药物中的应用
细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs)是一类丝氨酸(Ser)/苏氨酸(Thr) 激酶,其分子量约为 35-40kD,最早发现于裂殖酵母菌和栗酒酵母菌, 其中基因序列的同源性超过 40%并被命名为 Cdc28 和 Cdc2。在哺乳 动物中,已发现 10 个成员,Cdc2(CDK1),CDK2-10。CDKs 在细胞 周期调控网络中处于中心地位。普遍认为 CDKs 中的 CDK2、CDK4 和 CDK6 与肿瘤发生密切相关,在肿瘤细胞中常
兰州大学 2021-04-14
一种抑制 ras 原癌基因过表达的抗肿瘤药物
生脉散是中医千古名方,首载于金代医家张元素所著《医学启 源·卷下》―麦门冬‖条内;内外伤辨惑论及医方考中也有记载。由 人 参、麦冬、五味子组成,意在取―人参之甘补气,麦门(即麦冬) 苦寒 泻热补水之源,五味子之酸清肃燥金‖。 生脉散最早用于治疗暑热汗多,气阴两伤之证,表现为汗多、身 疲、体倦、气短、咽干、脉虚等症状。古代医家也用于金叶耗伤,脉 微欲绝等症状,又用作气阴两虚病人的补益剂。此方经过几百年的长
兰州大学 2021-04-14
西安交大科研人员在肿瘤药物研究方面取得新进展
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是最常见的原发性肝脏恶性肿瘤,其发病率高且极易转移复发,严重影响人类健康。传统药物治疗存在毒副作用大、多药耐药等问题,因此亟需寻找新的作用靶点和药物。研究发现,多形性腺瘤基因样蛋白2(pleomorphic adenoma gene like-2,PLAGL2)与肿瘤侵袭转移、耐药以及不良预后等密切相关。
西安交通大学 2021-09-23
一种用于高能束增材制造的温度场主动调控系统及其控制方法
本发明公开了一种梯度温度场主动调控系统及其控制方法,系 统由温度场监控系统、加热系统和控制系统;温度场监控系统用于测 量成形区域 XOY 平面及四周的温度场信息,将获得的温度场信息进行 量化处理后反馈给控制系统,加热系统根据控制系统指令对成型缸的 底部和四周进行温度场的分区独立实时调节,以实现在加工过程中整 个加工区域的温度场恒定,保证已加工区域与未加工区域处于合理的 温度梯度,避免热应力导致构件翘曲、变形、开裂。本
华中科技大学 2021-04-14
治疗肺纤维化 1.6 类化药盐酸多西环素的临床研究
该项目通过建立四种不同致病因素(包括博来霉素、百草枯、二 氧化硅和脂多糖加香烟提取物)诱导的肺纤维化动物模型,实验结果 表明多西环素可明显降低肺纤维化模型动物的肺系数,改善肺组织纤 维化程度,降低肺纤维化病理评分及肺组织中胶原的含量,降低慢性 炎症介导的肺纤维化模型小鼠血清中炎症因子 TNF-α、TGF-β1、IL- 4 的含量,增加 IFN-γ的含量。除此之外,多西环素还可以增加肺纤 维化模型小鼠的体重,改善模型小鼠的生存状态,显示出多西环素对 肺纤维化具有很好的治疗效果,且毒性和副作用均较低。 课题组研究发现多西环素可通过抑制气道和肺上皮细胞转录因 子 Twist1, Snail, Slug 和间质细胞标记物 Vimentin 的表达,并增加 E-cadherin 的表达,从而使上皮细胞维持其原有极性和紧密连接,抑 制细胞骨架重塑,从而抑制其向肌成纤维细胞的转变和活化,减少细 胞外基质的分泌及其在肺间质的过度沉积,进而抑制肺纤维化的病理 过程。本项目药理机制有一定的深入研究,已申请了专利(专利号 201410514986.4)并完成临床前实验,获得了临床试验批件(批件号: 2017L01323) 技术创新点: 1)目前肺纤维化上市药物疗效不甚理想,急需开发新型有效药 物, 多西环素在临床前研究中表现出良好的抗肺纤维化效果,开发 潜力很大。2)多西环素本身即为抗生素,可达到抗感染、抗炎与抗组织纤 维化的多重功效。 3)与其他治疗肺纤维化药物相比,多西环素毒副作用低,患者 依从性好。 4)该类化合物合成方便,生产工艺成熟,可快速的投入生产并 获得高效制剂。 市场应用前景: 近年来肺纤维化的发病率不高(8/10 万人),但一直呈现上升趋 势。肺纤维化患者从出现呼吸道症状到呼吸窘迫死亡的中位生存时间 仅为 28.2 个月,从诊断建立到死亡的平均生存时间为 3.2~5 年, 肺纤维化 5 年病死率超过 40%,其自然缓解相当罕见(<1%),甚至 比某些恶性肿瘤死亡率还高。从这些数据可以看出,肺纤维化已经给 我国人民的生命健康造成严重的不良影响。目前治疗肺纤维化的上市 药物仅有吡非尼酮和尼达尼布两种,吡非尼酮 2015 年全球销售额为 5.63 亿美元,2016 年第一季度该药销售额为 1.78 亿美元。尼达尼布 于 2015 年被纳入 ATS/ERS/JRS/ALAT 特发性肺纤维化诊治国际循证 指南的推荐用药,当年销售额达 3 亿欧元,2016 年尼达尼布的销售 额翻倍达到 6.13 亿欧元,2017 年上半年达到 4.29 亿欧元。这两种药 物都是由国外研发销售,目前国内临床上需要开发疗效佳、安全性较 好、自主知识产权的治疗肺纤维化药物,因此盐酸多西环素市场前景 良好。 合作方式及条件: 希望进行专利转让,或者与投资者共同开发,申报临床试验批件, 并进行临床研究。 已获得的知识产权: 多西环素的应用(治疗肺纤维化)(专利号:201410514986.4 ) 本项目已获得新药临床批件,批件号码为 2017L01323。
南开大学 2021-04-13
基于电纺芯鞘纳米纤维的药物两级控释给药系统
同轴静电纺丝通过采用一个具有套筒结构的纺丝头为模板,控制两股工作流体以内外关系在高压电场下拉伸,通过溶剂的快速挥发,在纤维接收板可以获得具有芯鞘结构特征的纳米纤维膜。 选用合适的药用聚合物辅料为芯鞘结构纳米纤维的基材,通过同轴高压静电纺丝可以有效调节药物在纳米纤维芯部或鞘部的分布与含量,进而调控药物的两级缓控释给药特征,并通过同轴电纺过程中芯鞘流量的调控,调节药物在两级的相对释放量。 可以根据用户需要进行多种药物的两级控释给药系统的研制和开发。
上海理工大学 2021-04-13
低压离子驱动材料及腕式智能监测/给药装置的研发与应用
本项目以医疗服务为目的,基于低压离子驱动材料开发一款腕式智能监测/给药装置,主要面向需要长期用药物的慢性病患者,根据治疗需求连续给药的同时,具有生理健康感应监测的功能。该产品如图1所示,主要由储药盒、微泵器件、生理感应装置、电源、控制和显示/传输系统组成。主要功能如下: 1)根据要求输入给药曲线,控制系统产生数字脉冲电压驱动微泵器件,通过频率和控制单元数目来控制给药速度,这种给药控制方式具有设计简单和结构紧凑的特点。 2)能够实时测量人体脉相、呼吸等节律和血压,作为日常
河海大学 2021-04-14
一种用于瘢痕修复的可降解高分子载药纤维膜
本发明公开了一种用于瘢痕修复的可降解高分子载药纤维膜,净重0.01-5份的瘢痕修复药物溶液分散于100份重的可生物降解的高分子材料溶液中得到混合体系,将混合溶液转移到喷射储液器中,通过改变静电纺丝参数制备无规或者定向排布的目标纤维膜。本发明所制备静电纺丝膜具有高的孔隙率,透气性好,可以解决由于封闭性贴膜不透气所引起的副作用。膜基体材料为可降解高分子,一方面将药物包封到纤维内部可保护药物结构的稳定,另一方面通过高分子材料的降解控制药物缓慢释放,可起到比传统的瘢痕修复制剂或者药膏更长的药物作用时间,并可根据瘢痕处尺寸大小修剪成需要的形状,具有很好的定制性和易用性。
西南交通大学 2016-10-21
帕立骨化醇原料药合成关键技术突破及产业化
项目背景:继发性甲状旁腺功能亢进症(SHPT)是慢性肾功 能衰竭患者常见的并发症,也是慢性肾衰竭终末期血液透析时最 主要、最严重的并发症之一。其主要表现为甲状旁腺激素(PTH) 水平升高和甲状旁腺增生,可导致严重的骨骼损害、难治性皮肤 瘙痒、贫血、神经系统损害及心血管疾病等。帕立骨化醇是一种 高选择性第三代维生素 D 受体激活剂,用于预防和治疗与慢性肾 病相关的继发性甲状旁腺功能亢进症。帕立骨化醇原料药采用 CD 环氧化、上保护、A 环和 CD 环经 wittig 偶联、脱保护、纯化 得到符合 EP 标准的原料药。目前制备过程中存在的主要问题是 CD 环中存在一种 24R 杂质,该杂质与 A 环结合后,原料药需要 经过多次重结晶才能将该杂质降低至质量标准要求的0.1%以下, 严重降低了产品的收率,增加了原料药的成本。因此本项目的关 键技术就是采取措施降低 CD 环 24R 杂质对生产工艺、产品收率 以及原料药成本的影响。 所需技术需求简要描述:1、优化 CD 环合成工艺,以及提高 制备 CD 环原料的质量控制。CD 环的 24R 杂质是由其制备原料引 入,因此需要开发原料的控制方法,在源头控制杂质的引入。同时优化 CD 环的合成工艺,通过优化生产工艺有效去除 CD 环中的 24R杂质,确保CD 环24R杂质不超过0.1%,其它单杂不超过0.2%。 2、优化帕立骨化醇原料药的纯化工艺,提高对原料药中 24R 杂 质的去除能力,达到 1 次重结晶即可得到符合标准原料药的目 标,确保 CD 环成品纯度达到 99.5%以上。  对技术提供方的要求:技术上具要有创新性、能满足企业在 帕立骨化醇原料药方面的技术需求。 
正大制药(青岛)有限公司 2021-09-02
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