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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件
1.痛点问题 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义,而如何对肿瘤单细胞数据进行全面深入的分析,还面临很多挑战。 肿瘤样本具有其独有的特点,在样本制备和单细胞分离过程中,其细胞应激反应大、坏死细胞多,为肿瘤单细胞数据的质量控制带来了挑战; 肿瘤单细胞数据分析有其独有的核心问题,比如复杂的微环境和高度的异质性,而如何充分考虑这些难点,并从信息学的视角进行深入研究,有待建立全面、自动的分析框架; 肿瘤单细胞数据的分析,对科研人员的编程能力和分析经验要求很高,亟需自动化、智能化的软件平台来降低数据分析的门槛,提高研究的效率。 2.解决方案 本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括: 1)针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案; 2)涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析); 3)创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法; 4)从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性; 5)提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法; 6)构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。 基于本项成果产生的产品、服务或解决方案: 1)自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer; 2)针对软件使用和分析结果解读的服务; 3)针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。 3、合作需求 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。
清华大学 2022-08-30
肽抗生素开发与研究 ——利用大肠杆菌表达兔防御
项目研究背景 :抗菌肽是在某些诱导条件下,由动植物体内防御系统 产生的对抗外源性病原体致病作用的防御性阳离子多肽类抗菌活性物质。 抗菌肽具有特殊的抗菌机理和广谱高效的抗菌活性。天然抗菌肽获取困 难,主要是采用基因融合的方式进行外源表达。利用生物技术表达、改造 抗菌肽,提高抗菌肽抗菌活性,从而开发出对人体和环境安全无毒的食品 防腐剂和农药产品,还可开发出一类新的抗生素产品。 技术性能 :本研究在国内首次报道利用大肠杆菌
南昌大学 2021-04-14
性能的柔性混合电子一体化设计与制造平
依托“索维奇智能新材料诺奖实验室”,解决了柔性印刷电子材料耐高温、阻燃、抗弯折等安全可靠性的问题,突破了新型复合性能印刷墨水的大规模制备技术,实现了功能化柔性印刷电子器件的快速制备,形成了基于材料-工艺-结构-性能的柔性混合电子一体化设计与制造平台。与传统电子制造技术相比,具有大面积制造、柔性化、绿色环保、低成本等技术优势。成果已应用于可穿戴健康监测集成部件、柔性纸基RFID芯片等。
哈尔滨工业大学 2021-04-14
基于IP库的通用MEMS器件可视化仿真与验证工具
项目的背景及目的 迄今为止,集成电路的模拟、仿真直至评测已有了非常完善的工具软件;并已成为设计过程的重要组成部分;对设计的成功、可靠、高效都已起到决定性作用。而对MEMS而言,还相差甚远,这和MEMS发展的成熟程度有着直接关系。当然,这并不意味着MEMS不需要这样的工具和系统。相反,由于MEMS的功能多样、加工复杂、分析困难、设计周期长、成本高等。特别需要一个能包括运动仿真、评测在内的设计工具和系统。这是当前推动MEMS发展的当务之急。
南开大学 2021-04-14
一种时序网络与时序数据的多态聚类方法
本发明提出了多态聚类的概念,并公开了一种时序网络与时序 数据的多态聚类分析方法。多态聚类是一种针对时序网络或时序数据, 以多种标准作为相似性度量指标的聚类分析方法,包括以下步骤:首 先,如果处理对象为时序数据,则只对时序数据加工成特定的形式, 而如果处理对象为时序网络,则通过谱映射的方法把时序网络映射为 特定形式的时序数据。其次建立此时序数据的多态向量,最后,对多 态向量采用改进的同步化聚类方法聚类得到多态聚类结果。
华中科技大学 2021-04-14
山羊肉质及快长、高繁殖性能的研究与推广
根据羊场特定的饲养管理条件及影响因素,建立了种羊的 BLUP 育种模型,用于估测肉用羊早期生长性状的育种值。通过检测分析影响山羊肉质风味和鲜味的硫胺素、肌苷酸、胆固醇等指标在肉中的表达水平,建立了依据肉品质进行的个体选择模型。主要技术(性能)指标:通过该成果的应用,可使得山羊的初生重、周岁重、产羔数、及屠宰率等性能指标达到一定的提高。
扬州大学 2021-04-14
高抗性淀粉转基因水稻新品系的选育与功能分析
该成果通过对水稻胚乳中与支链淀粉合成相关酶基因表达的转基因调控,控制稻米中支链淀粉的合成,相对提高直链淀粉含量,选育获得了多个富含抗性淀粉的转基因水稻新品系,其中的直链淀粉含量超过 50%、抗性淀粉含量最高可达 15%。培育的高抗性淀粉稻米其抗性淀粉含量最高可达 15%,能够明显改善动物肠道健康,消除糖尿病病人餐后的高血糖现象。
扬州大学 2021-04-14
典型石化装置转动设备故障诊断与维护检修管理平台
成果简介: 以典型石化装置的转动设备系统作为研究对象,建立转动设备故障诊断与维护检修管理平台,实现对设备可靠性分析、FMEA(失效模式与影响分析)以及维护检修管理。通过本项目实施,加强对转动设备检维修工作的指导,实现基于时间的预防性检维修模式向基于状态和基于风险分析的预知性检维修模式的转变。系统主要包括设备信息管理、设备运维管理、项目管理、可靠性分析、F
南京工业大学 2021-01-12
用于内河航道的箱体与插板组合结构的生态护岸方案
通过预制透水钢筋混凝土箱体与插板的组合型结构,相邻箱体插板连接、插板固定于箱体两侧外壁中部卡槽,有效消减船行波,节约施工材料,降低工程造价,实现生态和经济效益。集中解决限制性航道生态安排防护能力弱,生态型护岸施工麻烦,造价偏高的文图,
东南大学 2021-04-13
三维平行胶原纤维-蚕丝支架及其制备方法与应用
本发明提供了一种三维平行胶原纤维-蚕丝支架及其制备方法,所述支架由编织蚕丝基架和包覆在编织蚕丝基架上、下方表面的平行胶原纤维层构成,所述的编织蚕丝基架是由蚕丝编织成网孔大小为0.25~25mm2的网片结构,所述平行胶原纤维的孔隙直径大小为10~300um,所述的编织蚕丝是去除了丝胶蛋白的编织蚕丝;所述支架可作为生物支架应用于肌腱/韧带的修复;本发明三维平行胶原纤维-蚕丝支架制作方法简单,生物相容性好,力学性能佳,支架的拓扑结构与肌腱/韧带相似,能够促进其表面生长的干细胞向肌腱/韧带分化,促进肌腱/韧带再生。
浙江大学 2021-04-13
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