|
搜索
搜 索
高等教育领域数字化综合服务平台
一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题
癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一，基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性，对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义，而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析，还面临很多挑战。
肿瘤样本具有其独有的特点，在样本制备和单细胞分离过程中，其细胞应激反应大、坏死细胞多，为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战；
肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题，比如复杂的微环境和高度的异质性，而如何充分考虑这些难点，并从信息学的视角进行深入研究，有待建立全面、自动的分析框架；
肿瘤单细胞数据的分析，对科研人员的编程能力和分析经验要求很高，亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛，提高研究的效率。
2.解决方案
本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括：
1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题，提出了全面、精细的数据质量控制方案；
2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程（数据标准化、降维、聚类、差异表达分析）；
3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法；
4)从重要表型（细胞周期、干性）、基因集（已知的和潜在的）两方面深度解析了肿瘤内部的异质性；
5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法；
6)构建了自动化、智能化分析的软件平台，能够自动生成全面、直观的分析报告。
基于本项成果产生的产品、服务或解决方案：
1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer；
2)针对软件使用和分析结果解读的服务；
3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。
3、合作需求
团队要求：合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验，能为本项目的应用与落地提供条件；
资金需求：合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学
2022-08-30
新冠病毒现场快速检测试纸
针对体温检测只能检测已有症状感染者，核酸检测需要相关配套设备且时间较长的问题，在广西科技厅疫情应急管理项目的支持下，学校“广西八桂学者”陈真诚教授团队放弃寒假，迎难而上，勇于担当，联合桂林世康医疗科技有限公司于2月初开始日以继夜地联合攻关。经过多次试验筛选出最佳的实验配方和合理的制备工艺，并于2月12日成功研制出一款专门用于新型冠状病毒快速检测试纸，在桂林市疾控中心和南宁第四人民医院等定点医院进行了批量临床样本测试，检测时间仅需10分钟，临床测试结果与核酸检测结果匹配度达到100%，目前科研成果正在重庆大学附属医院和解放军总医院派驻武汉医疗队进行更大范围测试。
桂林电子科技大学
2021-04-10
常见食物中毒源快速检测技术
利用分子生物学、免疫学、计算机信息等技术和方法，针对食 物中所含的重金属等无机毒物、药物残留和微生物及毒素等不同有毒有害物质， 开发了相应的快速、准确、高效的检测技术，为食物中毒事故应急体系（包括 人员组成、毒物检测技术、检测设备等）的建立和中毒事件突发的预警机制提 供有力技术支持。生产条件及经济效益预测：根据市场的发展趋势预测：预计 在投产第一年产品投放市场并逐步被市场认可，试剂盒销售产值达到 1000 万元， 第二年增长 100%，在第三年至第五年以至少 75%的速度递增，第五年销售产值 可达到 1 亿元。
青岛农业大学
2021-04-11
禽类主要疫病快速检测试纸条
可以量产/n本成果分别建立了禽类主要传染病抗体及禽流感病原快速检测体系。研制了具有自主知识产权的禽流感、新城疫、传染性法氏囊病、传染性支气管炎和鸡毒霉形体病的5种抗体的胶体金检测试纸条；禽流感H5、H9亚型及通用型等3种抗原检测试纸条；禽流感疫苗免疫和野毒感染快速鉴别诊断试纸。本成果研制的快速检测试纸条具有特异性强、灵敏度高、操作简便、可在3分钟内出结果，不需任何仪器设备，便于现场检测等优点，为禽类主要传染病的防治，尤其是禽流感防控提供了技术支持，保障了养禽业的健康发展。技术水平：国家发明专利（授权
华中农业大学
2021-01-12
食物中的过敏成分快速检测技术
一、成果简介 近十几年来，随着物质生活水平的提高，过敏性疾病发病率越来越高。据统计，过敏患者已占世界人口的40%，在我国，过敏反应发病率约为10%，且呈逐年上升的趋势。其中食物过敏严重威胁着人类健康，90％的食物过敏是由牛奶、鸡蛋、大豆、花生、鱼、甲壳类、坚果、小麦等8大类 物质引起的。过敏症状主要表现为腹痛、腹泻、呕吐、皮疹、鼻炎、哮喘、过敏性休克等，严重可 致死亡。食物加工方式多
中国农业大学
2021-04-14
猪肉冷冻储藏期快速无损检测技术
目 前已有的研究， 尚无直接针对猪肉冻藏期的检测方法，虽 然冷冻猪肉的品质指标与冷冻储藏期有密切的联系，但是其检测方法大都存在检测时间长、操作步骤繁琐、需对样品进行解冻的缺点。极大的限制了对冷冻猪肉状态监督检测的开展，造成了对冷冻肉品监管
西华大学
2021-04-14
稻米品质近红外快速检测技术
中试阶段/n该项目是利用近红外来检测稻米，其光谱区为780-2526nm，主要是由低能电子跃迁、含氢原子团伸缩振动的组合频和倍频吸收产生。稻米中含有较多的含氢基团，所产生近红外光谱可用于稻米成分、理化特性等的定量分析。确定了稻米主要营养成分（蛋白质、脂肪含量）和加工指标（出米率等）、稻米品质的特征波长、建立了稻米品质的预测模型和开发了稻米品质近红外检测软件，由于近红外光谱分析技术具有快速无损、测试简单、检测成本低和重现性好等优点，可广泛应用于农业领域（稻谷、小麦等粮食加工企业），实现稻米全产业链生产
华中农业大学
2021-01-12
多光谱猪肉糜掺杂快速检测装置
本实用新型公开了一种多光谱猪肉糜掺杂快速检测装置，涉及农产品质量快速检测技术领域。装置包括：多光谱波段切换室、控制室、样本光照室和智能检测模块。多光谱波段切换室安装于长方体外壳的顶端一侧，室内设有一个滤光片切换装置，该装置的圆盘上装有四个不同波段的滤光片，一个黑白工业相机被置于室内中部，正对于一个滤光片的上方，相机镜头正对样本光照室，和智能检测模块相连接。本实用新型通过切换滤光片的方式，结合黑白工业相机对待测样品的多光谱图像进行采集，通过智能检测模块终端对多光谱图像信息进行实时计算和显示，完成对猪肉糜掺杂鸡肉比例的快速检测。整个装置具有体积小、操作简单、便携耐用、智能化程度较高等优点。
青岛农业大学
2021-04-13
癌细胞简化自身基因组冗余序列以便快速增殖
核糖体DNA编码核糖体的关键组分-核糖体RNA，对蛋白质翻译和细胞增殖具有重要的作用。然而，核糖体DNA的拷贝数在人类基因组中是易变的，由于技术手段的限制，人们对哺乳动物细胞如何维持和控制核糖体DNA的拷贝数和稳定性所知甚少。本研究应用计算生物学和数字微滴式PCR（Droplet digital PCR）方法分析了正常和癌症状态下，人类和小鼠基因组中核糖体DNA的拷贝数和序列变异情况。发现人类癌症基因组中核糖体DNA拷贝数出乎意料地显著减少，并伴随许多其他基因拷贝数的变异。此外，癌症基因组的核糖体DNA序列也更易发生突变。 根据文献证据的提示，研究团队进一步探讨了癌症模型中mTOR（哺乳动物雷帕霉素靶蛋白，mammalian target of rapamycin）功能与核糖体DNA拷贝数减少的关系。发现Pten基因（mTOR信号通路的负调控因子）敲除的白血病小鼠模型中，癌症造血干细胞早期就出现核糖体DNA拷贝数的减少，但其细胞增殖、核糖体RNA合成和蛋白翻译水平等均显著提高。说明核糖体DNA拷贝数丢失是mTOR通路过表达的癌症的一种常见特征。这一研究结果提示，测定核糖体DNA拷贝数，可成为预测癌症对DNA损伤药物敏感性的一个简单而有效的新指标。
中山大学
2021-04-13
Nodal蛋白检测试剂盒简介（肿瘤筛查）
Nodal是出现在肿瘤组织和患者血液中的一个小蛋白分子，作为一种新型的肿瘤标志物具有巨大的临 床应用前景。目前国内外尚无针对Nodal 蛋白的高敏感检测的试剂盒产品应用于临床。建立了高灵敏度的 生物素-亲和素检测系统。此检测方法可检测pg/ml级的Nodal蛋白，使用该方法测定结直肠癌、鼻咽癌和胆 囊癌病人血清，结果表明三种肿瘤病人的Nodal 浓度明显高于正常人水平。
中山大学
2021-04-10