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基于新一代测序的生物信息云平台及其在科研和医疗健康领域的应用
1 项目简介本项目建立的生物云平台,以基于 Web 的方式提供服务,用户可以轻松快速获取服务,国内外普遍缺乏成熟的技术,标准和平台。我们首次把独具特色的机器学习模型预测算法与最新的高通量测序方法( non-polyA RNA-seq) 相结合。我们的研究对象为长链非编码 RNA( non-PolyA),目前国际上还很少有人通过高通量测序技术对疾病的 lncRNA 进行全面预测分析和功能分类。随着测序速度不断提高,测序成本不断降低,本项目将来可以发展为面向人民大众的个性化医疗服务的平台。 图 1 生物医学信息云平台的产业化方向 http://www.incrna.org图 2 生物医学信息云平台的应用程序一览 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本项目使用的核心技术“基于整合性生物信息云计算和新一代测序技术( incRNA) 的非编码基因组疾病(如癌症)检测技术平台”已经通过软件查新认证( 20121022044750914)。正在准备申请国家版权局软件著作权登记证书。2 效益分析( 1)随着新一代高通量测序技术的发展,生物信息数据爆炸式增长,数据解读成为生物医学研究和临床应用的巨大问题,我们团队依托清华大学生命学院鲁志实验室在生物信息学,尤其是在 lncRNA 领域的技术专长开发的云计算平台将为广大科研工作和和临床用户提供可靠的数据分析云服务,提高他们的科研效率,为科学的发展做出贡献。 ( 2)我们团队通过与中国人民解放军总医院,上海肝胆医院等十多家临床单位的合作,将为鉴定癌症的早期诊断和药物治疗提供新的靶点,这不仅会增强中国基础临床科学的发展,通过临床应用还会为病患者带来癌症早期诊断、健康管理等个性化医疗服务,这将具有广泛的社会效益。 ( 3)通过我们打造高通量测序数据分析云计算平台和开展以癌症早期检测为主要内容的个性化医疗服务,将为中国培养一批高水平的生物信息数据分析人才,这将增强中国在生物信息学方面的实力。
清华大学 2021-04-13
一周科创资讯 |4月25日-5月1日
本周有哪些高教科创资讯不可错过?
云上高博会 2022-05-01
滴灌用全水溶磷酸二氢铵(5万吨/年)
成果描述:该技术与磷酸二氢钾技术类似,采用湿法稀磷酸为原料,用溶剂萃取磷酸,得到净化稀磷酸,再用氨中和,经过滤、浓缩、结晶得到全水溶MAP。该技术的优点是P2O5萃取率高,原料酸中80 %的P2O5进入到产品中。自动化程度高、产品质量好、可大规模工业化,适合大型磷肥企业,走肥盐结合道路。市场前景分析:磷酸二氢铵主要用作肥料和木材、纸张、织物的防火剂、灭火剂、阻燃剂、玻璃材料、磷酸铁锂材料和基体改进剂,也用于制药和反刍动物饲料添加剂。与同类成果相比的优势分析:产品磷酸二氢铵为白色粒状晶体。磷酸二氢铵含量在99.0 %以上,相对密度1.803,熔点190 °C,易溶于水,1 %水溶液pH值为4.5。国际先进。
四川大学 2021-04-10
KTE5型矿山救援可视化指挥系统及装置
西安科技大学自 2003 年开始就矿山应急救援通信技术和装备着手开始研究,现该成果获安全生产科技成果二等奖 1 项,发明专利 1 项,实用新型专利 4 项,发表论文 12 篇;该成果提供一种可实时监视和直接联络事故现场的先进技术手段;设计了将灾害现场视频 / 音频信号传送至地面指挥部和各级救援指挥中心,地面指挥部和各级救援指挥中心根据灾区情况向救护队员发送救援指令;同时通过互联网,业内专家可直接了解救灾现场的实际,参与救灾决策,实现救灾决策专家化的网络系统。 项目研究成果及转化形成的工矿产品已推广应用于山西大同煤电公司、山东龙口煤电有限公司、中国神华能源神东分公司救护消防大队等矿山救护队取得了一定的经济效益和社会效益。
西安科技大学 2021-04-11
一周科创资讯|1月30日-2月5日
一周高等教育科技创新政策、热点新闻导读
高教科创 2023-02-06
一周科创资讯|5月28日-6月4日
一周高等教育科技创新政策、热点新闻导读
高教科创 2023-06-05
一周科创资讯|9月5日-9月11日
一周高等教育科技创新政策、热点新闻导读
高教科创 2022-09-09
一周科创资讯|2月27日-3月5日
一周高等教育科技创新政策、热点新闻导读
高教科创 2023-03-06
揭示mRNA m5C的序列结构特征和动态变化规律
目前报导的“m5C”位点往往成簇存在于高GC含量区域,对针对NSUN2的RNA干扰不敏感,也无法被m5C抗体所富集,极可能是实验引入的假阳性。根据这一特征,该研究建立了一套新颖的生物信息学计算流程过滤噪音,得以精确地定位mRNA上的m5C。通过进一步分析,该研究发现NSUN2依赖的m5C位点倾向于拥有一个3’富G的基序,通常位于在一个小颈环结构的底部,与其tRNA底物高度一致,揭示了mRNA m5C 序列和结构特征的由来。该研究发现除了NSUN2,NSUN家族其他成员不调控mRNA m5C位点,暗示除了NSUN家族成员,可能存在新的甲基转移酶参与了不依赖于NSUN2 的mRNA m5C位点的催化。通过进一步对7个人类组织于10个小鼠组织的转录组测序分析,分别确认了3212与2498个高置信度位点。结果表明,在不同组织中mRNA m5C位点的数量与甲基化水平有很大差异。在人和小鼠的睾丸、肝脏、心肌和骨骼肌,mRNA上有数百个高置信度的m5C位点,而在其他的一些组织则寥寥可数。另外,这些m5C位点在人和老鼠之间并不保守,说明它们很可能是受到顺式调控(cis-regulation)的。       这项研究开发的方法为mRNA m5C的研究提供了新的工具;其构建的哺乳动物mRNA m5C 精确图谱为发现mRNA上m5C修饰的调控和功能奠定了坚实的基础。奥地利因斯布鲁克医科大学Alexandra Lusser教授在同期撰写的评述文章“Getting a hold on cytosine methylation in mRNA”中,评价张锐教授课题组开发的新计算方法增加了m5C检测的精确度,进一步提供了tRNA甲基化转移酶NSUN2介导mRNA甲基化的令人信服的证据。
中山大学 2021-04-13
双低油菜品种华油杂5号(华皖油1号)
可以量产/n"华油杂5号"是华中农业大学国家油菜改良武汉分中心利用自己的专利技术"油菜细胞核+细胞质雄性不育三系选育方法"对原"华杂4号"的亲本不育系1141A进行遗传改良而选育出的超高产优质抗(耐)病杂交油菜新品种,其不育系为RGCMS-1141A(或986A),恢复系为"恢5900"。"华油杂5号"的不育系RGCMS-1141A具有如下新特点:1.不育性比原不育系1141A更加稳定彻底,微粉较少;2.品质优量,其芥酸含量<1%,硫苷含量<30umol/g;3.不育系的花瓣比原1141
华中农业大学 2021-01-12
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