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大数据挖掘在植物表观遗传组学中的应用
近年随着测序技术的不断完善,生物领域积累了大量基因组、转录组、表观组学数据。怎样有效利用这些数据挖掘生物学新知识,是研究工作者在大数据时代面临的挑战。该研究以DNA甲基化测序数据入手,探索了大数据挖掘揭示生物学新知识的研究之路。翟继先课题组重新分析了公共数据库中来自不同实验室的约500余组Col-0型拟南芥DNA甲基化数据:通过比较单个突变体和多个野生型,鉴定了每个突变体中高置信度的DNA甲基化差异区域,进而分析了不同突变体间DNA甲基化差异区域的重合度,揭示控制DNA甲基化相关基因之间的联系。
南方科技大学 2021-04-13
The EMBO Journal刊发郁飞教授课题组新成果
揭示了拟南芥转录因子AUXIN RESPONSE FACTOR 2(ARF2)和PHYTOCHROME-INTERACTING FACTOR 5(PIF5)(以及PIF4)直接互作,控制植物ABS3介导衰老途径的转录重编程的分子范式。
西北农林科技大学 2022-10-13
一种激光器组的控制方法及其系统
一种激光器组的控制方法及其系统,属于外差干涉测量领域, 解决现有多台激光器构成的外差式干涉仪中激光束差频与功率不稳定 的问题,使激光器间的差频维持稳定的同时抑制激光器功率衰减,从 而提高测量设备性能。本发明的控制方法,包括初始化步骤、实时检 测步骤、稳频控制步骤和功率控制步骤;本发明的控制系统,相应包 括初始化模块、实时检测模块、稳频控制模块和功率控制模块。本发 明能够实现实时频率反馈控制,使激光器间的差频维持稳定的同时抑 制激光器功率衰减,以满足高时间精度的测量需求;所涉及的装置结 构简单,确保了
华中科技大学 2021-04-14
癌细胞简化自身基因组冗余序列以便快速增殖
  核糖体DNA编码核糖体的关键组分-核糖体RNA,对蛋白质翻译和细胞增殖具有重要的作用。然而,核糖体DNA的拷贝数在人类基因组中是易变的,由于技术手段的限制,人们对哺乳动物细胞如何维持和控制核糖体DNA的拷贝数和稳定性所知甚少。本研究应用计算生物学和数字微滴式PCR(Droplet digital PCR)方法分析了正常和癌症状态下,人类和小鼠基因组中核糖体DNA的拷贝数和序列变异情况。发现人类癌症基因组中核糖体DNA拷贝数出乎意料地显著减少,并伴随许多其他基因拷贝数的变异。此外,癌症基因组的核糖体DNA序列也更易发生突变。      根据文献证据的提示,研究团队进一步探讨了癌症模型中mTOR(哺乳动物雷帕霉素靶蛋白,mammalian target of rapamycin)功能与核糖体DNA拷贝数减少的关系。发现Pten基因(mTOR信号通路的负调控因子)敲除的白血病小鼠模型中,癌症造血干细胞早期就出现核糖体DNA拷贝数的减少,但其细胞增殖、核糖体RNA合成和蛋白翻译水平等均显著提高。说明核糖体DNA拷贝数丢失是mTOR通路过表达的癌症的一种常见特征。这一研究结果提示,测定核糖体DNA拷贝数,可成为预测癌症对DNA损伤药物敏感性的一个简单而有效的新指标。
中山大学 2021-04-13
一种便于清粪的幼貂饲养笼组
本实用新型公开了一种便于清粪的幼貂饲养笼组,包括底座和笼体,所述笼体为等腰梯形体结构,底座包括一侧带有缺口的环形固定框,固定框内设有呈水平放射状的支撑架,笼体放置在支撑架上。所述支撑架的中心位置设置有曲柄摇杆机构,曲柄摇杆机构的输出轴上套有毛刷滚筒,毛刷滚筒位于支撑架下方的固定框内,摇动曲柄摇杆机构带动毛刷滚筒在固定框的底板上转动,将落入至固定框底部的幼貂粪便收集到固定框缺口处放置的粪便收集盒内。本笼组通过曲柄摇杆机构带动毛刷滚筒转动,将落入在底座内的幼貂粪便收集到底座一侧的粪便收集盒内,操作简单,便于饲养员清理幼貂粪便。
青岛农业大学 2021-04-13
XBC-SS/S(SH)柴油机消防泵组
用于以水为主要灭火剂的中压和低压消防系统的单级双吸中开式消防泵。
山东双轮股份有限公司 2021-06-23
植物株型相关蛋白PROG2及其编码基因与应用
本发明公开了一种植物株系相关蛋白PROG2及其编码基因与应用。本发明所提供的植物株系相关蛋白PROG2为如下a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质;a3)将a1)或a2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物株型相关的蛋白质。实验证明,植物株系相关蛋白PROG2对调控水稻株型和产量具有非常重要的作用,在培育高产水稻新品种中具有广阔前景。
中国农业大学 2021-04-11
煤粉体改性大豆蛋白塑料及其制备方法
西安科技大学自 2003 年开始就对蛋白质塑料进行了研究,随后将超细煤粉作为功能填料引入其中,对不同变质程度的煤、煤的氧化预处理、灰分含量等对复合材料的影响进行了系统性研究。目前此项技术已经成熟,获批发明专利一项。
西安科技大学 2021-04-11
组蛋白去乙酰化酶抑制剂新药研发
传统的抗肿瘤药物,如烷化剂、铂类试剂、作用于核酸合成的药物、作用于微管蛋白合成 的药物等,一般存在毒性较大、选择性较低等问题,因此,研究寻找安全有效、选择性较好的 靶向性抗肿瘤药物具有重大的科学意义和巨大的社会价值。 组蛋白去乙酰化酶 (Histone Deacetylase,HDAC) 是治疗肿瘤的新靶标,其抑制剂 Vorinostat (SAHA) 和Romidepsin (FK228) 已分别于2006年和2009年经美国FDA批准上市用于治 疗表皮T细胞淋巴瘤;该类抑制剂显示出良好的肿瘤治疗效果及较小的毒副作用,是目前最具 前景的抗肿瘤药物之一。 本项目综合运用分子动力学模拟、计算机辅助药物设计、化学合成、药理学活性测试等 方法,通过“设计-合成/修饰-测试”的多次循环,开发了一系列结构新颖的四氢-γ-咔啉骨 架的HDAC抑制剂。该类抑制剂可以有效抑制HDAC总酶及HDAC1的活性,多个化合物的酶 活性都低于50 nM;并且,该系列多数化合物对Hela、A549、HCT116、K562、MCF-7等肿瘤细 胞株表现出比阳性对照药物SAHA更高的活性,多个化合物对所测肿瘤细胞株的抑制活性低于 1 μM,而对于人类正常细胞无抑制活性;在动物模型试验中,代表性化合物对接种Lewis肺癌 荷瘤小鼠模型表现出良好的治疗效果,且没有观察到明显的体重变化和毒性反应。因此,该类 HDAC抑制剂可以作为药物先导化合物用于制备抗肿瘤药物,为广大肿瘤病患者带来福音,也 向开发我国具有自主知识产权的抗肿瘤药物迈进一步。 
华东理工大学 2021-04-11
解析人类胆汁盐外排蛋白ABCB11的电镜结构
中国科学技术大学微尺度物质科学国家研究中心和生命科学与医学部陈宇星教授、周丛照教授、孙林峰教授课题组合作,利用冷冻电镜技术解析了人类胆汁盐外排蛋白ABCB11的近原子分辨率三维结构,为深入理解该类膜蛋白的转运机制以及其突变引发的致病机理提供了基础。该研究成果在线发表在《Cell Research》上。研究表明,胆小管上的ABC膜转运蛋白ABCB11是胆汁盐外排到胆小管中最重要的蛋白。该蛋白编码基因突变会导致各种胆汁淤积病症。自发现该基因的近20多年来,对ABCB11的研究报道持续不断,但人们对该蛋白转运胆汁盐的机理仍然不清楚。作者借助冷冻电镜技术解析了该蛋白开放状态下的3.5 Å 高分辨率的三维结构。该蛋白由1321个氨基酸残基组成,以单体的形式发挥功能。结构上包含两个彼此靠近的跨膜结构域(TMD)和两个分开的胞内核算结合结构域(NDB)以及一个N端的α螺旋,整体呈现对肝细胞内开放的构象。根据该结构提供的三维空间信息,作者对临床上该蛋白的突变体致病机理进行了分析。作者发现,临床样本的突变会破坏蛋白质分子内部的相互作用,或者使蛋白错误折叠,导致蛋白质转运功能降低或者完全丧失,最终引发相关疾病。作者还对一系列胆汁盐以及两种抑制剂(利福平、格列本脲)的刺激ATP水解活性的进行了验证,发现利福平和格列本脲以竞争方式抑制该蛋白的活性,这也是服用这类药物导致肝损伤的主要原因之一。
中国科学技术大学 2021-04-10
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