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基因放疗引起放射性脑损伤相关SNP标志物
放疗是鼻咽癌首选的治疗方式,而放疗引起的放射性脑损伤是鼻咽癌患者最严重的晚期不良反应之 放疗是鼻咽癌首选的治疗方式,而放疗引起的放射性脑损伤是鼻咽癌患者最严重的晚期不良反应之 一。该不良反应往往具有不可逆性,极大地影响患者的生活质量。放射性脑损伤一旦发生,治疗颇为困 一。该不良反应往往具有不可逆性,极大地影响患者的生活质量。放射性脑损伤一旦发生,治疗颇为困 难,因此,对接受放疗的鼻咽癌患者进行放射性脑损伤发病风险预测,对高危个体提前采取针对性的保护措施,实现肿瘤的个体化治疗,显得尤为重要。 本发明公开了DISC1FP1基因上的SNP位点rs10501719作为与肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险相 关的标志物的应用。同时,制备得到一种预测肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险的试剂盒,利用该试 剂盒检测SNP标志物分型,联合患者临床信息可以更加全面准确的评估鼻咽癌患者发生放射性脑损伤的患 病风险。
中山大学 2021-04-10
SARS-CoV-2基因组分析进化和起源的研究
2020年3月8日,安徽师范大学在bioRxiv上上传了一篇题为Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析,作者使用10个新测序的SARS-CoV-2基因组,并结合GISAID数据库中的136个基因组,通过不同的分析方法(如EBSP、错配和中性检测等)研究前三个月数据的遗传变异和统计。 结果显示80个单倍型共有183个突变位点,包括27个简约性信息位点和156个单一位点。对遗传多样性的滑动窗口分析表明,SARS-CoV-2基因组丰度的变化有一定范围,这可以解释目前这种病毒的广泛和高适应性。遗传学分析不支持穿山甲是中间宿主。在最初的单倍型(H14)中,一个患者样本居住在华南海鲜市场附近(约2公里),这表明患者有无意识接触该市场史的可能性很高。然而,基于这个线索,也无法准确断定这个市场是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外,从这个市场收集的16个基因组,包含10个单倍型,表明市场在短期内出现循环感染,这可能导致武汉和其他地区爆发SARS-CoV-2。EBSP结果显示,第一个估计的扩展日期从2019年12月7日开始,这表明SARS-CoV-2的传染可能在11月中下旬开始。
安徽师范大学 2021-04-10
VvSUC27基因在促进植物摄取外界蔗糖中的应用
本发明涉及基因工程技术领域,具体公开了VvSUC27基因(GenBank登录号:AF021810)在促进植物摄取外界蔗糖中的应用以及其在促进植物生长(尤其是在弱光环境或无光环境中生长)中的应用。本发明通过过表达VvSUC27基因,促进了植物摄取外界蔗糖,同时可使转基因植物出现快速生长的表型,并且可以在微光甚至使无光下快速生长,证实了该基因的一个新的功能应用。VvSUC27基因的克隆和转基因的应用,有望应用于肉质根或块根植物及花卉等植物的培育中,使得植物即使在无光下也能快速生长,有利于节约光能减少能源的浪费。
中国农业大学 2021-04-11
预测重型肝炎病情基因的甲基化检测方法及试剂
本发明涉及预测重型肝炎病情基因的甲基化状态检测的方法及试剂,提取病人外周血单个核细胞 DNA 进行亚硫酸氢盐修饰后,分别用谷胱甘 肽 S-转移酶 M3 甲基化(M)特异性和非甲基化(U)特异性引物对进行甲基化 特异性聚合酶链式反应,根据扩增产物判断其甲基化状态,有助于临床医生判 定重型肝炎患者的病情和指导治疗。
山东大学 2021-04-13
口蹄疫与伪狂犬病二价基因工程疫苗
研发阶段/n口蹄疫(FMD)是引起的人及偶蹄动物共患的一种烈急性、高度接触性、发热性传染病。FMD在世界上许多国家流行,造成重大的经济损失和政治影响。口蹄疫病毒(FMDV)属于小RNA病毒科(Picornaviridae),口蹄疫病毒属(Aphthovirus),该病毒为单股正链小RNA病毒,基因组长约8500个核苷酸,主要由结构基因(P1区)和非结构基因(P2、P3区)等构成。该发明具体涉及一种新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重组伪狂犬病弱毒疫苗株,该毒株属于猪伪狂犬病毒:Pseudorabi
华中农业大学 2021-01-12
开发了一个在线的个人基因组解码平台
一直以来,自从第二代高通量测序技术开发至今,基因组测序成本已经降低到3000美元,我们马上就要来到1000 dollar genome 的时代。然而从复杂冗余的基因序列中解读出与疾病相关,与药物相关的重要信息,已经成为当前生物信息学已经成为生物信息学中最重要的挑战。面对该挑战,程容海等人开发了一个在线的个人基因组解码平台(Virtual Pharmacist)。它可以支持分析目前主流的生物信息学数据格式,并且通过该软件后台的数据库和算法,挖掘出个人基因组中的基因突变(Single Nucleotide Polymorphism)与药物反应的关联性分析。该平台只需要用户上传SNP数据文件,或者是高通量测序文件便可以自动完成包括生物信息学分析,基因组信息解读(genomic interpretation),并最终呈现给用户一份详细的,用户友好的,关于195种药物反应的基因检测报告。
南方科技大学 2021-04-13
家蚕滞育品种的低温和早期浸酸催青转基因方法
一种家蚕滞育品种的低温催青转基因方法。用特殊的催青条件改变家蚕滞育品种下一代蚕卵的化性,使 特殊的催青条件下获得的当代家蚕滞育品种蚕蛾交配,产下非滞育的下一代蚕卵,最后参照非滞育家蚕卵胚 胎显微注射的转基因方法进行转基因,从而巧妙地突破家蚕滞育品种转基因技术的障碍并有效制作转基因 蚕。该方法直接采用生产中普遍使用的实用性家蚕滞育品种作为原始材料,可以避免漫长而烦琐的育种过 程,直接利用转基因技术创造出各种性状优良的新的特殊家蚕品种,可大大缩短育种的周期,节约大量的人 力和物力。一种家蚕滞育品种的早期浸酸转基因方法,利用在蚕卵胚胎发育至胚带形成之前的一定时间内, 即产卵后2个半小时之前对家蚕滞育卵进行盐酸的浸泡处理,随后对处理解除滞育的蚕卵进行風台显微注射, 催青孵化获得的GO代家蚕的饲养至化蛾,它们的自交或回交产生G1代,通过荧光标记筛选,从而有效制作 转基因家蚕。该方法直接采用生产中普遍使用的实用性家蚕滞育品种作为原始材料,可以避免漫长而烦琐的 育种过程,直接利用转基因技术创造出各种性状优良的新的特殊家蚕品种,可大大缩短育种的周期,节约大 量的人力和物力。
西南大学 2021-04-13
创制转基因技术中带有安全筛选标记的安全转化载体
选择标记转基因作物已成为近年来植物基因工程技术研究的重点之一,随着转基因作物产品的商品化,转基因植物的生物安全性受到公众越来越多的关注,尤其是目前抗生素标记基因在植物遗传转化过程中的广泛应用,使人们对这些标记基因可能带来的潜在危害性心存疑虑,抗性标记基因的存在严重地阻碍了转基因植物的商品化进程和转化技术本身的有效性。 本项目培育的无抗生素标记基因(可视化标记基因)在建立高效、安全、规模化的转基因作物技术体系方面取得突破,以紫色幼芽作为可视筛选标记代替抗生素筛选标记,构建了新型转化载体
南开大学 2021-04-14
Chordin A基因在湘军金鱼双尾性状中的作用机制研究
本试验通过石蜡切片技术对湘军金鱼性腺组织进行切片观察,发现9月龄的雄性湘军金鱼精巢中有大量的成熟精子,11月龄的雌性湘军金鱼卵巢中有成熟卵子。 一、项目进展 创意计划阶段 二、负责人及成员 姓名 学院/所学专业 入学/毕业时间 洪迪珊 湖南师范大学生命科学学院/生物科学 2018/2022 陈雨薇 湖南师范大学生命科学学院/生物技术 2018/2022 刘雨欣 湖南师范大学生命科学学院/生物科学 2019/2023 马彤彤 湖南师范大学生命科学学院/生物科学 2019/2023 黄志娴 湖南师范大学生命科学学院/生物科学 2018/2022 三、指导教师 姓名 学院/所学专业 职务/职称 研究方向 刘少军 湖南师范大学生命科学学院/鱼类遗传育种 教授 鱼类遗传育种 王余德 湖南师范大学生命科学学院/鱼类遗传育种 讲师 鱼类遗传育种 四、项目简介 为探究湘军金鱼的胚胎发育过程、能育性、倍性以及Chordin A基因在湘军金鱼的双尾性状形成过程中的作用,本试验通过石蜡切片技术对湘军金鱼性腺组织进行切片观察,发现9月龄的雄性湘军金鱼精巢中有大量的成熟精子,11月龄的雌性湘军金鱼卵巢中有成熟卵子。试验通过PHA体内诱导肾细胞制片法对湘军金鱼染色体数目进行统计,发现其染色体数目为100条。试验通过PCR技术获得了Chordin A基因全长,并对其进行生物信息学分析发现Chordin A基因全2634 bp,其中碱基A共618个,占比23.46%、碱基C共692个,占比26.27%、碱基G共756个,占比28.70%、碱基共568个,占比21.56%。碱基“G+C”占比 54.97%,碱基“A+T”占比45.03%。试验对湘军金鱼不同组织进行Chordin A基因的荧光定量PCR试验,发现Chordin A基因在尾鳍表达量最高。项目成员在进行科学探究的同时深挖湘军金鱼经济价值,项目组成员多次赴双峰县、龙田镇玉坪村等地进行实地调研,我们发现观赏鱼行业是朝阳行业,发展迅猛;与此同时湖南省休闲渔业来势喜人,但是观赏鱼普遍鱼病高发,变异物种破坏生态等问题。本项目借助湘军金鱼这一优质鱼种,通过互联网+农副产品的销售模式,变单一销售模式为多形式利益联合,拉动当地的经济增长。我们与村落达成了长期合作的关系。湘军金鱼作为优质观赏鱼备受消费者青睐。
湖南师范大学 2022-08-10
转基因沉默延长香石竹切花品种的瓶插寿命技术
可以量产/n由于香石竹是乙烯敏感植物,在其采后贮藏运输期间需花费大量的人力物力进行保鲜处理。传统的保鲜方法多采用含有乙稀抑制剂(如AVG、GVG、AOA)和乙稀拮抗剂(如AgNO3、STS、2,5-NBD)的保鲜剂,或是利用冷藏、气调等措施,不仅成本高,效果也不尽人意,且易造成环境污染。本成果运用转基因沉默理论,通过基因工程的方法抑制香石竹内源乙烯的生物合成,从而达到延长香石竹自然保鲜期的目的,进而达到有效调节贮运和香石竹市场供应之目的。技术水平:利用转基因技术获得了瓶插寿命明显延长的香石竹切花'M
华中农业大学 2021-01-12
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