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猪骨骼肌生长和脂肪发育及分布相关功能基因和调控元件的筛选、鉴定和育种价值评估
四川农业大学 2021-02-01
左永春教授课题组在利用人工智能筛选早期胚胎发育关键标记研究中取得新进展
人类早期胚胎发育虽然只有大约7天的时间,但是却经历了关键的分子事件,其中包括合子基因组激活(ZGA)和早期胚胎细胞的命运决定。伴随测序技术的进步,单细胞测序技术可以有效地揭示早期胚胎发育的细胞命运决定的转录图谱,但是单细胞转录组数据也存在许多问题,例如dropout事件(表达的基因未被检测到),这使得差异分析方法在处理单细胞受到了限制。本研究中通过使用F-score算法和差异分析方法(limma,edgeR和DESeq)在人类早期胚胎单细胞转录组中得到两个关键的基因集。通过比较先前研究中关键的基因来分析两种方法的不同,POU5F1(OCT4)在细胞多能性的获得和维持中起到了重要的作用,但是在差异分析方法中却被排除,而F-score算法却可以获得。我们通过研究基因的表达趋势发现,差异分析方法对于在多个时期高表达的基因会被排除,这对于胚胎发育中的细胞的异质性是十分不利的。
内蒙古大学 2021-02-01
清华大学生命学院颉伟课题组发文揭示DNA甲基化通过去记忆化构建早期胚胎发育的表观屏障
早期胚胎发育起始于高度特化的精子和卵子的结合,从而形成全能性的受精卵。在这个过程中,表观遗传信息重编程对于擦除亲本表观遗传记忆和重建细胞全能性十分重要。
清华大学 2021-12-28
北京大学地空学院高克勤课题组发现四足动物演化早期四肢的轴前发育模式与五指/趾型形成有关
北京大学地空学院史前生命与环境研究所高克勤教授团队在长期的研究过程中积累了大量中生代和现代蝾螈类标本和数据。基于214件标本的高精度CT扫描和三维重建,贾佳博士后和高克勤教授及国内外合作者对蝾螈类6科37属60个物种的腕/跗骨进行了骨化发育模式分析。
北京大学 2022-11-08
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