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基于新一代测序的生物信息云平台及其在科研和医疗健康领域的应用
1 项目简介本项目建立的生物云平台,以基于 Web 的方式提供服务,用户可以轻松快速获取服务,国内外普遍缺乏成熟的技术,标准和平台。我们首次把独具特色的机器学习模型预测算法与最新的高通量测序方法( non-polyA RNA-seq) 相结合。我们的研究对象为长链非编码 RNA( non-PolyA),目前国际上还很少有人通过高通量测序技术对疾病的 lncRNA 进行全面预测分析和功能分类。随着测序速度不断提高,测序成本不断降低,本项目将来可以发展为面向人民大众的个性化医疗服务的平台。 图 1 生物医学信息云平台的产业化方向 http://www.incrna.org图 2 生物医学信息云平台的应用程序一览 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本项目使用的核心技术“基于整合性生物信息云计算和新一代测序技术( incRNA) 的非编码基因组疾病(如癌症)检测技术平台”已经通过软件查新认证( 20121022044750914)。正在准备申请国家版权局软件著作权登记证书。2 效益分析( 1)随着新一代高通量测序技术的发展,生物信息数据爆炸式增长,数据解读成为生物医学研究和临床应用的巨大问题,我们团队依托清华大学生命学院鲁志实验室在生物信息学,尤其是在 lncRNA 领域的技术专长开发的云计算平台将为广大科研工作和和临床用户提供可靠的数据分析云服务,提高他们的科研效率,为科学的发展做出贡献。 ( 2)我们团队通过与中国人民解放军总医院,上海肝胆医院等十多家临床单位的合作,将为鉴定癌症的早期诊断和药物治疗提供新的靶点,这不仅会增强中国基础临床科学的发展,通过临床应用还会为病患者带来癌症早期诊断、健康管理等个性化医疗服务,这将具有广泛的社会效益。 ( 3)通过我们打造高通量测序数据分析云计算平台和开展以癌症早期检测为主要内容的个性化医疗服务,将为中国培养一批高水平的生物信息数据分析人才,这将增强中国在生物信息学方面的实力。
清华大学 2021-04-13
基于集成学习的网络流量预测
本平台设计一套集成学习系统用来精确预测未来时间段的流量,本系统使用随机森林,SVR,三指数 平滑、GBDT,BPNN等传统算法和机器学习算法作为单模型,并通过集成学习的方式提高预测准确率。
中山大学 2021-04-10
集成国产处理器的SoPC芯片
目前,国产集成电路“缺芯少减”的现象非常严重,特别是在编程逻辑器件被美国几家著名大公司所垄断.国内与固外差距巨大,可编程器件目前广泛应用于通信航天航空导航遥感遥测。大的应用需R和发展前展。本项目针对嵌入了处理器的SoPC芯片(SystemonPogrammableChip)具有该现状,与成都华微公司合作,研制了完全自主可控的SoPC芯片。
电子科技大学 2021-04-10
基于Cadence的集成电路实验平台
基于Internet构建了一种集成电路实践教学平台。网络采用C/S架构,用户身份认证使用NIS服务来进行搭建,并配合nfs和autofs来自动挂载用户目录,实现可调配的IC工作环境。该平台与业界最新的主流技术对接,通过有线或无线的方式远程登录到服务器,学生可以在课堂、课后,不受时间和地点的限制进行集成电路的实践学习。实践表明该平台可以使学生掌握较为全面的集成电路设计技术,培养学生的工程项目意识,增加实践经验,并且资源可以得到充分地利用。
江苏师范大学 2021-04-11
集成高速光开关技术及关键器件
磷化铟基集成高速光开关芯片
中山大学 2021-04-10
深水网箱健康养殖技术集成示范
本技术成果针对当前广东省海水网箱养殖存在的问题,依托中山大学在深水网箱开发和养殖 技术领域的研究实力,结合我省深 水 网 箱 产 业 园 建 设 的 实 际 需要,开展深水抗风浪网箱的研制和 养 殖 技 术 推 广 。
中山大学 2021-04-10
功能集成化光纤传感器
传统光纤器件性能单一受限,体积较大。团队在本应用领域主要研究选择合适的纳米材料和微纳加工技术,在光纤上实现尺寸的最小化和功能的集成化,为极端环境的传感应用提供可能的解决方案。可以应用于1.最小化光纤探头2.光纤远程照明、传像、传能3.柔性可穿戴光纤健康监测4.结构健康检测5.自动光学视觉微观信息检测系统
南京大学 2021-04-10
锚杆拉力检测与预紧集成装置
本项成果包括能够套在锚杆杆体上的拉力计、支撑座,拉力计的空心活塞柱体正对支撑座的顶壁,支撑座为中空套筒结构,在支撑座的顶壁上加工有杆体通孔,在支撑座的侧壁上加工有扳手活动孔。通过在支撑座的侧壁开设扳手活动孔,在支撑座与拉力计的空心活塞柱体之间还可设置开口加厚垫,当预紧时锚杆末端的松动螺母时,扳手可以直接通过该活动孔转动螺母,使锚杆得以预紧,预紧力数值显示在锚杆拉力计的压力表上,螺母紧固后可继续拉拔锚杆,再次紧固螺母,直至达到所需预紧力。当锚杆拉力计的空心活塞柱体行程不够时,通过增减开口加厚垫补充空心活塞柱体行程。
西安科技大学 2021-04-11
小城镇高效污泥处理集成技术
研发了小城镇城市污泥消化处理的 集成技术。主要包含两类集成技术,即内循环污泥浓缩消化(ICSTD)和两相 一体式污泥浓缩化反应器(TISTD) ICSTD反应器提出了污泥浓缩消化一体化的新工艺,实现了污泥在浓缩过 程中消化,在消化过程中浓缩,且浓缩功能与消化功能相互促进,是污泥浓缩 与污泥厌氧消化领域的一个突破。ICSTD反应器启动时间快。高负荷启动时, 35天启动完成,比普通厌氧消化反应器提前了至少10天。ICSTD反应器的消 化效果良好,具有较好的浓缩效果。具有较强的抗冲击负荷能力温度对ICSTD 反应器的影响较大。通过试验研究表明,在中温条件污泥的厌氧消化效果明显 好于在常温条件下,中温下有机物去除率在54. 1%〜86. 3%,常温下有机物去除 率在36. 5%〜72. 8%。TISTD反应器外反应室一定的推流形态的存在有利于降低出水的SS值,确 保外反应室的浓缩效果;内反应室的完全混合流形态有利于厌氧菌群与剩余污泥 基质的接触,强化了传质过程,提高了反应器的处理效能。在中温条件(33~37。0 下,反应器运行状况良好,在最优投配率30%的时候,即水力停留时间为3. 33 天时,当进泥含水率在99. 43^99. 69%之间,进泥VS/TS在0. 62~0. 77之间,排 泥含水率在89. 52%~93. 51%之间,排泥VS/TS在0. 21~0. 28范围,排水SS在 0. 15~0.6g/L之间。其浓缩效果、消化效果优于普通浓缩池、消化池。TISTD反 应器在一定程度上实现了产酸相和产甲烷相的分级;生物相检测结果表明,运行 起来后反应器内厌氧生物种类繁多,内反应室形态上类似产甲烷丝菌和甲烷八叠 球菌的厌氧菌较多。因此,消化效果良好,经济效益显著。
重庆大学 2021-04-11
电力系统集成网络保护
电气工程学院一直致力于电力系统集成网络保护系统的研究,经过多年的努力,在网络构架、平台开发和算法研究方面有了长足的进步。本系统可应用于110kV及以下配电网系统,为变电站网络化和自动化服务。整个系统的特色在于:    1)信息资源丰富,融合度高,与数字化变电站技术接轨;    2)三层通信硬件平台,多线程设计软件平台;    3)通用开放平台、网络化应用体系和交互界面;    4)多重确认高可靠性、区域在线互动能力、即插即用式调度策略;    5)模块化设计保护功能,新式保护算法实验平台。
北京交通大学 2021-04-13
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